290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5714 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_5714  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 189 aa  368  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5474  TetR family transcriptional regulator  77.25 
 
 		 189 aa  260  6.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.413213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5095  TetR family transcriptional regulator  77.25 
 
 		 189 aa  260  6.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0948615  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5183  TetR family transcriptional regulator  77.25 
 
 		 189 aa  260  6.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3846  regulatory protein TetR  56.28 
 
 		 193 aa  192  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10782  hypothetical protein  44.44 
 
 		 213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.882967 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1599  TetR family transcriptional regulator  46.07 
 
 		 198 aa  121  8e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5158  TetR family transcriptional regulator  45.14 
 
 		 198 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.420731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4962  TetR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 203 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.643195 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4579  TetR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 203 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4667  TetR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 203 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.519146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3965  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 208 aa  74.7  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4585  TetR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 195 aa  65.5  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0832555  normal  0.934265 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1722  TetR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.287966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14200  transcriptional regulator, TetR family  41.1 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000918467  decreased coverage  0.00704922 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2825  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0304388 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2800  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2136  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.547172  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2871  TetR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 213 aa  53.9  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3418  transcriptional regulator protein  27.81 
 
 		 193 aa  52.8  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0498  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 208 aa  52.4  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0309  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 184 aa  52  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.312076  normal  0.149076 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2301  transcriptional regulator, TetR family  27.48 
 
 		 197 aa  52  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1588  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 194 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 202 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0724  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 224 aa  51.2  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2011  transcriptional regulator, TetR family  39.53 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 238 aa  50.8  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1677  transcriptional regulator, TetR family  39.53 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.786941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0056  transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 		 198 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1516  transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1932  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1862  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  42.86 
 
 		 193 aa  50.4  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3645  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 199 aa  50.1  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.529358  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8200  putative transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 237 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0351  TetR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 230 aa  49.7  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 211 aa  49.3  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0377  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 224 aa  48.9  0.00005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.294343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0108  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 222 aa  48.5  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2128  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 202 aa  48.5  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.190242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  46.55 
 
 		 225 aa  48.5  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1655  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 222 aa  48.5  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.229233 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00482  NADH dehydrogenase  46.15 
 
 		 194 aa  48.5  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2666  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 213 aa  48.1  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4792  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 184 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165855  normal  0.419651 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2426  TetR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 205 aa  47.8  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 291 aa  47.8  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0414  TetR family transcriptional regulator  17.06 
 
 		 202 aa  47.8  0.00009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3221  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 232 aa  47.8  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1709  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 203 aa  47.4  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.922562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1327  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 191 aa  47.4  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385081  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0320  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 195 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3845  transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00359694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1059  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 188 aa  47.4  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2937  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 222 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0331  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 195 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0118  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 222 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.980303  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  31.06 
 
 		 247 aa  47.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0341  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 195 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  48 
 
 		 229 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1553  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 212 aa  46.6  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1231  TetR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 289 aa  46.6  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00074883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01051  transcriptional regulator TetR family  44.64 
 
 		 210 aa  46.6  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250197  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3603  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.162578  normal  0.242533 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0091  HTH-type transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 199 aa  46.6  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 204 aa  46.6  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32940  transcriptional regulator, TetR family  42.47 
 
 		 187 aa  47  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1457  transcription regulator, TetR family  30.51 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000222834  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06115  transcriptional regulator TetR family  44.64 
 
 		 210 aa  46.6  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.131749  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  37.93 
 
 		 194 aa  46.2  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0117  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 222 aa  45.8  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2823  TetR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 206 aa  45.8  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.133482  normal  0.0456725 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5551  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 203 aa  46.2  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.1306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 324 aa  45.8  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5169  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 196 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0132  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 222 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2625  regulatory protein, TetR  30.97 
 
 		 206 aa  45.8  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.232365  normal  0.311906 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2527  transcriptional regulator, TetR family  24.74 
 
 		 176 aa  45.4  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1952  regulatory protein TetR  32.74 
 
 		 241 aa  45.4  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0118  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 222 aa  45.8  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17710  transcriptional regulator  32.09 
 
 		 203 aa  45.8  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0632938  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3095  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 192 aa  45.4  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000942813  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3298  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 222 aa  45.4  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 242 aa  45.4  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  52.94 
 
 		 208 aa  45.1  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 218 aa  45.1  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3885  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 242 aa  45.1  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3400  transcriptional regulator, TetR family  45.71 
 
 		 248 aa  45.1  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.160802  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5475  putative transcriptional regulator, TetR family  28.66 
 
 		 232 aa  45.1  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6201  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 189 aa  45.1  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0829103  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0392  transcriptional regulator, TetR family  35.05 
 
 		 201 aa  44.7  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.022112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0595  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 218 aa  45.1  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 205 aa  44.7  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1997  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 209 aa  44.7  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0474929  normal  0.0514197 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7747  putative transcriptional regulator  53.66 
 
 		 342 aa  44.7  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 220 aa  44.7  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0394  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 186 aa  44.7  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.509635  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1242  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 212 aa  44.7  0.0009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000053734  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>