More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1483 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1483  phosphoglycolate phosphatase  100 
 
 		 231 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.539513 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1514  phosphoglycolate phosphatase  62.61 
 
 		 243 aa  276  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00414525  decreased coverage  0.0000736152 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3752  HAD family hydrolase  51.1 
 
 		 237 aa  214  9.999999999999999e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1985  phosphoglycolate phosphatase  40.55 
 
 		 223 aa  157  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.554471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3482  phosphoglycolate phosphatase  35.94 
 
 		 226 aa  142  5e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824519  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  37.96 
 
 		 229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  38.6 
 
 		 272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  39.07 
 
 		 272 aa  129  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0571  phosphoglycolate phosphatase  36.2 
 
 		 242 aa  129  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2479  phosphoglycolate phosphatase  39.09 
 
 		 228 aa  128  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0669626  normal  0.547058 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  34.76 
 
 		 235 aa  128  8.000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  37.95 
 
 		 272 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1574  phosphoglycolate phosphatase  39.24 
 
 		 227 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0357575  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46650  phosphoglycolate phosphatase  39.63 
 
 		 233 aa  125  5e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  37.16 
 
 		 272 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  37.56 
 
 		 223 aa  125  7e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  41.35 
 
 		 226 aa  125  7e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2201  phosphoglycolate phosphatase  35.1 
 
 		 226 aa  123  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  37.5 
 
 		 272 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2229  phosphoglycolate phosphatase  33.02 
 
 		 227 aa  123  3e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.40738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  34.96 
 
 		 226 aa  122  3e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  35.16 
 
 		 224 aa  122  4e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0567  phosphoglycolate phosphatase  37.21 
 
 		 266 aa  122  6e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2847  phosphoglycolate phosphatase  36.36 
 
 		 227 aa  122  6e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.212796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3246  phosphoglycolate phosphatase  36.36 
 
 		 227 aa  122  6e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.181824  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2493  phosphoglycolate phosphatase  32.41 
 
 		 225 aa  121  8e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002270  phosphoglycolate phosphatase  33.82 
 
 		 228 aa  120  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  37.67 
 
 		 272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2233  phosphoglycolate phosphatase  35.68 
 
 		 238 aa  119  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.25252  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  33.77 
 
 		 227 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5119  phosphoglycolate phosphatase  35.51 
 
 		 272 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3878  phosphoglycolate phosphatase  36.23 
 
 		 234 aa  119  6e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4610  phosphoglycolate phosphatase  35.81 
 
 		 272 aa  118  7e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2727  phosphoglycolate phosphatase  32.89 
 
 		 227 aa  118  9e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3361  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 		 227 aa  118  9e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  33.95 
 
 		 226 aa  118  9.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0743  phosphoglycolate phosphatase  33.95 
 
 		 225 aa  118  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  35.71 
 
 		 229 aa  117  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3887  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 		 227 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.379252 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0293  phosphoglycolate phosphatase  32.86 
 
 		 227 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2124  phosphoglycolate phosphatase  31.03 
 
 		 230 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2697  phosphoglycolate phosphatase  34.27 
 
 		 240 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00083  phosphoglycolate phosphatase  31.36 
 
 		 228 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0176  phosphoglycolate phosphatase  29.63 
 
 		 224 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.790253  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3699  phosphoglycolate phosphatase  31.25 
 
 		 226 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4055  phosphoglycolate phosphatase  34.08 
 
 		 234 aa  116  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0278697  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2014  phosphoglycolate phosphatase  34.39 
 
 		 236 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4076  phosphoglycolate phosphatase  31.39 
 
 		 225 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3996  phosphoglycolate phosphatase  31.39 
 
 		 225 aa  115  6e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4106  phosphoglycolate phosphatase  31.39 
 
 		 225 aa  115  6e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4600  phosphoglycolate phosphatase  36.19 
 
 		 232 aa  115  6.9999999999999995e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.383007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0254  phosphoglycolate phosphatase  32.86 
 
 		 227 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3193  phosphoglycolate phosphatase  34.27 
 
 		 250 aa  115  7.999999999999999e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2370  phosphoglycolate phosphatase  33.02 
 
 		 227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0352  phosphoglycolate phosphatase  34.93 
 
 		 241 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0570615  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4194  phosphoglycolate phosphatase  31.39 
 
 		 225 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0057  phosphoglycolate phosphatase  29.95 
 
 		 232 aa  112  5e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.049028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 		 225 aa  112  5e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3691  phosphoglycolate phosphatase  31.9 
 
 		 227 aa  112  5e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0343  phosphoglycolate phosphatase  35.1 
 
 		 233 aa  112  6e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2570  phosphoglycolate phosphatase  32.72 
 
 		 254 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0535  phosphoglycolate phosphatase  32.72 
 
 		 254 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2110  phosphoglycolate phosphatase  32.13 
 
 		 225 aa  111  9e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.782136  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2446  phosphoglycolate phosphatase  30.77 
 
 		 225 aa  111  9e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0363  phosphoglycolate phosphatase  34.45 
 
 		 261 aa  111  9e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2080  phosphoglycolate phosphatase  36.67 
 
 		 237 aa  111  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0440  phosphoglycolate phosphatase  35.27 
 
 		 235 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.433387 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0507  phosphoglycolate phosphatase  32.72 
 
 		 254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263743  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0382  phosphoglycolate phosphatase  32.11 
 
 		 229 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3495  phosphoglycolate phosphatase  33.18 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0294223  hitchhiker  0.0000911523 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2908  phosphoglycolate phosphatase  32.72 
 
 		 242 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1410  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0261  phosphoglycolate phosphatase  33.17 
 
 		 226 aa  109  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0460  phosphoglycolate phosphatase  35.03 
 
 		 229 aa  109  4.0000000000000004e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0934432  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0534  phosphoglycolate phosphatase  33.18 
 
 		 242 aa  108  5e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0250125  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0939  phosphoglycolate phosphatase  33.18 
 
 		 242 aa  108  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1909  phosphoglycolate phosphatase  33.18 
 
 		 242 aa  108  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0643  phosphoglycolate phosphatase  33.18 
 
 		 242 aa  108  5e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1089  phosphoglycolate phosphatase  33.78 
 
 		 227 aa  109  5e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3574  phosphoglycolate phosphatase  33.18 
 
 		 242 aa  108  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.952116  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3555  phosphoglycolate phosphatase  33.18 
 
 		 245 aa  108  6e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.221388  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3582  phosphoglycolate phosphatase  33.18 
 
 		 245 aa  108  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2111  phosphoglycolate phosphatase  33.78 
 
 		 228 aa  108  7.000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0268  phosphoglycolate phosphatase  31.36 
 
 		 228 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0557534  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2880  phosphoglycolate phosphatase  34.25 
 
 		 246 aa  107  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.587243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3622  2-phosphoglycolate phosphatase  32.26 
 
 		 254 aa  107  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2757  phosphoglycolate phosphatase  34.23 
 
 		 243 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.411374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  30.48 
 
 		 235 aa  107  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2054  phosphoglycolate phosphatase  35.68 
 
 		 225 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3387  phosphoglycolate phosphatase  33.48 
 
 		 225 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0781845 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0464  phosphoglycolate phosphatase  33.01 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.992467  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0265  phosphoglycolate phosphatase  34.3 
 
 		 232 aa  106  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.210779  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3122  phosphoglycolate phosphatase  34.23 
 
 		 248 aa  106  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.571446  normal  0.270174 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0440  phosphoglycolate phosphatase  32.54 
 
 		 251 aa  105  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0462  2-phosphoglycolate phosphatase  31.25 
 
 		 238 aa  105  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3722  phosphoglycolate phosphatase  35.75 
 
 		 232 aa  104  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0244843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  32.89 
 
 		 252 aa  104  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1479  phosphoglycolate phosphatase  33.64 
 
 		 231 aa  104  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.781791  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3961  phosphoglycolate phosphatase  35.75 
 
 		 232 aa  104  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.512442  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0230  phosphoglycolate phosphatase  35.75 
 
 		 232 aa  104  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.135549  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>