129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1918 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1918  putative cache sensor protein  100 
 
 		 632 aa  1299    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.149363  normal  0.217415 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1916  extracellular solute-binding protein family 3  73.29 
 
 		 483 aa  735    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2765  amino acid ABC transporter periplasmic protein  37.06 
 
 		 401 aa  268  2e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0629  extracellular solute-binding protein  38.7 
 
 		 257 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1208  hypothetical protein  36.64 
 
 		 258 aa  155  2.9999999999999998e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000699317  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3830  extracellular solute-binding protein  35.65 
 
 		 248 aa  152  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000366277 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0424  hypothetical protein  39.17 
 
 		 256 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0350  extracellular solute-binding protein family 3  28.07 
 
 		 321 aa  110  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0133156 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0619  hypothetical protein  33.33 
 
 		 248 aa  110  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.566502  normal  0.917839 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4251  amino acid ABC transporter periplasmic protein  31.65 
 
 		 244 aa  108  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000526957 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0328  hypothetical protein  34.04 
 
 		 251 aa  106  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397197 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67850  putative ABC-type amino acid transport protein, periplasmic component  30.54 
 
 		 250 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.349677 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4250  amino acid ABC transporter periplasmic protein  33.33 
 
 		 251 aa  104  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190529 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5874  hypothetical protein  31.67 
 
 		 248 aa  104  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67860  putative ABC-type amino acid transporter  31.22 
 
 		 248 aa  103  7e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.339144 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5873  hypothetical protein  31.2 
 
 		 250 aa  103  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1595  extracellular solute-binding protein  30.37 
 
 		 262 aa  103  9e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.614347  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67840  putative ABC-type amino acid transporter  26.09 
 
 		 251 aa  95.1  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.288914 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0969  extracellular solute-binding protein  26.89 
 
 		 255 aa  95.1  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5872  hypothetical protein  26.09 
 
 		 251 aa  95.1  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4249  extracellular solute-binding protein  27.38 
 
 		 251 aa  94.4  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199527 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4891  hypothetical protein  25.68 
 
 		 251 aa  94.4  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1009  hypothetical protein  29.96 
 
 		 242 aa  94.4  6e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.815562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1477  extracellular solute-binding protein family 3  35.88 
 
 		 254 aa  94  8e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0687  extracellular solute-binding protein  26.21 
 
 		 255 aa  93.6  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0733  amino acid ABC transporter periplasmic protein  29.66 
 
 		 255 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.263143  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5333  hypothetical protein  25.59 
 
 		 269 aa  91.3  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3192  extracellular solute-binding protein  25.83 
 
 		 265 aa  91.3  5e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0961443  hitchhiker  0.0000817621 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0746  extracellular solute-binding protein  25.88 
 
 		 275 aa  90.9  6e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0305191 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3523  extracellular solute-binding protein  26.84 
 
 		 268 aa  90.9  7e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1005  hypothetical protein  25.22 
 
 		 255 aa  89  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.69065  normal  0.921286 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3860  hypothetical protein  28.71 
 
 		 265 aa  88.6  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0967  extracellular solute-binding protein  25.66 
 
 		 255 aa  88.2  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3523  extracellular solute-binding protein, family 3  26.19 
 
 		 257 aa  88.2  5e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1054  extracellular solute-binding protein family 3  26.19 
 
 		 257 aa  87.4  7e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0164866  hitchhiker  0.000017747 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3570  extracellular solute-binding protein family 3  26.89 
 
 		 252 aa  87.4  7e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3761  extracellular solute-binding protein  26.89 
 
 		 265 aa  87.4  7e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3302  extracellular solute-binding protein  26.19 
 
 		 257 aa  87  8e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2937  hypothetical protein  25.66 
 
 		 257 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1844  extracellular solute-binding protein  26.87 
 
 		 260 aa  86.3  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000362453  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3638  extracellular solute-binding protein  26.89 
 
 		 265 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.055561  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1143  hypothetical protein  25.69 
 
 		 255 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3188  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  23.53 
 
 		 228 aa  85.1  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484393  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2624  hypothetical protein  27.59 
 
 		 271 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.547677 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2915  amino acid ABC transporter periplasmic protein  26.75 
 
 		 247 aa  82.8  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1845  extracellular solute-binding protein  26.13 
 
 		 262 aa  82.4  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00294253  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3398  extracellular solute-binding protein  25.71 
 
 		 257 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0772  extracellular solute-binding protein  25.68 
 
 		 238 aa  80.5  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.025527 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3031  extracellular solute-binding protein family 3  26.03 
 
 		 237 aa  77.8  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.516858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0332  cache type 2 domain-containing protein  37.27 
 
 		 153 aa  77.8  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0349612  normal  0.499668 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1683  hypothetical protein  24.89 
 
 		 251 aa  77.8  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2990  extracellular solute-binding protein  24.07 
 
 		 263 aa  77.8  0.0000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.604366  normal  0.133749 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2767  extracellular solute-binding protein family 3  26.03 
 
 		 238 aa  77  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3893  amino acid ABC transporter periplasmic protein  27.05 
 
 		 252 aa  75.1  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0921  extracellular solute-binding protein  24.78 
 
 		 260 aa  74.3  0.000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1093  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.3 
 
 		 1721 aa  73.9  0.000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0258  extracellular solute-binding protein  23.58 
 
 		 236 aa  67.4  0.0000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4480  hypothetical protein  28.93 
 
 		 282 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109317 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2978  extracellular solute-binding protein  24.29 
 
 		 248 aa  63.9  0.000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1585  hypothetical protein  25.45 
 
 		 248 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1919  amino acid ABC transporter periplasmic protein  25.32 
 
 		 247 aa  63.2  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0371115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1101  extracellular solute-binding protein family 3  25.73 
 
 		 295 aa  62  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0196876 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2027  amino acid ABC transporter periplasmic protein  22.78 
 
 		 275 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.360228 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0241  extracellular solute-binding protein  25.21 
 
 		 275 aa  59.7  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1528  cache type 2 domain-containing protein  32.63 
 
 		 129 aa  58.5  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0881  extracellular solute-binding protein  23.08 
 
 		 269 aa  57.8  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1252  cache type 2 domain-containing protein  29.9 
 
 		 302 aa  56.6  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.751516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0772  cache, type 2 domain protein  34.04 
 
 		 151 aa  57  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2486  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.11 
 
 		 504 aa  55.8  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.961139  normal  0.110025 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.11 
 
 		 499 aa  55.1  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.729026  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3305  extracellular solute-binding protein  22.44 
 
 		 244 aa  53.9  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0459  amino acid ABC transporter periplasmic protein  27.18 
 
 		 255 aa  53.9  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3391  putative PAS/PAC sensor protein  22.81 
 
 		 1301 aa  53.9  0.000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0258089  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3161  cache domain-contain protein  38.36 
 
 		 152 aa  53.5  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.535779  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2342  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.71 
 
 		 508 aa  53.1  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.10605  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1070  extracellular solute-binding protein  22.5 
 
 		 281 aa  52.4  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.703712 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2563  putative cache sensor protein  32.08 
 
 		 189 aa  52.8  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.800793 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2364  cache type 2 domain-containing protein  26.67 
 
 		 160 aa  52.4  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0585  amino acid ABC transporter periplasmic protein  25 
 
 		 274 aa  52.4  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3277  Cache type 2 domain protein  36.99 
 
 		 152 aa  52  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0890612  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1715  hypothetical protein  28.26 
 
 		 151 aa  51.6  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0227611  normal  0.523463 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2065  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34 
 
 		 554 aa  51.2  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.460232  normal  0.464376 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1888  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34 
 
 		 487 aa  51.2  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1910  amino acid ABC transporter periplasmic protein  18.55 
 
 		 256 aa  51.2  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0380327 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0779  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  35.14 
 
 		 558 aa  50.4  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0546434  normal  0.151916 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3066  cache type 2 domain-containing protein  29.35 
 
 		 549 aa  50.1  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1277  hypothetical protein  25.83 
 
 		 272 aa  48.9  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.674192  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1037  histidine kinase  28.29 
 
 		 608 aa  48.5  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3689  diguanylate cyclase  21.85 
 
 		 935 aa  48.9  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.59 
 
 		 1165 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0820  chemotaxis sensory transducer  33.78 
 
 		 608 aa  48.9  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254614  normal  0.216431 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2755  periplasmic substrate-binding protein/sensor histidine kinase  24.89 
 
 		 590 aa  48.5  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0958  methyl-accepting chemotaxis protein  32.04 
 
 		 610 aa  48.5  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1708  Cache, type 2  33.7 
 
 		 153 aa  48.5  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0920811 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1312  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.33 
 
 		 584 aa  48.5  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0741  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.67 
 
 		 558 aa  48.5  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.532986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1897  diguanylate cyclase  29.46 
 
 		 937 aa  48.1  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0415273 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4979  periplasmic binding protein, putative  25.66 
 
 		 262 aa  47.8  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3582  Cache, type 2  31.91 
 
 		 151 aa  47.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.351306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4272  Cache type 2 domain protein  31.91 
 
 		 151 aa  47.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.819687  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>