177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2109 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2109  cache, type 2  100 
 
 		 130 aa  268  1e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000614134  hitchhiker  0.00251106 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1528  cache type 2 domain-containing protein  56.35 
 
 		 129 aa  170  5.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1252  cache type 2 domain-containing protein  51.2 
 
 		 302 aa  150  4e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.751516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0304  putative cache sensor protein  39.2 
 
 		 152 aa  105  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.333934 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0332  cache type 2 domain-containing protein  42.15 
 
 		 153 aa  104  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0349612  normal  0.499668 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1159  hypothetical protein  38.28 
 
 		 148 aa  101  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1708  Cache, type 2  37.4 
 
 		 153 aa  98.2  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0920811 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3161  cache domain-contain protein  36.59 
 
 		 152 aa  97.8  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.535779  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3277  Cache type 2 domain protein  35.77 
 
 		 152 aa  95.9  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0890612  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.32 
 
 		 499 aa  93.6  9e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.729026  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1093  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.48 
 
 		 1721 aa  92.4  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2364  cache type 2 domain-containing protein  36.07 
 
 		 160 aa  92  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1876  hypothetical protein  37.5 
 
 		 152 aa  91.3  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0770276  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1715  hypothetical protein  34.96 
 
 		 151 aa  87  9e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0227611  normal  0.523463 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4272  Cache type 2 domain protein  32.8 
 
 		 151 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.819687  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0772  cache, type 2 domain protein  37.4 
 
 		 151 aa  85.5  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2563  putative cache sensor protein  38.74 
 
 		 189 aa  84.7  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.800793 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3582  Cache, type 2  31.71 
 
 		 151 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.351306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1908  cache type 2 domain-containing protein  34.78 
 
 		 183 aa  75.1  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2242  hypothetical protein  32.26 
 
 		 305 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.184581  hitchhiker  0.000000000000117809 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0638  putative cache sensor protein  34.23 
 
 		 188 aa  72  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.05692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1452  putative cache sensor protein  36.67 
 
 		 452 aa  70.9  0.000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0349  Signal transduction histidine kinase-like  34.23 
 
 		 181 aa  69.7  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.510339 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1642  hypothetical protein  37.9 
 
 		 521 aa  68.2  0.00000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2342  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.07 
 
 		 508 aa  67.4  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.10605  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0701  hypothetical protein  39.22 
 
 		 565 aa  67  0.00000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.385527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2816  putative cache sensor protein  27.73 
 
 		 285 aa  65.9  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1445  putative cache sensor protein  36.04 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2065  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.65 
 
 		 554 aa  63.9  0.0000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.460232  normal  0.464376 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1888  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.65 
 
 		 487 aa  63.5  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0762  putative cache sensor protein  33.33 
 
 		 478 aa  62  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.197038  normal  0.180889 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2486  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.41 
 
 		 504 aa  61.2  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.961139  normal  0.110025 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0704  hypothetical protein  36 
 
 		 553 aa  60.8  0.000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0702  hypothetical protein  35.34 
 
 		 564 aa  60.1  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2473  cache type 2 domain-containing protein  32.28 
 
 		 551 aa  59.7  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3066  cache type 2 domain-containing protein  33.7 
 
 		 549 aa  60.1  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1253  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.29 
 
 		 567 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.010155 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1642  cache type 2 domain-containing protein  25.22 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000155098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2174  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.66 
 
 		 544 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00506259 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2286  cache type 2 domain-containing protein  34.23 
 
 		 320 aa  57  0.00000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0690  hypothetical protein  32.54 
 
 		 598 aa  56.2  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.321962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3618  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32 
 
 		 512 aa  56.6  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0151839  normal  0.0370629 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0691  hypothetical protein  33.33 
 
 		 564 aa  56.2  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.526813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2141  chemotaxis sensory transducer  41.03 
 
 		 708 aa  55.1  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.49 
 
 		 564 aa  55.5  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1294  Signal transduction histidine kinase-like  32.77 
 
 		 526 aa  54.3  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.212587  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.7 
 
 		 557 aa  54.3  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.418138 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4480  hypothetical protein  27.34 
 
 		 282 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109317 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2751  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.91 
 
 		 521 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3836  Cache, type 2  34.41 
 
 		 661 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.337162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2891  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.91 
 
 		 521 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.657214  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0469  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.91 
 
 		 549 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3184  methyl-accepting chemotaxis protein  32.88 
 
 		 511 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0685  methyl-accepting chemotaxis protein  32.88 
 
 		 526 aa  51.6  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0166  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  33.33 
 
 		 601 aa  51.6  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0157  methyl-accepting chemotaxis protein  32.88 
 
 		 546 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.293853  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1435  methyl-accepting chemotaxis protein  32.88 
 
 		 546 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.631191  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0502  methyl-accepting chemotaxis protein  32.88 
 
 		 546 aa  51.6  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0520  methyl-accepting chemotaxis protein  32.88 
 
 		 546 aa  51.6  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.640738  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2862  methyl-accepting chemotaxis protein  32.88 
 
 		 546 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5034  cache type 2 domain-containing protein  28.72 
 
 		 169 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.985276 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6164  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.84 
 
 		 544 aa  51.2  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2350  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.19 
 
 		 515 aa  51.2  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3993  histidine kinase  34.29 
 
 		 456 aa  51.6  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3728  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 		 488 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3405  histidine kinase  32.43 
 
 		 488 aa  50.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.352666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0438  methyl-accepting chemotaxis protein  31.51 
 
 		 512 aa  50.4  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.212381  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003135  sensor histidine kinase  34.67 
 
 		 451 aa  50.4  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.291514  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3699  methyl-accepting chemotaxis protein  27.88 
 
 		 543 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2845  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.85 
 
 		 545 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.788597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.85 
 
 		 545 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2834  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.85 
 
 		 545 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0895  sensor histidine kinase  31.58 
 
 		 451 aa  49.7  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.622783  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0289  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.56 
 
 		 598 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.759991 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45810  hypothetical protein  30.89 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2874  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.08 
 
 		 563 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.872696  normal  0.485865 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3112  chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 541 aa  48.5  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4280  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.4 
 
 		 563 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001822  methyl-accepting chemotaxis protein  27.66 
 
 		 557 aa  48.9  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000124429  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1048  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.23 
 
 		 559 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.165383 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0673  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  28.72 
 
 		 533 aa  48.1  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.349323 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2601  chemotaxis sensory transducer  28.81 
 
 		 569 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.441915  normal  0.36116 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1371  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  33.75 
 
 		 544 aa  48.1  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.116754  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.38 
 
 		 579 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0132835 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4188  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  28.72 
 
 		 566 aa  47.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.210427  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3775  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.22 
 
 		 526 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.268134  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0557  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.86 
 
 		 627 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.191348  normal  0.480006 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1776  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  27.88 
 
 		 543 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.363817 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2734  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.06 
 
 		 751 aa  47.4  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.57 
 
 		 567 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2643  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.77 
 
 		 541 aa  47.4  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0238907  normal  0.0164957 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0701  Cache sensor signal transduction histidine kinase  34.72 
 
 		 655 aa  47  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.831837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3718  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.22 
 
 		 526 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.734846  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02702  histidine kinase  30.67 
 
 		 456 aa  46.6  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4528  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 461 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25442  normal  0.575982 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2728  chemotaxis sensory transducer  30 
 
 		 544 aa  47  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00837045  normal  0.306222 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2920  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.88 
 
 		 544 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3261  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.21 
 
 		 613 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2273  hypothetical protein  29.13 
 
 		 148 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104576  normal  0.662685 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2220  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  32.88 
 
 		 971 aa  47  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00060546  normal  0.0976665 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>