110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2494 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2494  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 257 aa  513  1e-144  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000125237  hitchhiker  0.00279844 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3340  transcriptional regulator, TetR family  64.08 
 
 		 227 aa  280  2e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3462  regulatory protein TetR  39.17 
 
 		 221 aa  147  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0249959  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6384  putative transcriptional regulator, TetR family  38.39 
 
 		 224 aa  136  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.317451  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0744  TetR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 224 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0222814 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2879  regulatory protein TetR  36.28 
 
 		 226 aa  129  5.0000000000000004e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2840  transcriptional regulator, TetR family  31.74 
 
 		 238 aa  119  6e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  29.13 
 
 		 250 aa  67.4  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 271 aa  66.2  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  27.71 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2646  transcriptional regulator, TetR family  26.5 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  27.24 
 
 		 272 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30920  transcriptional regulator, tetR family  31.06 
 
 		 266 aa  60.8  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  30.38 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  29.26 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 229 aa  59.7  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2916  TetR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0279  transcriptional regulator, TetR family  28.38 
 
 		 268 aa  58.2  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 268 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  28.37 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  31.47 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5957  transcriptional regulator, TetR family  28.94 
 
 		 229 aa  55.5  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19920  transcriptional regulator, tetR family  32.28 
 
 		 207 aa  54.7  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.314765  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11383  transcriptional regulator  27.04 
 
 		 261 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.900966 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6218  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 278 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.480822 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 272 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  25.33 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  27.15 
 
 		 255 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1989  TetR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 250 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 		 223 aa  53.5  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  26.1 
 
 		 343 aa  53.1  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2378  transcriptional repressor TetR  26.2 
 
 		 260 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287531  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0716  transcriptional regulator, TetR family  27.93 
 
 		 231 aa  52.8  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0221174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2221  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 264 aa  52.8  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104647  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0683  transcriptional regulator, TetR family  42.47 
 
 		 233 aa  52.4  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 		 218 aa  52.4  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4781  transcriptional regulator, TetR family  27.19 
 
 		 228 aa  52.4  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.809331  hitchhiker  0.00725959 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  26.72 
 
 		 249 aa  52  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4284  transcriptional regulator, TetR family  27.95 
 
 		 223 aa  51.6  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4355  TetR family transcriptional regulator  24.8 
 
 		 244 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3083  regulatory protein TetR  30.53 
 
 		 248 aa  50.4  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.143154  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00320  transcriptional regulator, tetR family  26.05 
 
 		 256 aa  50.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48619  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  26.41 
 
 		 234 aa  50.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1254  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 223 aa  49.7  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.284076 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  25.1 
 
 		 285 aa  49.7  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 209 aa  49.3  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 239 aa  49.3  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5638  TetR family transcriptional regulator  24.05 
 
 		 238 aa  48.9  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491763  normal  0.336395 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1770  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 250 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1817  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 250 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1751  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 250 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0578  TetR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 267 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 217 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 250 aa  48.5  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1711  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 226 aa  48.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3861  regulatory protein TetR  39.76 
 
 		 231 aa  48.5  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.153714  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0252  transcriptional regulator, TetR family  27.74 
 
 		 221 aa  48.5  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2596  TetR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 257 aa  47.4  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  27.96 
 
 		 205 aa  47.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0819  transcriptional regulator, TetR family  26.94 
 
 		 237 aa  47.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1965  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 234 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0522  transcriptional regulator, TetR family  37 
 
 		 259 aa  47.4  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0445084 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4082  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 343 aa  47  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.63573 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0897  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 265 aa  47  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4572  putative transcriptional regulator, TetR family  28.51 
 
 		 223 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145324  normal  0.111989 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 245 aa  47  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5556  transcriptional regulator, GntR family  28.17 
 
 		 311 aa  47  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1677  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 218 aa  46.6  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00000521041  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1718  TetR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 228 aa  45.8  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.114077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6498  transcriptional regulator, TetR family  23.53 
 
 		 246 aa  46.2  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2728  putative transcriptional regulator, TetR family  27.8 
 
 		 200 aa  45.8  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.427892  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4132  transcriptional regulator, TetR family  46.94 
 
 		 192 aa  45.8  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 235 aa  45.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4098  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 315 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2911  TetR family transcriptional regulator  25.34 
 
 		 248 aa  45.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.109038 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3639  transcriptional regulator, TetR family  26.41 
 
 		 234 aa  45.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 191 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2404  transcriptional regulator, TetR family  27.83 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0783886 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 245 aa  43.9  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1930  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 206 aa  44.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.189169  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2285  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 213 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  24.69 
 
 		 225 aa  43.5  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 199 aa  43.5  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2594  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 221 aa  43.1  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.971437  normal  0.0759549 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 255 aa  43.5  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3884  transcriptional regulator, TetR family  26.61 
 
 		 304 aa  43.5  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4687  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 259 aa  43.1  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0801  transcriptional regulator, TetR family  26.94 
 
 		 226 aa  43.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 220 aa  43.5  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7747  putative transcriptional regulator  28.19 
 
 		 342 aa  43.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1632  transcriptional regulator, TetR family  35.44 
 
 		 310 aa  43.1  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275496  normal  0.111085 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5889  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 186 aa  43.1  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0215  transcriptional regulator, TetR family  24.56 
 
 		 246 aa  43.1  0.005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.674801 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1669  transcriptional regulator, TetR family  26.47 
 
 		 255 aa  43.1  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2193  regulatory protein TetR  32.76 
 
 		 243 aa  42.7  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00970434  hitchhiker  0.00792169 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2597  putative transcriptional regulator, TetR family  40.28 
 
 		 195 aa  42.7  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.607466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4137  putative transcriptional regulator, TetR family  25.42 
 
 		 263 aa  42.7  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0181128  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2337  transcriptional regulator, TetR family  28.85 
 
 		 218 aa  42.7  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2572  transcriptional regulator, TetR family  32.71 
 
 		 239 aa  42.7  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314261  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5105  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 223 aa  42.4  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000423081  normal  0.55194 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>