191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1452 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1452  putative cache sensor protein  100 
 
 		 452 aa  926    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0762  putative cache sensor protein  32.97 
 
 		 478 aa  216  9e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.197038  normal  0.180889 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1908  cache type 2 domain-containing protein  58.1 
 
 		 183 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2286  cache type 2 domain-containing protein  40.06 
 
 		 320 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2563  putative cache sensor protein  51.93 
 
 		 189 aa  199  7e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.800793 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2473  cache type 2 domain-containing protein  41.13 
 
 		 551 aa  196  1e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1445  putative cache sensor protein  51.41 
 
 		 192 aa  182  1e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0638  putative cache sensor protein  47.43 
 
 		 188 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.05692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1294  Signal transduction histidine kinase-like  32.49 
 
 		 526 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.212587  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0349  Signal transduction histidine kinase-like  61.98 
 
 		 181 aa  161  3e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.510339 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0690  hypothetical protein  34.21 
 
 		 598 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.321962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1642  hypothetical protein  34.3 
 
 		 521 aa  147  5e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0702  hypothetical protein  31.01 
 
 		 564 aa  143  8e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0691  hypothetical protein  37.66 
 
 		 564 aa  142  9e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.526813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0701  hypothetical protein  29.85 
 
 		 565 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.385527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0704  hypothetical protein  33.46 
 
 		 553 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3066  cache type 2 domain-containing protein  27.98 
 
 		 549 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1252  cache type 2 domain-containing protein  28.73 
 
 		 302 aa  102  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.751516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2816  putative cache sensor protein  32.44 
 
 		 285 aa  99.8  9e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1876  hypothetical protein  42.62 
 
 		 152 aa  94.4  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0770276  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0332  cache type 2 domain-containing protein  39.64 
 
 		 153 aa  92.8  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0349612  normal  0.499668 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3161  cache domain-contain protein  38.24 
 
 		 152 aa  89.7  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.535779  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3277  Cache type 2 domain protein  36.03 
 
 		 152 aa  84.7  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0890612  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1093  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.7 
 
 		 1721 aa  82  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2242  hypothetical protein  28.39 
 
 		 305 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.184581  hitchhiker  0.000000000000117809 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.33 
 
 		 701 aa  77  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000562313  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1159  hypothetical protein  35.45 
 
 		 148 aa  75.1  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0304  putative cache sensor protein  33.58 
 
 		 152 aa  74.3  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.333934 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0640  hypothetical protein  52.38 
 
 		 113 aa  72.4  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0398047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1528  cache type 2 domain-containing protein  35.29 
 
 		 129 aa  72  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2109  cache, type 2  36.29 
 
 		 130 aa  70.9  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000614134  hitchhiker  0.00251106 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3522  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 477 aa  66.2  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1708  Cache, type 2  32.79 
 
 		 153 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0920811 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0162  hypothetical protein  46.03 
 
 		 98 aa  64.7  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.976262 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1423  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.71 
 
 		 584 aa  64.7  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2350  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.29 
 
 		 515 aa  63.9  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2486  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.62 
 
 		 504 aa  63.9  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.961139  normal  0.110025 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3405  histidine kinase  36.26 
 
 		 488 aa  62  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.352666  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1261  sensor histidine kinase  36.36 
 
 		 467 aa  61.6  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.405254  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1642  cache type 2 domain-containing protein  26.12 
 
 		 146 aa  61.6  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000155098  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2070  sensor histidine kinase  34.48 
 
 		 466 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1462  sensor kinase protein  34.48 
 
 		 466 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0906  sensor histidine kinase  31.19 
 
 		 469 aa  61.2  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0178022  hitchhiker  0.0000002134 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2363  sensor histidine kinase  34.48 
 
 		 466 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3728  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.16 
 
 		 488 aa  60.8  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1099  sensor histidine kinase  34.48 
 
 		 466 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1378  sensor histidine kinase  34.48 
 
 		 466 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.922617  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3247  putative sensor histidine kinase  34.48 
 
 		 466 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3132  putative sensor histidine kinase  34.48 
 
 		 466 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0021  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  35.16 
 
 		 487 aa  60.5  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.130425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3200  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.02 
 
 		 554 aa  60.8  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2364  cache type 2 domain-containing protein  32.28 
 
 		 160 aa  60.5  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2334  sensor histidine kinase  34.48 
 
 		 470 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1783  histidine kinase  35.63 
 
 		 501 aa  60.5  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211372 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02702  histidine kinase  35.64 
 
 		 456 aa  60.5  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1027  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  33.33 
 
 		 456 aa  60.1  0.00000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.573227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0772  cache, type 2 domain protein  32.77 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0824  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.41 
 
 		 554 aa  60.1  0.00000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00067966 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3199  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.41 
 
 		 554 aa  60.1  0.00000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.927661 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0581  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.78 
 
 		 554 aa  59.7  0.00000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3299  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.41 
 
 		 554 aa  60.1  0.00000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3601  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  33.33 
 
 		 554 aa  59.7  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3052  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.41 
 
 		 554 aa  59.7  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1888  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32 
 
 		 487 aa  59.3  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3666  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 554 aa  59.7  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3789  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 554 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 554 aa  59.7  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0630  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 554 aa  59.7  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3491  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 554 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0641  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 568 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0987  methyl-accepting chemotaxis protein  33.33 
 
 		 554 aa  58.5  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0027  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 		 461 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.755533 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1646  diguanylate cyclase  25.21 
 
 		 580 aa  58.9  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000165959  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5497  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 		 459 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170786 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5188  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 		 480 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4945  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 		 459 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0549839 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4564  histidine kinase  34.48 
 
 		 460 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.562879  normal  0.0736505 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5671  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 		 480 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0241273 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2065  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.2 
 
 		 554 aa  58.5  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.460232  normal  0.464376 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 486 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1261  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  25 
 
 		 654 aa  58.2  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4477  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.56 
 
 		 471 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 478 aa  57.4  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.304751 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3993  histidine kinase  34.07 
 
 		 456 aa  57.4  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1794  hypothetical protein  33.87 
 
 		 168 aa  57  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3532  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.58 
 
 		 555 aa  57.4  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1715  hypothetical protein  30.16 
 
 		 151 aa  57  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0227611  normal  0.523463 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0789  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 		 469 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3617  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.18 
 
 		 554 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.964358 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0357  sensor histidine kinase  35.16 
 
 		 459 aa  56.2  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2947  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25 
 
 		 749 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.732257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3494  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.26 
 
 		 554 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3418  sensor histidine kinase  32.97 
 
 		 481 aa  55.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.986219  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0895  sensor histidine kinase  36.67 
 
 		 451 aa  55.8  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.622783  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4528  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.16 
 
 		 461 aa  55.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25442  normal  0.575982 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 		 459 aa  55.5  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.134921 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3422  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  31.18 
 
 		 554 aa  55.5  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3575  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.69 
 
 		 475 aa  55.1  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.58 
 
 		 471 aa  55.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629472  normal  0.491206 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0870  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.18 
 
 		 554 aa  55.5  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0571565  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>