117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1566 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1566  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 420 aa  855    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2173  TPR repeat-containing protein  42.42 
 
 		 421 aa  345  1e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1762  TPR domain-containing protein  44.09 
 
 		 429 aa  344  2e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0497958  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1932  peptidase M, neutral zinc metallopeptidase, zinc-binding site  43.2 
 
 		 426 aa  340  4e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000295062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3024  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  41.84 
 
 		 412 aa  326  5e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1259  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.9 
 
 		 412 aa  319  6e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.255414  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4277  TPR repeat-containing protein  29.21 
 
 		 468 aa  127  4.0000000000000003e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0190966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4269  hypothetical protein  28.3 
 
 		 585 aa  71.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.443818  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0571  hypothetical protein  28.64 
 
 		 408 aa  70.9  0.00000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.042047  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2418  hypothetical protein  31.22 
 
 		 293 aa  70.5  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000313071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4403  hypothetical protein  28.73 
 
 		 530 aa  70.1  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4424  hypothetical protein  28.73 
 
 		 546 aa  70.1  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_510  hypothetical protein  28.25 
 
 		 408 aa  67  0.0000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000331175  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4423  hypothetical protein  27.88 
 
 		 553 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2203  hypothetical protein  35.25 
 
 		 286 aa  65.9  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.691388  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2470  hypothetical protein  25.57 
 
 		 279 aa  61.6  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000051933  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0071  hypothetical protein  24.53 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  0.0144499 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0545  hypothetical protein  31.32 
 
 		 408 aa  60.5  0.00000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.306589  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0516  TPR repeat-containing protein  29.2 
 
 		 673 aa  58.2  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000776603  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4208  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.49 
 
 		 1001 aa  58.9  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0104266  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3174  TPR domain-containing protein  24.18 
 
 		 544 aa  58.5  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.331835  normal  0.379297 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3295  hypothetical protein  26.72 
 
 		 294 aa  55.5  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1905  hypothetical protein  27.05 
 
 		 437 aa  54.7  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0772428  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  29.08 
 
 		 1737 aa  53.9  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.74 
 
 		 639 aa  53.9  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3216  TPR repeat-containing protein  29.1 
 
 		 643 aa  53.1  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000674385  hitchhiker  0.00000466075 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2344  hypothetical protein  28.57 
 
 		 268 aa  52.4  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000027404  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3253  TPR domain-containing protein  36.59 
 
 		 591 aa  51.6  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000563369  normal  0.0756352 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  22.63 
 
 		 1127 aa  52.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4127  hypothetical protein  25.89 
 
 		 456 aa  51.2  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0616  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.36 
 
 		 647 aa  51.2  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  6.1691e-34 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  26.85 
 
 		 1979 aa  50.8  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3048  hypothetical protein  27.86 
 
 		 462 aa  50.4  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1381  hypothetical protein  31.9 
 
 		 410 aa  50.4  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.212369  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.61 
 
 		 645 aa  50.4  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000607684  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  23.36 
 
 		 292 aa  50.1  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2405  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  26.24 
 
 		 1078 aa  49.7  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.666802  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3191  TPR domain-containing protein  27.61 
 
 		 638 aa  49.3  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2957  TPR repeat-containing protein  26.87 
 
 		 297 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.338311  normal  0.060469 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  26.11 
 
 		 1827 aa  49.3  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  24.65 
 
 		 564 aa  49.3  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  26.57 
 
 		 568 aa  49.3  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3161  TPR repeat-containing protein  26.87 
 
 		 297 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3116  TPR domain-containing protein  29.21 
 
 		 606 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.56398  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0757  hypothetical protein  29.21 
 
 		 606 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0856  sugar transporter superfamily protein  30 
 
 		 198 aa  48.5  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0531  TPR repeat-containing protein  28 
 
 		 287 aa  48.5  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.259397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0084  TPR domain-containing protein  29.21 
 
 		 606 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1506  TPR domain-containing protein  29.21 
 
 		 606 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000406366  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 562 aa  48.5  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0573  TPR repeat-containing protein  29.21 
 
 		 606 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.054966  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0589  TPR repeat-containing protein  29.21 
 
 		 606 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0397506  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2934  TPR domain-containing protein  29.21 
 
 		 606 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152208  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0164  TPR repeat-containing protein  22.39 
 
 		 963 aa  48.5  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0451  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.78 
 
 		 251 aa  48.9  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000076324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2796  TPR repeat-containing protein  26.77 
 
 		 621 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.669916 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2413  tetratricopeptide TPR_2  39.13 
 
 		 307 aa  48.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  25.71 
 
 		 4079 aa  48.1  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2348  hypothetical protein  26.01 
 
 		 582 aa  47.4  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.119117  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0468  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 119 aa  47.8  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00208252 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0318  TPR repeat-containing protein  30.5 
 
 		 613 aa  47.8  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0135252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1398  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 484 aa  47.8  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 		 1276 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0478  TPR domain-containing protein  29.21 
 
 		 606 aa  47.4  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  26.14 
 
 		 1694 aa  47.4  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  22.39 
 
 		 344 aa  47.4  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 409 aa  47.4  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  26.71 
 
 		 573 aa  47.4  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.71 
 
 		 565 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2615  TPR domain-containing protein  29.47 
 
 		 196 aa  45.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2073  TPR domain-containing protein  26.15 
 
 		 417 aa  46.2  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0409184  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  22.14 
 
 		 927 aa  45.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0384  TPR repeat-containing protein  31.67 
 
 		 592 aa  46.2  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.315529  normal  0.0233306 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3286  hypothetical protein  28.7 
 
 		 275 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.770158  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  22.88 
 
 		 1486 aa  46.2  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3348  hypothetical protein  28.7 
 
 		 275 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160787  normal  0.0858239 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0689  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 		 632 aa  45.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000734837  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0996  TPR repeat-containing protein  29.69 
 
 		 499 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0468556 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  25.2 
 
 		 436 aa  45.1  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3232  hypothetical protein  32.14 
 
 		 609 aa  45.8  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0129967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2700  hypothetical protein  25.74 
 
 		 471 aa  45.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0219008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  21.64 
 
 		 602 aa  45.4  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 409 aa  45.1  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3469  hypothetical protein  28.79 
 
 		 474 aa  45.8  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.068421  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4342  Tetratricopeptide domain protein  31.78 
 
 		 616 aa  45.8  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118826  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1107  TPR domain protein  30.3 
 
 		 575 aa  44.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2907  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.68 
 
 		 471 aa  45.1  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0992  TPR repeat-containing protein  29.29 
 
 		 464 aa  45.1  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.37346  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1759  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 		 207 aa  44.7  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4611  TPR domain-containing protein  32.11 
 
 		 615 aa  45.1  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  26.92 
 
 		 1192 aa  44.7  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2762  TPR domain protein  27.68 
 
 		 603 aa  44.7  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2318  TPR repeat-containing protein  21.48 
 
 		 245 aa  44.7  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4437  glycosyl transferase family protein  29.51 
 
 		 1061 aa  44.3  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1078  TPR repeat-containing protein  27.33 
 
 		 423 aa  44.3  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.327406  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  26.49 
 
 		 804 aa  44.3  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.96 
 
 		 586 aa  44.3  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  25.33 
 
 		 573 aa  43.9  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4130  hypothetical protein  28.78 
 
 		 613 aa  43.9  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.533551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  23.53 
 
 		 745 aa  43.9  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>