More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1048 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1048  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 367 aa  722    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0768467 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1392  RND family efflux transporter MFP subunit  63.06 
 
 		 369 aa  439  9.999999999999999e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.484541  normal  0.684664 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0827  RND family efflux transporter MFP subunit  60.24 
 
 		 374 aa  379  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.308781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3466  AbgT putative transporter  50.55 
 
 		 361 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.081468 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4710  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.42 
 
 		 383 aa  268  8e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.967203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4341  RND family efflux transporter MFP subunit  46.42 
 
 		 394 aa  268  1e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2782  RND family efflux transporter MFP subunit  45.33 
 
 		 387 aa  263  3e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4858  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.45 
 
 		 388 aa  261  2e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.368814  normal  0.345614 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1099  RND family efflux transporter MFP subunit  46.08 
 
 		 367 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.201717 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2690  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.15 
 
 		 360 aa  249  4e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0736  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.79 
 
 		 361 aa  246  3e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0235  RND efflux membrane fusion protein precursor  41.21 
 
 		 356 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3130  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.71 
 
 		 377 aa  236  4e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.645496  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3411  secretion protein HlyD  39.07 
 
 		 363 aa  236  4e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.591463  normal  0.695679 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01960  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  40.74 
 
 		 356 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0916  HlyD family secretion protein  41.5 
 
 		 372 aa  235  1.0000000000000001e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0859  HlyD family secretion protein  41.5 
 
 		 372 aa  234  2.0000000000000002e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.585057  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0287  RND family efflux transporter MFP subunit  41.96 
 
 		 362 aa  233  5e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44923  normal  0.678954 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5175  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.95 
 
 		 362 aa  233  5e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.321705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5235  RND family efflux transporter MFP subunit  43.55 
 
 		 362 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5082  RND family efflux transporter MFP subunit  41.55 
 
 		 362 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2041  RND family mulitdrug efflux protein  41.98 
 
 		 374 aa  229  8e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.527576 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4926  RND family efflux transporter MFP subunit  41.84 
 
 		 351 aa  229  8e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2040  RND family mulitdrug efflux protein  40.86 
 
 		 358 aa  229  8e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.428821  normal  0.886334 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3410  secretion protein HlyD  41.4 
 
 		 357 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.795724  normal  0.633009 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5087  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.03 
 
 		 357 aa  225  8e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.156095  normal  0.0832308 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01940  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  40.68 
 
 		 383 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.34804 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2037  secretion protein HlyD  40.69 
 
 		 363 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.323562 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2171  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.94 
 
 		 357 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.434682  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3223  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.06 
 
 		 381 aa  220  3.9999999999999997e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0809  hypothetical protein  41.1 
 
 		 360 aa  219  5e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.244326 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0230  secretion protein HlyD  41.3 
 
 		 367 aa  218  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0234  RND efflux membrane fusion protein precursor  40.4 
 
 		 367 aa  217  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1451  RND family efflux transporter MFP subunit  41.53 
 
 		 369 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.513769  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5367  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.24 
 
 		 357 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0173163  normal  0.372844 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0344  secretion protein HlyD  39.12 
 
 		 372 aa  211  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2038  secretion protein HlyD  38.79 
 
 		 357 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.213803 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2170  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.13 
 
 		 362 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.923896  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1423  RND family mulitdrug efflux protein  37.61 
 
 		 371 aa  209  6e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.427177  normal  0.182381 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5088  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40 
 
 		 361 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.857117  normal  0.0828727 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5193  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.82 
 
 		 372 aa  206  4e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1100  RND family efflux transporter MFP subunit  39.47 
 
 		 361 aa  202  8e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.204612 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0231  secretion protein HlyD  33.62 
 
 		 354 aa  200  3e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0735  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.36 
 
 		 357 aa  200  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1452  RND family efflux transporter MFP subunit  37.26 
 
 		 369 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0187105  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5368  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.32 
 
 		 362 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0514804  normal  0.515508 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1311  HlyD family secretion protein  36.2 
 
 		 357 aa  195  9e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1424  RND family mulitdrug efflux protein  38.08 
 
 		 358 aa  195  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.451308  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0915  secretion protein, putative  36.52 
 
 		 368 aa  194  2e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3130  secretion protein HlyD  39.09 
 
 		 395 aa  192  6e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4927  RND family efflux transporter MFP subunit  38.46 
 
 		 354 aa  192  6e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.72338  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3300  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.01 
 
 		 395 aa  192  9e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.512251  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5211  HlyD family secretion protein  36.55 
 
 		 358 aa  192  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0288  RND family efflux transporter MFP subunit  33.74 
 
 		 355 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.527133 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2781  RND family efflux transporter MFP subunit  37.64 
 
 		 364 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5035  HlyD family secretion protein  35.51 
 
 		 396 aa  189  8e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3301  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.07 
 
 		 366 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.168698  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5234  RND family efflux transporter MFP subunit  34.67 
 
 		 355 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1752  RND family efflux transporter MFP subunit  35.8 
 
 		 369 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1660  RND family efflux transporter MFP subunit  35.43 
 
 		 361 aa  186  6e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6340  secretion protein HlyD  35.51 
 
 		 369 aa  186  8e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1739  RND family efflux transporter MFP subunit  35.51 
 
 		 369 aa  186  8e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357806  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5174  RND efflux transporter  34.67 
 
 		 355 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.274772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1520  RND family efflux transporter MFP subunit  36.72 
 
 		 370 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.289277 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1660  RND family efflux transporter MFP subunit  35.14 
 
 		 369 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5192  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.64 
 
 		 356 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1309  efflux protein  35.24 
 
 		 364 aa  182  7e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5081  RND family efflux transporter MFP subunit  34.1 
 
 		 355 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.167851  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4857  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.66 
 
 		 384 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.231948  normal  0.491578 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3351  RND family efflux transporter MFP subunit  33.15 
 
 		 367 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0345  secretion protein HlyD  35.24 
 
 		 361 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2826  RND family efflux transporter MFP subunit  38.02 
 
 		 396 aa  173  3.9999999999999995e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0174041 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3539  RND family efflux transporter MFP subunit  34.47 
 
 		 392 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3131  secretion protein HlyD  33.33 
 
 		 363 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.735534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1462  RND efflux membrane fusion protein precursor  34.87 
 
 		 367 aa  169  7e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5274  RND family efflux transporter MFP subunit  34.17 
 
 		 377 aa  169  9e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0726879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16800  putative efflux transmembrane protein  34.87 
 
 		 367 aa  169  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0868415  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3758  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.43 
 
 		 379 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3470  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.81 
 
 		 379 aa  166  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.430372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1968  multidrug efflux pump, membrane fusion protein CzcB subfamily  32.97 
 
 		 394 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0347448 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3773  RND family efflux transporter MFP subunit  34.59 
 
 		 384 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.265534  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4709  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.04 
 
 		 383 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2027  secretion protein HlyD  33.61 
 
 		 390 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.423658  normal  0.283543 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2292  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.15 
 
 		 383 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.516168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1079  secretion protein HlyD  33.05 
 
 		 366 aa  162  9e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4340  RND family efflux transporter MFP subunit  35.61 
 
 		 387 aa  162  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.625227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2289  RND family efflux transporter MFP subunit  34.28 
 
 		 371 aa  160  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.412391  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1462  RND family efflux transporter MFP subunit  33.15 
 
 		 418 aa  160  4e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2532  secretion protein HlyD  35.47 
 
 		 359 aa  159  6e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19676  normal  0.860631 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2103  RND family efflux transporter MFP subunit  33.14 
 
 		 403 aa  159  6e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0796794  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2653  RND family efflux transporter MFP subunit  37.13 
 
 		 391 aa  157  4e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.399935 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2162  RND family efflux transporter MFP subunit  33.14 
 
 		 371 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0954  RND family efflux transporter MFP subunit  33.14 
 
 		 371 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2295  RND family efflux transporter MFP subunit  33.14 
 
 		 371 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1289  putative transport/efflux transmembrane protein  34.37 
 
 		 378 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.173538 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1551  secretion protein HlyD  36.1 
 
 		 398 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.828693  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2960  RND family efflux transporter MFP subunit  35.2 
 
 		 387 aa  154  2.9999999999999998e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147665  hitchhiker  0.0025793 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1265  RND family efflux transporter MFP subunit  33.14 
 
 		 396 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4207  RND family efflux transporter MFP subunit  35.43 
 
 		 366 aa  152  7e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.647045 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1122  RND family efflux transporter MFP subunit  33.24 
 
 		 366 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>