155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2286 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2286  cache type 2 domain-containing protein  100 
 
 		 320 aa  644    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1452  putative cache sensor protein  39.74 
 
 		 452 aa  207  2e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2473  cache type 2 domain-containing protein  40 
 
 		 551 aa  180  2e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1294  Signal transduction histidine kinase-like  35.14 
 
 		 526 aa  165  9e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.212587  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0762  putative cache sensor protein  34.18 
 
 		 478 aa  147  3e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.197038  normal  0.180889 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1642  hypothetical protein  32.73 
 
 		 521 aa  125  8.000000000000001e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0701  hypothetical protein  32.12 
 
 		 565 aa  125  1e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.385527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2563  putative cache sensor protein  38.33 
 
 		 189 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.800793 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0690  hypothetical protein  30.1 
 
 		 598 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.321962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0704  hypothetical protein  29.96 
 
 		 553 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0349  Signal transduction histidine kinase-like  44.29 
 
 		 181 aa  112  9e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.510339 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0702  hypothetical protein  29.35 
 
 		 564 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1908  cache type 2 domain-containing protein  39.38 
 
 		 183 aa  108  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0638  putative cache sensor protein  35.75 
 
 		 188 aa  104  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.05692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0691  hypothetical protein  27.82 
 
 		 564 aa  100  5e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.526813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1445  putative cache sensor protein  34.64 
 
 		 192 aa  98.2  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3066  cache type 2 domain-containing protein  29.12 
 
 		 549 aa  92  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1876  hypothetical protein  35.22 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0770276  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1252  cache type 2 domain-containing protein  29.26 
 
 		 302 aa  78.2  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.751516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0332  cache type 2 domain-containing protein  32.21 
 
 		 153 aa  73.9  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0349612  normal  0.499668 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1159  hypothetical protein  36.8 
 
 		 148 aa  68.2  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4477  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 		 471 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1528  cache type 2 domain-containing protein  33.85 
 
 		 129 aa  66.2  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2639  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.79 
 
 		 604 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.05 
 
 		 478 aa  65.5  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.304751 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 		 486 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0021  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  37.5 
 
 		 487 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.130425  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3405  histidine kinase  36.46 
 
 		 488 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.352666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3728  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.46 
 
 		 488 aa  63.2  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2070  sensor histidine kinase  35.42 
 
 		 466 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1462  sensor kinase protein  35.42 
 
 		 466 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1099  sensor histidine kinase  35.42 
 
 		 466 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1378  sensor histidine kinase  35.42 
 
 		 466 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.922617  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3247  putative sensor histidine kinase  35.42 
 
 		 466 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3132  putative sensor histidine kinase  35.42 
 
 		 466 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2363  sensor histidine kinase  35.42 
 
 		 466 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3522  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.88 
 
 		 477 aa  62.4  0.000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02702  histidine kinase  36.36 
 
 		 456 aa  62.4  0.000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 		 471 aa  62  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629472  normal  0.491206 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2109  cache, type 2  33.91 
 
 		 130 aa  62.4  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000614134  hitchhiker  0.00251106 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0674  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.37 
 
 		 447 aa  61.2  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.504244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1093  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.13 
 
 		 1721 aa  61.2  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.04 
 
 		 459 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.134921 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1261  sensor histidine kinase  33 
 
 		 467 aa  60.8  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.405254  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2366  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.54 
 
 		 560 aa  60.8  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.196109  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0789  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 		 469 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1027  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  34.02 
 
 		 456 aa  60.8  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.573227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3418  sensor histidine kinase  32.67 
 
 		 481 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.986219  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41030  Periplasmic sensory histidine protein kinase, two-component  35.71 
 
 		 458 aa  60.5  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0649951  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0027  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 		 461 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.755533 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2334  sensor histidine kinase  35.42 
 
 		 470 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5188  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.04 
 
 		 480 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5671  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.04 
 
 		 480 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0241273 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0917  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  35.35 
 
 		 602 aa  59.3  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0520327 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0162  hypothetical protein  42.03 
 
 		 98 aa  58.9  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.976262 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0084  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.16 
 
 		 449 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0895  sensor histidine kinase  35.09 
 
 		 451 aa  58.9  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.622783  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0304  putative cache sensor protein  34.43 
 
 		 152 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.333934 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4564  histidine kinase  34.04 
 
 		 460 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.562879  normal  0.0736505 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1261  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.11 
 
 		 654 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3161  cache domain-contain protein  29.11 
 
 		 152 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.535779  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1423  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.7 
 
 		 584 aa  58.2  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4945  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.98 
 
 		 459 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0549839 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003135  sensor histidine kinase  35.35 
 
 		 451 aa  58.2  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.291514  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5497  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.98 
 
 		 459 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170786 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3575  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 475 aa  57.4  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0086  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  32.8 
 
 		 599 aa  57.4  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6398  histidine kinase  32.29 
 
 		 461 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.176497 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4528  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 		 461 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25442  normal  0.575982 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3277  Cache type 2 domain protein  29.58 
 
 		 152 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0890612  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1510  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  30.61 
 
 		 574 aa  55.1  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00534894  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3246  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.48 
 
 		 601 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.416407  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2738  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.08 
 
 		 562 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.809654  normal  0.020868 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3993  histidine kinase  32.99 
 
 		 456 aa  53.9  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2880  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.38 
 
 		 558 aa  53.9  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0166  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  29.91 
 
 		 601 aa  53.5  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3261  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 613 aa  53.1  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0906  sensor histidine kinase  33.65 
 
 		 469 aa  52.8  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0178022  hitchhiker  0.0000002134 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2816  putative cache sensor protein  27.07 
 
 		 285 aa  52.4  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0772  cache, type 2 domain protein  28.95 
 
 		 151 aa  52.4  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1009  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  32.98 
 
 		 569 aa  52  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.103849  normal  0.0253995 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0357  sensor histidine kinase  31.25 
 
 		 459 aa  52  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1783  histidine kinase  32.22 
 
 		 501 aa  52.4  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211372 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4280  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.61 
 
 		 563 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1869  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  33.68 
 
 		 607 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1405  sensor histidine kinase  31.96 
 
 		 483 aa  50.8  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3532  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 555 aa  50.8  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0877  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.42 
 
 		 474 aa  50.4  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.858486  normal  0.37178 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1708  Cache, type 2  31.46 
 
 		 153 aa  49.7  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0920811 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0640  hypothetical protein  39.68 
 
 		 113 aa  49.7  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0398047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0581  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 554 aa  49.7  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2220  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  34.34 
 
 		 971 aa  49.7  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00060546  normal  0.0976665 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3308  diguanylate cyclase  32.35 
 
 		 603 aa  49.7  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000660005  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 485 aa  50.1  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12569  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1794  hypothetical protein  27.1 
 
 		 168 aa  49.7  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3601  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  33.33 
 
 		 554 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3240  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29 
 
 		 668 aa  48.5  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000648214  normal  0.034513 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3200  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.22 
 
 		 554 aa  48.9  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3666  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 554 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3789  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 554 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>