More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1323 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1323  polysaccharide deacetylase family protein  100 
 
 		 300 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2675  polysaccharide deacetylase  64.71 
 
 		 280 aa  317  2e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0615547  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3302  polysaccharide deacetylase  61.69 
 
 		 272 aa  299  4e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.229858  normal  0.446106 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4706  polysaccharide deacetylase  59.09 
 
 		 286 aa  293  3e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0236101 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1373  polysaccharide deacetylase  59.43 
 
 		 267 aa  286  4e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00379023 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2751  transmembrane protein  57.25 
 
 		 283 aa  277  2e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4179  polysaccharide deacetylase  57.31 
 
 		 266 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0316  polysaccharide deacetylase  59.92 
 
 		 287 aa  269  4e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0777924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2684  polysaccharide deacetylase  58.56 
 
 		 294 aa  268  8e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.569149 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3983  polysaccharide deacetylase  54.48 
 
 		 284 aa  267  2e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0304  polysaccharide deacetylase  56 
 
 		 287 aa  265  7e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5979  polysaccharide deacetylase  53.01 
 
 		 285 aa  259  3e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.185285  normal  0.666429 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0428  hypothetical protein  60.23 
 
 		 287 aa  258  1e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.249302  normal  0.885456 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0920  polysaccharide deacetylase family protein  60.08 
 
 		 270 aa  257  2e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2765  polysaccharide deacetylase  56.99 
 
 		 294 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.468013  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2215  putative transmembrane protein  53.99 
 
 		 288 aa  256  4e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.814206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2151  polysaccharide deacetylase  56.99 
 
 		 294 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.342073  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6095  polysaccharide deacetylase  60.09 
 
 		 297 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.233371  normal  0.603331 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2817  polysaccharide deacetylase  62.32 
 
 		 300 aa  243  3e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3928  polysaccharide deacetylase  58.08 
 
 		 289 aa  241  7.999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.284883  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0930  polysaccharide deacetylase  49.79 
 
 		 246 aa  222  7e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0787  polysaccharide deacetylase family protein  48.98 
 
 		 349 aa  221  8e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.29381  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3369  polysaccharide deacetylase  43.64 
 
 		 259 aa  156  3e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.792887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1557  acetylxylan esterase  41.33 
 
 		 275 aa  154  1e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.956674  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1497  polysaccharide deacetylase  41.07 
 
 		 275 aa  152  5.9999999999999996e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.507826  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02423  acetylxylan esterase  43 
 
 		 260 aa  142  6e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2113  GlcNAc deacetylase-related protein carbohydrate esterase family 4 protein  36.7 
 
 		 259 aa  139  4.999999999999999e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.228742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1987  polysaccharide deacetylase  36.46 
 
 		 256 aa  133  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1868  polysaccharide deacetylase  35.11 
 
 		 258 aa  124  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2417  polysaccharide deacetylase  42.02 
 
 		 280 aa  119  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108367  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1541  polysaccharide deacetylase  39.83 
 
 		 280 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0577624  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03855  polysaccharide deacetylase, putative  28.46 
 
 		 258 aa  117  3e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  31.61 
 
 		 251 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1257  polysaccharide deacetylase  37.02 
 
 		 235 aa  113  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1446  polysaccharide deacetylase  39.74 
 
 		 280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.781341  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  32.77 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4749  polysaccharide deacetylase  30.52 
 
 		 240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0970  polysaccharide deacetylase  30.73 
 
 		 479 aa  109  5e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.064586  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_959  glycosyl transferase  31.5 
 
 		 479 aa  108  7.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  31.03 
 
 		 299 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1141  glycosyl transferase/polysaccharide deacetylase family protein  29.3 
 
 		 481 aa  107  3e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.226715  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  27.23 
 
 		 247 aa  107  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  30.39 
 
 		 301 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  30.69 
 
 		 387 aa  105  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  30 
 
 		 372 aa  104  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0991  polysaccharide deacetylase family protein  27.86 
 
 		 244 aa  103  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2673  polysaccharide deacetylase  36.96 
 
 		 413 aa  103  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0653115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1037  polysaccharide deacetylase  38.04 
 
 		 269 aa  103  5e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0742911 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  27.78 
 
 		 368 aa  102  7e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2298  polysaccharide deacetylase  32.42 
 
 		 372 aa  101  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00169633  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1829  polysaccharide deacetylase  26.11 
 
 		 300 aa  102  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000043926  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6669  polysaccharide deacetylase  36.49 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.422259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  36.18 
 
 		 404 aa  100  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0643  polysaccharide deacetylase  34.54 
 
 		 425 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0647  polysaccharide deacetylase  35.03 
 
 		 204 aa  100  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  29.41 
 
 		 305 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  29.92 
 
 		 324 aa  99.4  6e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  31.25 
 
 		 1120 aa  99.4  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4717  polysaccharide deacetylase  35.15 
 
 		 285 aa  99  8e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0628  polysaccharide deacetylase  35.75 
 
 		 268 aa  97.4  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0237416 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  29.26 
 
 		 321 aa  97.1  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0633  polysaccharide deacetylase  32.64 
 
 		 247 aa  96.7  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.256712 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5514  polysaccharide deacetylase  36.41 
 
 		 252 aa  96.3  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.77719  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1031  polysaccharide deacetylase  36.81 
 
 		 430 aa  96.3  6e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  32.34 
 
 		 413 aa  96.3  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  26.5 
 
 		 221 aa  95.9  6e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5017  polysaccharide deacetylase family protein  30.32 
 
 		 211 aa  94.7  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.910146  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  30.69 
 
 		 373 aa  95.5  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  27.75 
 
 		 302 aa  95.5  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4627  polysaccharide deacetylase  36.52 
 
 		 283 aa  95.1  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  hitchhiker  0.00736578 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2057  polysaccharide deacetylase  37.66 
 
 		 252 aa  94  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129437  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  29.79 
 
 		 244 aa  94.4  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  27.94 
 
 		 277 aa  94.4  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1550  polysaccharide deacetylase  37.11 
 
 		 244 aa  94  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0260353  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  36.7 
 
 		 267 aa  94  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  32 
 
 		 220 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1917  polysaccharide deacetylase  36.02 
 
 		 250 aa  93.6  4e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5206  polysaccharide deacetylase  36.26 
 
 		 259 aa  93.2  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262209  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0200  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 240 aa  93.6  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  30.46 
 
 		 241 aa  93.2  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  33.16 
 
 		 468 aa  92.8  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  26.19 
 
 		 264 aa  92.4  9e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  31.5 
 
 		 213 aa  92  9e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1762  polysaccharide deacetylase  32.68 
 
 		 243 aa  92  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  32 
 
 		 241 aa  92  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0538  polysaccharide deacetylase  29.35 
 
 		 323 aa  91.3  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0863369  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  28.87 
 
 		 275 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1625  polysaccharide deacetylase  27.08 
 
 		 212 aa  91.7  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.679944  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07950  polysaccharide deacetylase  28.25 
 
 		 263 aa  90.9  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1822  polysaccharide deacetylase  32.8 
 
 		 353 aa  91.3  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00017451  normal  0.0392503 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  35.29 
 
 		 752 aa  90.9  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  30.85 
 
 		 213 aa  90.1  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  30.85 
 
 		 213 aa  90.1  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  31.44 
 
 		 241 aa  90.1  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  30.85 
 
 		 213 aa  90.1  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2978  polysaccharide deacetylase  35.85 
 
 		 205 aa  90.1  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000961865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  30.85 
 
 		 241 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1224  polysaccharide deacetylase  34.04 
 
 		 392 aa  89  9e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.533397  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  25.88 
 
 		 417 aa  89  1e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  34.43 
 
 		 542 aa  88.6  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>