208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1159 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1159  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  307  2.9999999999999997e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1528  cache type 2 domain-containing protein  46.83 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0332  cache type 2 domain-containing protein  42.74 
 
 		 153 aa  107  7.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0349612  normal  0.499668 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2109  cache, type 2  38.28 
 
 		 130 aa  101  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000614134  hitchhiker  0.00251106 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1252  cache type 2 domain-containing protein  38.33 
 
 		 302 aa  93.6  9e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.751516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1093  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.58 
 
 		 1721 aa  90.1  8e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0304  putative cache sensor protein  35.54 
 
 		 152 aa  85.1  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.333934 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1876  hypothetical protein  34.68 
 
 		 152 aa  84.3  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0770276  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.06 
 
 		 499 aa  82  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.729026  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2364  cache type 2 domain-containing protein  33.61 
 
 		 160 aa  77.8  0.00000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0772  cache, type 2 domain protein  31.45 
 
 		 151 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3161  cache domain-contain protein  30.65 
 
 		 152 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.535779  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1452  putative cache sensor protein  35.45 
 
 		 452 aa  75.1  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3277  Cache type 2 domain protein  29.84 
 
 		 152 aa  73.6  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0890612  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2563  putative cache sensor protein  33.33 
 
 		 189 aa  72.8  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.800793 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0638  putative cache sensor protein  33.08 
 
 		 188 aa  73.2  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.05692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0349  Signal transduction histidine kinase-like  36.29 
 
 		 181 aa  73.2  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.510339 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1708  Cache, type 2  29.27 
 
 		 153 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0920811 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1642  cache type 2 domain-containing protein  31.09 
 
 		 146 aa  69.7  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000155098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3066  cache type 2 domain-containing protein  29.01 
 
 		 549 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2286  cache type 2 domain-containing protein  36.8 
 
 		 320 aa  68.2  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1908  cache type 2 domain-containing protein  35.83 
 
 		 183 aa  67.4  0.00000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1715  hypothetical protein  29.27 
 
 		 151 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0227611  normal  0.523463 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4272  Cache type 2 domain protein  28.46 
 
 		 151 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.819687  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0021  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  36.13 
 
 		 487 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.130425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3582  Cache, type 2  27.64 
 
 		 151 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.351306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0701  hypothetical protein  33.98 
 
 		 565 aa  64.3  0.0000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.385527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3728  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 488 aa  62  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2242  hypothetical protein  36.17 
 
 		 305 aa  61.6  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.184581  hitchhiker  0.000000000000117809 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1253  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.4 
 
 		 567 aa  61.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.010155 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1027  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  34.43 
 
 		 456 aa  61.6  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.573227  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3405  histidine kinase  34.69 
 
 		 488 aa  60.8  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.352666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2728  chemotaxis sensory transducer  39.44 
 
 		 544 aa  60.8  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00837045  normal  0.306222 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1642  hypothetical protein  32.31 
 
 		 521 aa  60.5  0.000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2473  cache type 2 domain-containing protein  30.95 
 
 		 551 aa  60.5  0.000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4280  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.3 
 
 		 563 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2220  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  35.62 
 
 		 971 aa  58.5  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00060546  normal  0.0976665 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0077  histidine kinase  30.28 
 
 		 661 aa  57.8  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1130  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  28.45 
 
 		 571 aa  57.8  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1445  putative cache sensor protein  30.65 
 
 		 192 aa  57.4  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1985  methyl-accepting chemotaxis protein (MCP)  27.03 
 
 		 715 aa  57.4  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0762  putative cache sensor protein  28.23 
 
 		 478 aa  57.4  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.197038  normal  0.180889 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2816  putative cache sensor protein  30.58 
 
 		 285 aa  57  0.00000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1769  hypothetical protein  28.69 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5230  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.42 
 
 		 518 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.530292  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4477  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 		 471 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4941  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.36 
 
 		 563 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.396774  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2874  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36 
 
 		 563 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.872696  normal  0.485865 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003135  sensor histidine kinase  40.48 
 
 		 451 aa  55.1  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.291514  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.27 
 
 		 486 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0704  hypothetical protein  31.82 
 
 		 553 aa  54.7  0.0000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41030  Periplasmic sensory histidine protein kinase, two-component  30.95 
 
 		 458 aa  54.3  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0649951  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0789  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.27 
 
 		 469 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0877  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 474 aa  54.3  0.0000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.858486  normal  0.37178 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0895  sensor histidine kinase  36.47 
 
 		 451 aa  53.9  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.622783  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3227  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.53 
 
 		 518 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.543154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0690  hypothetical protein  32.29 
 
 		 598 aa  54.3  0.0000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.321962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2989  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.94 
 
 		 1093 aa  53.9  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.653084  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2237  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.98 
 
 		 513 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2601  chemotaxis sensory transducer  30.77 
 
 		 569 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.441915  normal  0.36116 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2334  sensor histidine kinase  34.95 
 
 		 470 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.31 
 
 		 585 aa  53.5  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.38945  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0400  methyl-accepting chemotaxis protein  28 
 
 		 549 aa  53.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2799  putative methyl-accepting chemotaxis transmembrane protein  32.35 
 
 		 515 aa  52.8  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00825356  normal  0.849966 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3699  methyl-accepting chemotaxis protein  28.71 
 
 		 543 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3775  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.03 
 
 		 526 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.268134  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4001  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  32.95 
 
 		 585 aa  52.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0946714  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2947  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.27 
 
 		 749 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.732257  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2070  sensor histidine kinase  33.98 
 
 		 466 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1462  sensor kinase protein  33.98 
 
 		 466 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3247  putative sensor histidine kinase  33.98 
 
 		 466 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3575  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.79 
 
 		 475 aa  51.6  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2363  sensor histidine kinase  33.98 
 
 		 466 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3132  putative sensor histidine kinase  33.98 
 
 		 466 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3217  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  29.7 
 
 		 584 aa  51.6  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.480757 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1099  sensor histidine kinase  33.98 
 
 		 466 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1378  sensor histidine kinase  33.98 
 
 		 466 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.922617  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4964  methyl-accepting chemotaxis protein  27.08 
 
 		 545 aa  51.2  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1044  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.68 
 
 		 584 aa  51.6  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1294  Signal transduction histidine kinase-like  32.48 
 
 		 526 aa  51.6  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.212587  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1371  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  35.24 
 
 		 544 aa  51.6  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.116754  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3511  hypothetical protein  30 
 
 		 148 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.751588  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3858  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  29.05 
 
 		 526 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2273  hypothetical protein  29.7 
 
 		 148 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104576  normal  0.662685 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.98 
 
 		 567 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2596  methyl-accepting chemotaxis protein  28.69 
 
 		 564 aa  51.2  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000057467  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3718  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.35 
 
 		 526 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.734846  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0691  hypothetical protein  31.96 
 
 		 564 aa  50.8  0.000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.526813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6000  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.85 
 
 		 513 aa  50.4  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.292044 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.8 
 
 		 471 aa  50.4  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629472  normal  0.491206 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0906  sensor histidine kinase  32.38 
 
 		 469 aa  50.4  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0178022  hitchhiker  0.0000002134 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2344  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 480 aa  50.1  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.165919 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45810  hypothetical protein  28.1 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0632  chemotaxis sensory transducer  28.57 
 
 		 736 aa  50.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3780  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.73 
 
 		 517 aa  50.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0330596 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3901  cache type 2 domain-containing protein  30.49 
 
 		 343 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02702  histidine kinase  35.71 
 
 		 456 aa  50.1  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0673  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  28.57 
 
 		 533 aa  50.1  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.349323 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3836  Cache, type 2  33.78 
 
 		 661 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.337162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5641  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.24 
 
 		 519 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>