213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1252 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1252  cache type 2 domain-containing protein  100 
 
 		 302 aa  628  1e-179  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.751516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2109  cache, type 2  51.2 
 
 		 130 aa  150  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000614134  hitchhiker  0.00251106 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1528  cache type 2 domain-containing protein  49.59 
 
 		 129 aa  137  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0332  cache type 2 domain-containing protein  42.15 
 
 		 153 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0349612  normal  0.499668 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2242  hypothetical protein  25.86 
 
 		 305 aa  104  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.184581  hitchhiker  0.000000000000117809 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1452  putative cache sensor protein  28.73 
 
 		 452 aa  102  6e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0304  putative cache sensor protein  39.02 
 
 		 152 aa  102  8e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.333934 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1708  Cache, type 2  34.53 
 
 		 153 aa  93.6  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0920811 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1159  hypothetical protein  38.33 
 
 		 148 aa  93.6  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2364  cache type 2 domain-containing protein  37.7 
 
 		 160 aa  93.2  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3277  Cache type 2 domain protein  35.48 
 
 		 152 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0890612  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1876  hypothetical protein  38.76 
 
 		 152 aa  90.5  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0770276  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3161  cache domain-contain protein  33.87 
 
 		 152 aa  90.1  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.535779  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2816  putative cache sensor protein  24.48 
 
 		 285 aa  88.2  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.8 
 
 		 499 aa  88.2  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.729026  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4272  Cache type 2 domain protein  33.33 
 
 		 151 aa  86.3  6e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.819687  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3582  Cache, type 2  33.33 
 
 		 151 aa  86.3  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.351306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0772  cache, type 2 domain protein  33.87 
 
 		 151 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1715  hypothetical protein  31.71 
 
 		 151 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0227611  normal  0.523463 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1093  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.81 
 
 		 1721 aa  82  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3066  cache type 2 domain-containing protein  25.27 
 
 		 549 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2563  putative cache sensor protein  38.68 
 
 		 189 aa  77  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.800793 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1908  cache type 2 domain-containing protein  42.31 
 
 		 183 aa  75.9  0.0000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2286  cache type 2 domain-containing protein  29.92 
 
 		 320 aa  75.9  0.0000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0690  hypothetical protein  23.13 
 
 		 598 aa  73.6  0.000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.321962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4480  hypothetical protein  23 
 
 		 282 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109317 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0762  putative cache sensor protein  26.14 
 
 		 478 aa  71.6  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.197038  normal  0.180889 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0349  Signal transduction histidine kinase-like  33.8 
 
 		 181 aa  67  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.510339 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1642  hypothetical protein  21.91 
 
 		 521 aa  67  0.0000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2174  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.14 
 
 		 544 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00506259 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1253  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.21 
 
 		 567 aa  65.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.010155 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0638  putative cache sensor protein  36.13 
 
 		 188 aa  65.1  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.05692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2473  cache type 2 domain-containing protein  24.37 
 
 		 551 aa  64.3  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1445  putative cache sensor protein  35.85 
 
 		 192 aa  64.3  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3600  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.03 
 
 		 546 aa  61.2  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.16 
 
 		 567 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3709  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  31.72 
 
 		 546 aa  60.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2486  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.64 
 
 		 504 aa  60.5  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.961139  normal  0.110025 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1048  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.63 
 
 		 559 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.165383 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0701  hypothetical protein  26.52 
 
 		 565 aa  60.5  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.385527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2342  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.73 
 
 		 508 aa  59.7  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.10605  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1642  cache type 2 domain-containing protein  27.27 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000155098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3775  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.2 
 
 		 526 aa  59.3  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.268134  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2601  chemotaxis sensory transducer  36.54 
 
 		 569 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.441915  normal  0.36116 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1776  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  35.78 
 
 		 543 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.363817 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4280  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.83 
 
 		 563 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0691  hypothetical protein  30 
 
 		 564 aa  57.8  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.526813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3718  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.43 
 
 		 526 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.734846  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3858  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  29.66 
 
 		 526 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4941  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 563 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.396774  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1918  putative cache sensor protein  29.9 
 
 		 632 aa  56.6  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.149363  normal  0.217415 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2220  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  34.07 
 
 		 971 aa  56.6  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00060546  normal  0.0976665 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5034  cache type 2 domain-containing protein  29.86 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.985276 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0702  hypothetical protein  29.08 
 
 		 564 aa  56.6  0.0000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2874  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.61 
 
 		 563 aa  55.8  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.872696  normal  0.485865 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2920  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.71 
 
 		 544 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4188  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  33.65 
 
 		 566 aa  55.8  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.210427  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0673  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  31.47 
 
 		 533 aa  55.5  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.349323 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0704  hypothetical protein  31.96 
 
 		 553 aa  55.1  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0962  sensor histidine kinase  32.77 
 
 		 655 aa  54.3  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3699  methyl-accepting chemotaxis protein  28.91 
 
 		 543 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3901  cache type 2 domain-containing protein  34.78 
 
 		 343 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2765  amino acid ABC transporter periplasmic protein  31.25 
 
 		 401 aa  54.7  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2757  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.71 
 
 		 544 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2847  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  28.57 
 
 		 1089 aa  53.5  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000851175  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3405  histidine kinase  32.97 
 
 		 488 aa  53.5  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.352666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1371  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  33.33 
 
 		 544 aa  53.5  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.116754  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2947  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.68 
 
 		 749 aa  53.5  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.732257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1044  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.58 
 
 		 584 aa  53.1  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3728  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 		 488 aa  53.5  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3544  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.98 
 
 		 541 aa  53.1  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.256262  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4823  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.98 
 
 		 541 aa  53.1  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0701  Cache sensor signal transduction histidine kinase  35.23 
 
 		 655 aa  52.8  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.831837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1078  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 587 aa  52.8  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101669 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5460  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.98 
 
 		 517 aa  52.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.601436  normal  0.166688 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0632  chemotaxis sensory transducer  30.34 
 
 		 736 aa  52.8  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1366  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  29.08 
 
 		 1088 aa  52.8  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000517956 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.09 
 
 		 564 aa  52.4  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6000  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.2 
 
 		 513 aa  52  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.292044 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3217  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  31.63 
 
 		 584 aa  51.6  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.480757 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2065  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.89 
 
 		 554 aa  52  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.460232  normal  0.464376 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.89 
 
 		 544 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4727  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.03 
 
 		 517 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.308358 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.98 
 
 		 557 aa  51.2  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.418138 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1422  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 655 aa  51.2  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000957952  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0881  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.74 
 
 		 517 aa  51.2  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.284562 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03718  putative chemotaxis sensory protein  31.82 
 
 		 540 aa  51.2  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4204  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.03 
 
 		 517 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.305878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6950  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  35.87 
 
 		 661 aa  51.2  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1027  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  27.18 
 
 		 456 aa  50.8  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.573227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1888  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.65 
 
 		 487 aa  50.8  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1294  Signal transduction histidine kinase-like  30 
 
 		 526 aa  50.8  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.212587  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1766  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32 
 
 		 575 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.74 
 
 		 787 aa  50.4  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000288595  normal  0.31948 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2728  chemotaxis sensory transducer  32.65 
 
 		 544 aa  50.1  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00837045  normal  0.306222 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2751  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 521 aa  50.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2237  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.16 
 
 		 513 aa  50.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2989  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 1093 aa  50.4  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.653084  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2891  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 521 aa  50.4  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.657214  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2392  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.74 
 
 		 787 aa  50.4  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.467356  normal  0.0918963 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>