40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4480 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4480  hypothetical protein  100 
 
 		 282 aa  570  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109317 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2242  hypothetical protein  43.17 
 
 		 305 aa  228  8e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.184581  hitchhiker  0.000000000000117809 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2816  putative cache sensor protein  38.87 
 
 		 285 aa  186  3e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1252  cache type 2 domain-containing protein  23 
 
 		 302 aa  73.2  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.751516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1715  hypothetical protein  35.71 
 
 		 151 aa  70.1  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0227611  normal  0.523463 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0332  cache type 2 domain-containing protein  37.19 
 
 		 153 aa  68.6  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0349612  normal  0.499668 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3161  cache domain-contain protein  32.81 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.535779  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1918  putative cache sensor protein  28.93 
 
 		 632 aa  66.2  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.149363  normal  0.217415 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3277  Cache type 2 domain protein  31.78 
 
 		 152 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0890612  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3582  Cache, type 2  34.4 
 
 		 151 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.351306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4272  Cache type 2 domain protein  34.4 
 
 		 151 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.819687  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0304  putative cache sensor protein  31.82 
 
 		 152 aa  64.3  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.333934 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1528  cache type 2 domain-containing protein  31.91 
 
 		 129 aa  63.5  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.78 
 
 		 499 aa  60.8  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.729026  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1708  Cache, type 2  35.71 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0920811 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45810  hypothetical protein  30.65 
 
 		 145 aa  58.2  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1876  hypothetical protein  27.69 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0770276  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3066  cache type 2 domain-containing protein  24.39 
 
 		 549 aa  54.3  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2109  cache, type 2  27.34 
 
 		 130 aa  53.9  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000614134  hitchhiker  0.00251106 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1769  hypothetical protein  27.42 
 
 		 148 aa  53.9  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3511  hypothetical protein  33.06 
 
 		 148 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.751588  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2273  hypothetical protein  33.06 
 
 		 148 aa  53.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104576  normal  0.662685 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2342  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.76 
 
 		 508 aa  50.1  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.10605  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0772  cache, type 2 domain protein  24.03 
 
 		 151 aa  49.3  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1159  hypothetical protein  27.97 
 
 		 148 aa  48.9  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3011  hypothetical protein  33.06 
 
 		 148 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.438725  normal  0.345508 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2065  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.68 
 
 		 554 aa  47.4  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.460232  normal  0.464376 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1888  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.71 
 
 		 487 aa  47.8  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2364  cache type 2 domain-containing protein  25.62 
 
 		 160 aa  45.8  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002443  N-acetylglucosamine regulated methyl-accepting chemotaxis protein  30 
 
 		 541 aa  45.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000057049  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3618  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.62 
 
 		 512 aa  45.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0151839  normal  0.0370629 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1646  diguanylate cyclase  24.77 
 
 		 580 aa  45.4  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000165959  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2116  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.71 
 
 		 545 aa  44.3  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2861  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.35 
 
 		 544 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.445183 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.35 
 
 		 544 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1093  multi-sensor hybrid histidine kinase  25 
 
 		 1721 aa  43.5  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2601  chemotaxis sensory transducer  30.77 
 
 		 569 aa  42.7  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.441915  normal  0.36116 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2486  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.16 
 
 		 504 aa  42.4  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.961139  normal  0.110025 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41030  Periplasmic sensory histidine protein kinase, two-component  32.38 
 
 		 458 aa  42.4  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0649951  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1776  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  29.03 
 
 		 543 aa  42.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.363817 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>