More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2163 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_2163  Na+/solute symporter  100 
 
 		 459 aa  889    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233045 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1333  Na+/solute symporter  46.19 
 
 		 466 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000174463  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1337  Na+/solute symporter  40.53 
 
 		 461 aa  280  5e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.833142  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0688  Na+/solute symporter  35.73 
 
 		 464 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1525  Na+/solute symporter  27.93 
 
 		 475 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  25.35 
 
 		 474 aa  140  6e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1057  Na+/solute symporter  24.62 
 
 		 476 aa  123  6e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  25.6 
 
 		 483 aa  120  3e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0688  Na+/solute symporter  27.08 
 
 		 471 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.217002  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0563  Na+/solute symporter  26.95 
 
 		 476 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.379209 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0645  Na+/solute symporter  26.42 
 
 		 472 aa  117  6e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.646028  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3710  Na+/solute symporter  26.35 
 
 		 471 aa  117  6e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3539  Na+/solute symporter  26.35 
 
 		 471 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0326627  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5962  Na+/solute symporter  27.19 
 
 		 472 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  23.83 
 
 		 472 aa  114  5e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6955  Na+/solute symporter  26.24 
 
 		 472 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.269545  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3347  putative osmoregulated proline transporter  26.93 
 
 		 486 aa  108  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1533  Na+/solute symporter  26.24 
 
 		 472 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6296  Na+/solute symporter  26.24 
 
 		 472 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.957255  normal  0.770519 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6434  Na+/solute symporter  24.94 
 
 		 473 aa  106  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00922487 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2709  Na+/solute symporter  25.52 
 
 		 483 aa  104  4e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3816  Na+/solute symporter  26.45 
 
 		 459 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.101715 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00590  Sodium:solute symporter  25 
 
 		 460 aa  101  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000130807  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4030  Na+/solute symporter  25.77 
 
 		 459 aa  100  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.110038  normal  0.104242 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2570  Na+/solute symporter  24.71 
 
 		 464 aa  100  5e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000435173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8130  Na+/solute symporter  24.71 
 
 		 474 aa  100  8e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.580887  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1454  Na+/solute symporter  26.65 
 
 		 459 aa  100  8e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0563954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1387  Na+/solute symporter  25.77 
 
 		 459 aa  99.8  9e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.557678 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4524  Na+/solute symporter  25.77 
 
 		 459 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3294  Na+/solute symporter  26.48 
 
 		 469 aa  98.2  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241683  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1298  Na+/solute symporter  26.62 
 
 		 472 aa  95.9  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.537823 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3921  sodium:solute symport protein  25 
 
 		 463 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46110  putative sodium:solute symport protein  24.94 
 
 		 463 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0497302  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4125  Na+/solute symporter  22.93 
 
 		 479 aa  91.3  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0765871  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2710  Na+/solute symporter  26.12 
 
 		 462 aa  91.3  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.308556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4898  solute/sodium symporter (SSS) family protein  22.84 
 
 		 489 aa  91.3  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4721  Na+/solute symporter  25.4 
 
 		 463 aa  90.5  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0353  Na+/solute symporter  24.13 
 
 		 479 aa  89  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.606466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0378  sodium:solute symporter  23.63 
 
 		 461 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5121  Na+/solute symporter  24.66 
 
 		 462 aa  88.2  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0338  Na+/solute symporter  23.78 
 
 		 479 aa  87.4  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0154  Na+/solute symporter  24.89 
 
 		 531 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.535073  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03760  putative sodium:solute symporter  23.57 
 
 		 461 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188515  normal  0.0159939 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5457  Na+/solute symporter  22.48 
 
 		 482 aa  85.1  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.692749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0800  Na+/solute symporter  22.47 
 
 		 483 aa  85.1  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2325  Na+/solute symporter  24.47 
 
 		 489 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00258865  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0871  Na+/solute symporter  22.22 
 
 		 482 aa  84.3  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.857902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0718  Na+/solute symporter  22.53 
 
 		 486 aa  84.3  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07099  hypothetical protein  25.39 
 
 		 518 aa  83.2  0.000000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4206  Na+/solute symporter  22.95 
 
 		 490 aa  83.2  0.000000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153775  normal  0.0109856 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1569  hypothetical protein  23.15 
 
 		 468 aa  82  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4843  SSS sodium solute transporter superfamily  25.94 
 
 		 544 aa  81.6  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001019  proline/sodium symporter PutP  25.78 
 
 		 497 aa  81.6  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0367  Na+/solute symporter  26.15 
 
 		 446 aa  81.3  0.00000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.101074  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06350  hypothetical protein  23.55 
 
 		 506 aa  79.3  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0212  sodium/solute symporter  23.55 
 
 		 475 aa  78.6  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.200787 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5240  Na+/solute symporter  22.07 
 
 		 460 aa  78.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0375  Na+/solute symporter  22.59 
 
 		 478 aa  79  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.197469 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0463  sodium/solute symporter transmembrane protein  21.76 
 
 		 479 aa  77.8  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3406  Na+/solute symporter  21.67 
 
 		 461 aa  78.2  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05410  Sodium:solute symporter  24.25 
 
 		 542 aa  77  0.0000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000184365  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0171  SSS sodium solute transporter superfamily  21.12 
 
 		 520 aa  76.6  0.0000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0745729 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1650  SSS sodium solute transporter superfamily  25.97 
 
 		 483 aa  76.6  0.0000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.888495  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0436  Na+/solute symporter  22.84 
 
 		 478 aa  76.3  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0355  Na+/solute symporter  25.07 
 
 		 492 aa  75.5  0.000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0089  Na+/solute symporter  24.86 
 
 		 496 aa  75.5  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000762337  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2949  Na+/solute symporter  25.15 
 
 		 500 aa  75.1  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0128221  hitchhiker  0.000189844 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0122  Na+/solute symporter  23.09 
 
 		 449 aa  75.5  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00309864  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0575  Na+/solute symporter  26.27 
 
 		 479 aa  75.5  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000227559  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0190  Na+/solute symporter  20.22 
 
 		 471 aa  74.3  0.000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0470055  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3448  Na+/solute symporter  22.93 
 
 		 495 aa  73.9  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2906  Na+/solute symporter  25.56 
 
 		 463 aa  73.6  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0041  sodium/pantothenate symporter  23.33 
 
 		 468 aa  73.6  0.000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.3030600000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4155  Na+/solute symporter  21.61 
 
 		 515 aa  73.2  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.128874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1817  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.14 
 
 		 484 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0882  Na+/solute symporter  21.05 
 
 		 500 aa  70.9  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.984718  normal  0.413071 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0309  Na+/solute symporter  22.3 
 
 		 510 aa  70.9  0.00000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1620  Na+/solute symporter  23.67 
 
 		 460 aa  70.9  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0163738 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0695  Na+/solute symporter  21.16 
 
 		 492 aa  70.1  0.00000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.921144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1081  sodium/proline symporter  24.57 
 
 		 498 aa  68.6  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000772394  unclonable  0.00000000000701401 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0734  sodium/proline symporter  24.59 
 
 		 492 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0924  twin-arginine translocation pathway signal  21.57 
 
 		 452 aa  66.6  0.0000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.839391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3036  sodium/proline symporter  23.09 
 
 		 488 aa  66.2  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000692388  normal  0.0245093 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00679  sodium/glucose cotransport protein  23.76 
 
 		 592 aa  65.5  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0305497  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0864  hypothetical protein  21.85 
 
 		 524 aa  65.5  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.983965  normal  0.0488094 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1465  sodium/proline symporter  23.9 
 
 		 492 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  22.7 
 
 		 537 aa  65.1  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.814033  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1221  sodium/proline symporter  23.76 
 
 		 492 aa  64.7  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2834  Na+/solute symporter  20.22 
 
 		 543 aa  64.3  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00723472  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1619  sodium/proline symporter  22.57 
 
 		 483 aa  63.2  0.000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000146301  decreased coverage  0.00000122936 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0801  SSS sodium solute transporter superfamily  23.28 
 
 		 487 aa  62.4  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  20.31 
 
 		 482 aa  62.4  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0964  Na+/solute symporter  22.6 
 
 		 508 aa  62  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2435  sodium/proline symporter  22.63 
 
 		 483 aa  61.6  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.015008  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2384  SSS sodium solute transporter superfamily  22.28 
 
 		 530 aa  60.8  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0846  Na+/solute symporter  23.53 
 
 		 507 aa  60.8  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1242  sodium/proline symporter  22.76 
 
 		 491 aa  60.8  0.00000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2608  sodium/proline symporter  22.16 
 
 		 483 aa  60.5  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0498264  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3621  SSS sodium solute transporter superfamily  22.1 
 
 		 596 aa  60.1  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.434287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  22.78 
 
 		 551 aa  59.7  0.00000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>