230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1528 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1528  cache type 2 domain-containing protein  100 
 
 		 129 aa  268  2.9999999999999997e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2109  cache, type 2  56.35 
 
 		 130 aa  170  5.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000614134  hitchhiker  0.00251106 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1252  cache type 2 domain-containing protein  49.59 
 
 		 302 aa  137  3.9999999999999997e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.751516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1159  hypothetical protein  46.83 
 
 		 148 aa  129  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0304  putative cache sensor protein  39.34 
 
 		 152 aa  111  3e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.333934 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2364  cache type 2 domain-containing protein  38.52 
 
 		 160 aa  105  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1708  Cache, type 2  40.32 
 
 		 153 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0920811 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0332  cache type 2 domain-containing protein  42.24 
 
 		 153 aa  103  7e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0349612  normal  0.499668 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3161  cache domain-contain protein  35.54 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.535779  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1715  hypothetical protein  40.32 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0227611  normal  0.523463 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3277  Cache type 2 domain protein  34.71 
 
 		 152 aa  99.4  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0890612  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4272  Cache type 2 domain protein  37.9 
 
 		 151 aa  98.2  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.819687  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.48 
 
 		 499 aa  97.8  5e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.729026  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3582  Cache, type 2  36.29 
 
 		 151 aa  97.8  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.351306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1093  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.7 
 
 		 1721 aa  95.9  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1876  hypothetical protein  34.4 
 
 		 152 aa  93.2  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0770276  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2563  putative cache sensor protein  34.88 
 
 		 189 aa  87.8  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.800793 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0772  cache, type 2 domain protein  29.69 
 
 		 151 aa  85.9  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2242  hypothetical protein  33.33 
 
 		 305 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.184581  hitchhiker  0.000000000000117809 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1642  cache type 2 domain-containing protein  30.65 
 
 		 146 aa  74.3  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000155098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1445  putative cache sensor protein  34.45 
 
 		 192 aa  72.8  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1452  putative cache sensor protein  35.29 
 
 		 452 aa  71.6  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0638  putative cache sensor protein  33.88 
 
 		 188 aa  71.2  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.05692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1908  cache type 2 domain-containing protein  33.61 
 
 		 183 aa  69.3  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2816  putative cache sensor protein  30.58 
 
 		 285 aa  66.6  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2174  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.36 
 
 		 544 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00506259 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1253  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.29 
 
 		 567 aa  64.3  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.010155 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4480  hypothetical protein  31.91 
 
 		 282 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109317 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3066  cache type 2 domain-containing protein  32.14 
 
 		 549 aa  63.5  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0349  Signal transduction histidine kinase-like  30.58 
 
 		 181 aa  62.4  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.510339 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2342  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.15 
 
 		 508 aa  62  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.10605  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0701  hypothetical protein  33.33 
 
 		 565 aa  61.6  0.000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.385527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2486  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.24 
 
 		 504 aa  61.2  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.961139  normal  0.110025 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2286  cache type 2 domain-containing protein  33.85 
 
 		 320 aa  59.3  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4280  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.57 
 
 		 563 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0762  putative cache sensor protein  29.41 
 
 		 478 aa  58.5  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.197038  normal  0.180889 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1918  putative cache sensor protein  32.63 
 
 		 632 aa  58.5  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.149363  normal  0.217415 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2065  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.33 
 
 		 554 aa  57.4  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.460232  normal  0.464376 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6164  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.08 
 
 		 544 aa  57  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0166  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  35.87 
 
 		 601 aa  56.2  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2891  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.21 
 
 		 521 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.657214  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0469  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.08 
 
 		 549 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2751  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.21 
 
 		 521 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1888  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.51 
 
 		 487 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3993  histidine kinase  31.09 
 
 		 456 aa  55.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1642  hypothetical protein  29.75 
 
 		 521 aa  55.5  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2728  chemotaxis sensory transducer  38.57 
 
 		 544 aa  55.1  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00837045  normal  0.306222 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.46 
 
 		 486 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2473  cache type 2 domain-containing protein  30.71 
 
 		 551 aa  54.7  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2845  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.96 
 
 		 545 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.788597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.29 
 
 		 567 aa  54.7  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.23 
 
 		 510 aa  54.3  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.96 
 
 		 545 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2834  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.96 
 
 		 545 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3728  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.49 
 
 		 488 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.72 
 
 		 564 aa  54.3  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2874  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.9 
 
 		 563 aa  53.9  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.872696  normal  0.485865 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1048  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.56 
 
 		 559 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.165383 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4159  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.21 
 
 		 611 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1776  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  30.91 
 
 		 543 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.363817 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1371  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  43.08 
 
 		 544 aa  52.8  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.116754  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.44 
 
 		 471 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629472  normal  0.491206 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0557  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.05 
 
 		 627 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.191348  normal  0.480006 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3405  histidine kinase  35.14 
 
 		 488 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.352666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2334  sensor histidine kinase  35.56 
 
 		 470 aa  53.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2920  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.05 
 
 		 544 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0289  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.57 
 
 		 598 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.759991 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3699  methyl-accepting chemotaxis protein  29.66 
 
 		 543 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 557 aa  52.4  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.418138 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0632  chemotaxis sensory transducer  30.23 
 
 		 736 aa  52.4  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4941  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.71 
 
 		 563 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.396774  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0702  hypothetical protein  29.17 
 
 		 564 aa  52.8  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2220  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  33.33 
 
 		 971 aa  52.4  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00060546  normal  0.0976665 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0895  sensor histidine kinase  34.09 
 
 		 451 aa  52.4  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.622783  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1027  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  34.29 
 
 		 456 aa  52  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.573227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1378  sensor histidine kinase  35.71 
 
 		 466 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.922617  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2070  sensor histidine kinase  35.71 
 
 		 466 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1462  sensor kinase protein  35.71 
 
 		 466 aa  51.6  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003135  sensor histidine kinase  37.08 
 
 		 451 aa  51.6  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.291514  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3247  putative sensor histidine kinase  35.71 
 
 		 466 aa  51.6  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3132  putative sensor histidine kinase  35.71 
 
 		 466 aa  51.6  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2363  sensor histidine kinase  35.71 
 
 		 466 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1130  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  31.43 
 
 		 571 aa  52  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1423  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.88 
 
 		 584 aa  52  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1099  sensor histidine kinase  35.71 
 
 		 466 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2601  chemotaxis sensory transducer  28.97 
 
 		 569 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.441915  normal  0.36116 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2757  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.88 
 
 		 544 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001822  methyl-accepting chemotaxis protein  30 
 
 		 557 aa  51.6  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000124429  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41030  Periplasmic sensory histidine protein kinase, two-component  30.68 
 
 		 458 aa  50.8  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0649951  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4188  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  33.68 
 
 		 566 aa  50.8  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.210427  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2628  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.41 
 
 		 515 aa  50.8  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0020256  hitchhiker  0.000579335 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1261  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  29.35 
 
 		 654 aa  50.4  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0704  hypothetical protein  28.79 
 
 		 553 aa  50.4  0.000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5497  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 459 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170786 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3184  methyl-accepting chemotaxis protein  33.71 
 
 		 511 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0520  methyl-accepting chemotaxis protein  33.71 
 
 		 546 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.640738  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2862  methyl-accepting chemotaxis protein  33.71 
 
 		 546 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0157  methyl-accepting chemotaxis protein  33.71 
 
 		 546 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.293853  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1435  methyl-accepting chemotaxis protein  33.71 
 
 		 546 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.631191  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0502  methyl-accepting chemotaxis protein  33.71 
 
 		 546 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>