More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1291 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1291  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 190 aa  366  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170651  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0257  transcriptional regulator, TetR family  55.62 
 
 		 183 aa  159  3e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.115958 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3667  transcriptional regulator, TetR family  45.25 
 
 		 188 aa  107  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50901  normal  0.427463 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  37.85 
 
 		 214 aa  97.4  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 200 aa  92.8  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 202 aa  89.4  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 199 aa  89  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5390  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 202 aa  81.6  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4794  transcriptional regulator, TetR family  35.47 
 
 		 187 aa  81.3  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1677  transcriptional regulator, TetR family  56.76 
 
 		 257 aa  80.1  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.981661 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2883  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 195 aa  79.3  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.256454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7494  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 188 aa  75.9  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 		 208 aa  75.9  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3328  TetR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 226 aa  72  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2044  transcriptional regulator, TetR family  37.56 
 
 		 217 aa  70.5  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2375  TetR family transcriptional regulator  42.73 
 
 		 191 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2422  TetR family transcriptional regulator  42.73 
 
 		 191 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.04833  normal  0.11925 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2416  TetR family transcriptional regulator  42.73 
 
 		 191 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.112157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4839  TetR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 215 aa  67.8  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4457  TetR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 215 aa  67.8  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4544  TetR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 215 aa  67.8  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0203  regulatory protein TetR  37.82 
 
 		 186 aa  67.4  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.041689  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2116  transcriptional regulator, TetR family  39.5 
 
 		 192 aa  67.4  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0772  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1156  TetR family transcriptional regulator  50.68 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00478832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1650  regulatory protein TetR  34.57 
 
 		 203 aa  64.3  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0671734  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5175  putative transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0125916  hitchhiker  0.00846982 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0053  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.573004  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1927  TetR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 198 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  50.68 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  58.49 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1572  regulatory protein TetR  37.89 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06680  transcriptional regulator  29.38 
 
 		 200 aa  61.2  0.000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2298  TetR family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13864  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4347  transcriptional regulator, TetR family  45.21 
 
 		 191 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.685734 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4506  TetR family transcriptional regulator  52.31 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4593  TetR family transcriptional regulator  52.31 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.10871  normal  0.699268 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5023  TetR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5077  TetR family transcriptional regulator  46.25 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4889  TetR family transcriptional regulator  52.31 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.215217 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1676  TetR family transcriptional regulator  52.31 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.257121  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  25.42 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0267  transcriptional regulator, TetR family  36.02 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173198  hitchhiker  0.00351225 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5568  transcriptional regulator, TetR family  57.41 
 
 		 414 aa  59.3  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2395  transcriptional regulator, TetR family  57.41 
 
 		 423 aa  58.9  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.764783 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5861  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0291  putative transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2366  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000270806  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1420  transcriptional regulator, TetR family  35.07 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0989  TetR family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3652  regulatory protein TetR  30.11 
 
 		 188 aa  57.8  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  47.46 
 
 		 183 aa  57.8  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2350  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 230 aa  57.8  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000443807  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  37.7 
 
 		 226 aa  57.8  0.00000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0274  transcriptional regulator, TetR family  34.65 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160629  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3130  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 216 aa  57  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 208 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4412  transcriptional regulator, TetR family  37.42 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24840  putative transcriptional regulator  46.15 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2105  putative transcriptional regulator  46.15 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0780  transcriptional regulator, TetR family  32.05 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00331259  decreased coverage  0.000414604 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5330  transcriptional regulator, TetR family  53.06 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2972  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419953  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0106  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.156451  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1646  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2910  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0015  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4091  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1157  TetR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4939  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3877  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4296  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0243  transcriptional regulator  26.59 
 
 		 181 aa  55.5  0.0000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1728  TetR family transcriptional regulator  48.61 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  28.02 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1632  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 239 aa  55.1  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13530  transcriptional regulator, TetR family  42 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00114254  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4773  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164473  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12230  transcriptional regulator  49.15 
 
 		 199 aa  54.7  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14390  transcriptional regulator, tetR family  32.56 
 
 		 183 aa  54.7  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4891  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 261 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.164408  normal  0.287477 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4682  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000014918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3710  regulatory protein, TetR  41.1 
 
 		 230 aa  54.7  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0227  transcriptional regulator, TetR family  49.09 
 
 		 247 aa  54.7  0.0000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.543112  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 206 aa  54.3  0.0000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4896  transcriptional regulator, TetR family  43.06 
 
 		 222 aa  53.9  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>