More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0539 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0826  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  58.53 
 
 		 851 aa  954    Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.00406242  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1188  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  60.57 
 
 		 930 aa  868    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.558323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0187  DEAD/DEAH box helicase  57.98 
 
 		 835 aa  894    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0864531  normal  0.505891 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0615  large atp-dependant helicase-related protein  57.91 
 
 		 835 aa  920    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3154  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  85.76 
 
 		 836 aa  1091    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0202  DEAD/H associated domain protein  59.37 
 
 		 841 aa  981    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0875  DEAD/H associated domain protein  56.3 
 
 		 908 aa  931    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.888716  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1454  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  57.04 
 
 		 824 aa  926    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0579695 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4251  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  81.8 
 
 		 846 aa  1058    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.593625 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4613  DEAD/DEAH box helicase  56.94 
 
 		 937 aa  932    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3312  DEAD/DEAH box helicase-like  49.35 
 
 		 804 aa  753    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.170551  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0747  DEAD/DEAH box helicase-like  58.08 
 
 		 905 aa  910    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.5182 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0797  DEAD/DEAH box helicase-like  60.07 
 
 		 904 aa  947    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.79097  normal  0.907891 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0240  DEAD/DEAH box helicase-like  60.42 
 
 		 853 aa  732    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0232  DEAD/H associated domain protein  58.9 
 
 		 853 aa  972    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0029  DEAD/H associated  61.81 
 
 		 839 aa  767    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0530  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.1 
 
 		 849 aa  852    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.449477 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0263  DEAD/H associated domain protein  56.98 
 
 		 890 aa  885    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0138932 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4760  DEAD/H associated domain protein  83.33 
 
 		 846 aa  1046    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0821998  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0802  putative ATP dependent DNA helicase  55.7 
 
 		 951 aa  910    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0602568 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0372  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  62.76 
 
 		 847 aa  748    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.349627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3478  DEAD/H associated domain protein  85.92 
 
 		 836 aa  1095    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0539  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 		 851 aa  1703    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.151632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0153  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  59.84 
 
 		 884 aa  982    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.178262 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4042  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  58.76 
 
 		 851 aa  948    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0266377  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0453  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  58.76 
 
 		 851 aa  919    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.293341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3350  DEAD/H associated domain protein  77.26 
 
 		 834 aa  1278    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2792  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.16 
 
 		 801 aa  632  1e-179  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.536438 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1613  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.06 
 
 		 809 aa  611  1e-173  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.347748  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3026  DEAD/DEAH box helicase-like protein  49.76 
 
 		 806 aa  566  1e-160  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00670  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family protein  46.89 
 
 		 868 aa  564  1.0000000000000001e-159  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1119  DEAD/H associated domain protein  48.68 
 
 		 807 aa  557  1e-157  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.913802 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0658  ATP-dependent helicase  50.75 
 
 		 799 aa  552  1e-155  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0574  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.42 
 
 		 799 aa  548  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2311  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.75 
 
 		 799 aa  546  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.266127  normal  0.172544 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0986  DEAD/DEAH box helicase-like  47.13 
 
 		 807 aa  531  1e-149  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.26181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0413  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.46 
 
 		 811 aa  514  1e-144  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3000  DEAD/H associated domain protein  33.83 
 
 		 869 aa  407  1.0000000000000001e-112  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3332  DEAD/H associated domain protein  32.43 
 
 		 823 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3430  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.67 
 
 		 844 aa  399  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0824413 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1756  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.62 
 
 		 819 aa  395  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3525  ATP-dependent helicase  29.25 
 
 		 813 aa  383  1e-105  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1205  DEAD/DEAH box helicase-like  33.73 
 
 		 829 aa  372  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3880  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  32.98 
 
 		 830 aa  352  2e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.60391 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0376  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.79 
 
 		 1014 aa  339  9.999999999999999e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2194  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.75 
 
 		 870 aa  326  1e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.254587  decreased coverage  0.00486766 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3147  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.02 
 
 		 900 aa  308  3e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0156392  normal  0.41345 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02265  Helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  31.04 
 
 		 820 aa  306  8.000000000000001e-82  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.269973  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1024  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.11 
 
 		 833 aa  303  7.000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01735  ATP-dependent helicase  35.47 
 
 		 833 aa  302  2e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1853  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  36.1 
 
 		 898 aa  300  5e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3045  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.01 
 
 		 966 aa  298  3e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.279323  normal  0.639762 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0312  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.29 
 
 		 970 aa  297  5e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.342064 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2563  DEAD/H associated domain protein  27.75 
 
 		 840 aa  296  2e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0307  DEAD/H associated domain protein  34.55 
 
 		 970 aa  293  8e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.200628  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6864  DEAD/H associated domain protein  31.46 
 
 		 820 aa  293  9e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.141518 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4858  DEAD/H associated domain protein  34.54 
 
 		 952 aa  291  4e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4141  helicase domain protein  35.29 
 
 		 836 aa  290  8e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2961  DEAD/H associated domain protein  34.41 
 
 		 819 aa  281  4e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000136531 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0778  putative DEAD/DEAH box helicase  33.07 
 
 		 882 aa  280  6e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.274764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4460  DEAD/H associated domain protein  33.23 
 
 		 881 aa  280  8e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.185577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1517  helicase  34.33 
 
 		 825 aa  280  1e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.114808 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1039  DEAD/DEAH box helicase-like  31.05 
 
 		 824 aa  278  4e-73  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0171221  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0197  DEAD/H associated domain protein  27.08 
 
 		 1688 aa  276  1.0000000000000001e-72  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000798352  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08601  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.34 
 
 		 825 aa  274  6e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.313414  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07821  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.14 
 
 		 828 aa  273  8.000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1463  DEAD/DEAH box helicase-like  32.37 
 
 		 831 aa  273  1e-71  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0838688 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0732  DEAD/DEAH box helicase-like  28.13 
 
 		 828 aa  273  1e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0692265  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1103  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  33.44 
 
 		 816 aa  272  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1143  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.61 
 
 		 816 aa  271  4e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.329309  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1132  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.12 
 
 		 817 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07821  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.42 
 
 		 828 aa  267  5e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4309  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.39 
 
 		 816 aa  264  6.999999999999999e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.638833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6751  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.76 
 
 		 888 aa  263  1e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174842  normal  0.916616 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0384  DEAD/DEAH box helicase-like  31.02 
 
 		 1531 aa  259  1e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.224382 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1724  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.17 
 
 		 1553 aa  255  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0413876  normal  0.423713 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2240  DEAD/H associated domain protein  29.9 
 
 		 1506 aa  252  2e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.589998 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0156  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.17 
 
 		 1476 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0392  ATP-dependent helicase  26.92 
 
 		 874 aa  246  1.9999999999999999e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.447466 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1527  ATP-dependent helicase  27.05 
 
 		 874 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.983295  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0444  ATP-dependent helicase  26.51 
 
 		 874 aa  244  7e-63  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0533  ATP-dependent helicase  28.31 
 
 		 870 aa  239  1e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1087  DEAD/H associated domain protein  25.36 
 
 		 875 aa  235  2.0000000000000002e-60  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.414576  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1489  DEAD/H associated domain protein  29.55 
 
 		 1584 aa  234  4.0000000000000004e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.369551 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1253  ATP-dependent helicase  28.94 
 
 		 941 aa  233  1e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3924  DEAD/H associated domain protein  31.23 
 
 		 1535 aa  232  2e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2140  DEAD/H associated domain protein  29.39 
 
 		 1741 aa  233  2e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.800534 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1039  DEAD/H associated domain protein  28.12 
 
 		 1618 aa  232  2e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1508  ATP-dependent helicase  28.05 
 
 		 872 aa  230  7e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0507962  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5453  DEAD/H associated domain protein  29.4 
 
 		 1504 aa  229  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23220  ATP dependent helicase, Lhr family  31.53 
 
 		 1649 aa  228  3e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.408844  normal  0.0469013 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1744  putative ATP-dependent helicase lhr  33.33 
 
 		 1599 aa  226  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1061  DEAD/H associated domain protein  30.03 
 
 		 1434 aa  225  3e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0993  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  33.33 
 
 		 1598 aa  224  4e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1332  putative ATP-dependent helicase lhr  33.33 
 
 		 1598 aa  224  4e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.214802  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0375  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  33.33 
 
 		 1598 aa  224  4e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.886751  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0264  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  33.33 
 
 		 1598 aa  224  4e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4351  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.81 
 
 		 1429 aa  224  8e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2819  ATP-dependent helicase  26.12 
 
 		 915 aa  224  8e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1730  putative ATP-dependent helicase Lhr  26.72 
 
 		 1525 aa  223  9.999999999999999e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>