234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1991 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1991  CdaR family transcriptional regulator  100 
 
 		 403 aa  779    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540017  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1642  putative transcriptional regulator, PucR family  51.59 
 
 		 393 aa  371  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.275459  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14120  transcriptional regulator, CdaR family  49.61 
 
 		 397 aa  358  7e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.261126  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2149  transcriptional regulator, CdaR  55.14 
 
 		 408 aa  356  3.9999999999999996e-97  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2948  putative transcriptional regulator, PucR family  52.63 
 
 		 420 aa  343  4e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0167209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6808  putative transcriptional regulator, PucR family  50.12 
 
 		 421 aa  342  5e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2368  putative PucR family transcriptional regulator  52 
 
 		 425 aa  341  1e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00862332 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3509  putative transcriptional regulator, PucR family  52.15 
 
 		 392 aa  339  5.9999999999999996e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1514  putative transcriptional regulator, PucR family  50 
 
 		 419 aa  338  7e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0197746 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0879  hypothetical protein  53.63 
 
 		 384 aa  338  9e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0278062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4807  putative transcriptional regulator, PucR family  49.47 
 
 		 386 aa  332  8e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.525155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7053  transcriptional regulator, CdaR  53.97 
 
 		 404 aa  332  9e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2204  putative transcriptional regulator, PucR family  49.87 
 
 		 414 aa  330  2e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000832377 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1972  hypothetical protein  53.08 
 
 		 373 aa  327  3e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3377  hypothetical protein  53.91 
 
 		 473 aa  326  5e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.541372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3619  PucR family transcriptional regulator  53.65 
 
 		 408 aa  324  2e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000689812 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2134  putative transcriptional regulator, PucR family  53.93 
 
 		 394 aa  319  3.9999999999999996e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1808  putative transcriptional regulator, PucR family  51.06 
 
 		 397 aa  318  7.999999999999999e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.583872  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2465  hypothetical protein  49.47 
 
 		 426 aa  318  2e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00557093  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09330  hypothetical protein  46.03 
 
 		 400 aa  303  4.0000000000000003e-81  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.484292  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10300  regulator of polyketide synthase expression  48.68 
 
 		 413 aa  293  3e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.10355 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3342  putative transcriptional regulator, PucR family  51.94 
 
 		 425 aa  291  1e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.455149  normal  0.209688 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1328  putative transcriptional regulator, PucR family  48.8 
 
 		 393 aa  289  7e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3480  regulator of polyketide synthase expression-like  43.65 
 
 		 539 aa  289  8e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12040  transcriptional regulator, CdaR family  45.65 
 
 		 393 aa  261  1e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0292097  normal  0.187885 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2723  putative transcriptional regulator, PucR family  41.56 
 
 		 429 aa  259  8e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3120  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  41.8 
 
 		 418 aa  257  2e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550646  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2052  putative transcriptional regulator, PucR family  46.93 
 
 		 429 aa  257  2e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.171524  decreased coverage  0.00281905 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2780  hypothetical protein  41.03 
 
 		 428 aa  233  6e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311956  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3753  hypothetical protein  41.64 
 
 		 428 aa  229  4e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12271  hypothetical protein  40.67 
 
 		 414 aa  229  7e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000339947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3363  hypothetical protein  41.28 
 
 		 428 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20255  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3374  hypothetical protein  41.28 
 
 		 428 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3425  hypothetical protein  41.03 
 
 		 428 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.435185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1266  PucR family transcriptional regulator  44.58 
 
 		 479 aa  177  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.330502 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1627  regulator of polyketide synthase expression  33.33 
 
 		 276 aa  97.8  3e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1203  hypothetical protein  41.28 
 
 		 453 aa  83.2  0.000000000000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000129823 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0536  CdaR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 659 aa  66.2  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.289228  hitchhiker  0.00416894 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1019  transcriptional regulator, CdaR  25.1 
 
 		 371 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3449  transcriptional regulator, CdaR  42.2 
 
 		 398 aa  64.7  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00146797  hitchhiker  0.00488503 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0702  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  41.25 
 
 		 385 aa  60.8  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0249  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  40 
 
 		 385 aa  59.7  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0233  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  40 
 
 		 385 aa  59.7  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0230  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  40 
 
 		 385 aa  59.7  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0231  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  40 
 
 		 385 aa  59.7  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.466297  normal  0.982671 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0247  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  40 
 
 		 385 aa  59.7  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0117  transcriptional regulator, CdaR  47.37 
 
 		 411 aa  59.3  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.646192  normal  0.0132298 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6541  hypothetical protein  31.93 
 
 		 246 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.193415 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 305 aa  58.9  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1182  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  40.26 
 
 		 385 aa  57.8  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3095  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  40.26 
 
 		 385 aa  57.8  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00161  DNA-binding transcriptional activator  40.26 
 
 		 385 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3440  transcriptional regulator, CdaR  40.26 
 
 		 385 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0174  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  40.26 
 
 		 385 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  42.65 
 
 		 480 aa  57.4  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00160  hypothetical protein  40.26 
 
 		 385 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3497  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  40.26 
 
 		 385 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0172  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  40.26 
 
 		 385 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1451  putative carbohydrate diacid regulator  21.54 
 
 		 371 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0166  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  40.26 
 
 		 385 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0167  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  40.26 
 
 		 376 aa  57.4  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1349  putative carbohydrate diacid regulator  22.55 
 
 		 371 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1043  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  41.56 
 
 		 385 aa  57.4  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2940  transcriptional regulator, CdaR  41.75 
 
 		 405 aa  56.6  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.837438  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2351  CdaR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 390 aa  56.6  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000556727  normal  0.18392 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3995  putative carbohydrate diacid regulator  23.11 
 
 		 371 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.859873 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3621  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  36.36 
 
 		 384 aa  55.5  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.420208  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2867  transcriptional regulator, CdaR  40 
 
 		 407 aa  55.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0150  transcriptional regulator, CdaR  38.58 
 
 		 384 aa  54.3  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  36.36 
 
 		 518 aa  54.7  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2804  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  40.26 
 
 		 385 aa  54.7  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3770  transcriptional regulator, CdaR  42.65 
 
 		 404 aa  54.7  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1411  transcriptional regulator, putative  21.14 
 
 		 371 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0792  hypothetical protein  30.38 
 
 		 364 aa  54.3  0.000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.60027  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  41.18 
 
 		 478 aa  53.9  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1211  transcriptional regulator  21.28 
 
 		 371 aa  53.1  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1189  carbohydrate diacid regulator  21.28 
 
 		 371 aa  53.1  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1310  transcriptional regulator  21.28 
 
 		 371 aa  53.1  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1387  putative carbohydrate diacid regulator  21.28 
 
 		 371 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3217  transcriptional regulator, CdaR  48.28 
 
 		 431 aa  53.1  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0250091  normal  0.197749 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1191  carbohydrate diacid regulator  21.05 
 
 		 371 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1213  transcriptional regulator, CdaR  22.22 
 
 		 371 aa  53.1  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0143  transcriptional regulator, CdaR  30.32 
 
 		 388 aa  53.1  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2703  transcriptional regulator, CdaR  34.85 
 
 		 383 aa  52.8  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.601624  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2712  transcriptional regulator, CdaR  46.03 
 
 		 401 aa  52.8  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.406741  hitchhiker  0.000611916 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2592  carbohydrate diacid regulator (sugar diacid regulator)  25.74 
 
 		 381 aa  51.6  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2728  transcriptional regulator, CdaR  31.08 
 
 		 393 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1640  putative transcriptional regulator  44 
 
 		 488 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3970  putative transcriptional regulator, PucR family  34.44 
 
 		 406 aa  52  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00695384  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2495  putative transcriptional regulator, PucR family  48.33 
 
 		 399 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.591683  normal  0.122494 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  42.55 
 
 		 407 aa  51.6  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1394  transcriptional regulator, CdaR  49.15 
 
 		 393 aa  52  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.684667  hitchhiker  0.0014878 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2860  transcriptional regulator CdaR  31.08 
 
 		 387 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2639  transcriptional regulator, CdaR  31.08 
 
 		 387 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2687  transcriptional regulator, CdaR  31.08 
 
 		 387 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0265  putative carbohydrate diacid regulator  44 
 
 		 483 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.18471  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0175  carbohydrate diacid regulator  44 
 
 		 488 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1045  transcriptional regulator, CdaR  34.43 
 
 		 350 aa  52  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00204704  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4926  transcriptional regulator, CdaR  43.28 
 
 		 395 aa  52  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.378586  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5059  putative transcriptional regulator, PucR family  38.32 
 
 		 395 aa  52  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>