201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0690 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0690  hypothetical protein  100 
 
 		 598 aa  1247    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.321962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0702  hypothetical protein  49.03 
 
 		 564 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0691  hypothetical protein  47.17 
 
 		 564 aa  529  1e-149  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.526813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1642  hypothetical protein  50.57 
 
 		 521 aa  531  1e-149  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0701  hypothetical protein  47.26 
 
 		 565 aa  525  1e-148  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.385527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0704  hypothetical protein  43.75 
 
 		 553 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2473  cache type 2 domain-containing protein  30.85 
 
 		 551 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1294  Signal transduction histidine kinase-like  34.13 
 
 		 526 aa  236  9e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.212587  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1452  putative cache sensor protein  34.21 
 
 		 452 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0762  putative cache sensor protein  31.23 
 
 		 478 aa  126  1e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.197038  normal  0.180889 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0638  putative cache sensor protein  46.1 
 
 		 188 aa  123  8e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.05692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2286  cache type 2 domain-containing protein  30.1 
 
 		 320 aa  108  3e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2563  putative cache sensor protein  45.08 
 
 		 189 aa  107  5e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.800793 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1908  cache type 2 domain-containing protein  44.72 
 
 		 183 aa  102  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0349  Signal transduction histidine kinase-like  36.13 
 
 		 181 aa  98.2  4e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.510339 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1445  putative cache sensor protein  39.86 
 
 		 192 aa  96.3  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1876  hypothetical protein  38.4 
 
 		 152 aa  84  0.000000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0770276  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1002  hypothetical protein  32.9 
 
 		 298 aa  82  0.00000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.204123  normal  0.271191 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4477  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.33 
 
 		 471 aa  73.9  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3418  sensor histidine kinase  41.84 
 
 		 481 aa  73.6  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.986219  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1252  cache type 2 domain-containing protein  23.13 
 
 		 302 aa  73.6  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.751516  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1261  sensor histidine kinase  40.23 
 
 		 467 aa  72  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.405254  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.2 
 
 		 486 aa  72  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0789  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.2 
 
 		 469 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2754  hypothetical protein  26.3 
 
 		 310 aa  71.2  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.33 
 
 		 471 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629472  normal  0.491206 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3575  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.2 
 
 		 475 aa  70.9  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0332  cache type 2 domain-containing protein  35.54 
 
 		 153 aa  70.1  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0349612  normal  0.499668 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0906  sensor histidine kinase  36.78 
 
 		 469 aa  67.8  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0178022  hitchhiker  0.0000002134 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1237  methyl-accepting chemotaxis protein  30 
 
 		 267 aa  67.8  0.0000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0609367 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0021  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  35.96 
 
 		 487 aa  66.2  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.130425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1423  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.16 
 
 		 584 aa  65.5  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3522  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 		 477 aa  64.7  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2334  sensor histidine kinase  31.5 
 
 		 470 aa  64.3  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.63 
 
 		 478 aa  64.3  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.304751 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0895  sensor histidine kinase  34.21 
 
 		 451 aa  63.9  0.000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.622783  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0772  cache, type 2 domain protein  33.87 
 
 		 151 aa  63.5  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003135  sensor histidine kinase  37.08 
 
 		 451 aa  63.2  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.291514  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0059  Extracellular ligand-binding receptor  25.87 
 
 		 599 aa  63.5  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2070  sensor histidine kinase  30.71 
 
 		 466 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3728  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.44 
 
 		 488 aa  62.4  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1462  sensor kinase protein  30.71 
 
 		 466 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5188  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.71 
 
 		 480 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5671  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.71 
 
 		 480 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0241273 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1783  histidine kinase  33.33 
 
 		 501 aa  62.4  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211372 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0113  chemotaxis sensory transducer  33.64 
 
 		 563 aa  62.4  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1099  sensor histidine kinase  30.71 
 
 		 466 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1378  sensor histidine kinase  30.71 
 
 		 466 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.922617  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3405  histidine kinase  34.44 
 
 		 488 aa  62.4  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.352666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3247  putative sensor histidine kinase  30.71 
 
 		 466 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3132  putative sensor histidine kinase  30.71 
 
 		 466 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2363  sensor histidine kinase  30.71 
 
 		 466 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0027  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.71 
 
 		 461 aa  62  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.755533 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0616  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  36.21 
 
 		 908 aa  62  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0119428 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1027  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  33.71 
 
 		 456 aa  61.6  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.573227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 		 459 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.134921 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0674  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.69 
 
 		 447 aa  61.6  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.504244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4564  histidine kinase  33.71 
 
 		 460 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.562879  normal  0.0736505 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3052  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.62 
 
 		 554 aa  61.6  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5497  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.71 
 
 		 459 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170786 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4945  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.71 
 
 		 459 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0549839 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3217  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  32.58 
 
 		 584 aa  60.5  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.480757 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0824  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.96 
 
 		 554 aa  60.1  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00067966 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3199  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.78 
 
 		 554 aa  59.7  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.927661 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0112  chemotaxis sensory transducer  33 
 
 		 563 aa  59.7  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1267  methyl-accepting chemotaxis protein  28.14 
 
 		 557 aa  59.3  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3246  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.63 
 
 		 601 aa  59.3  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.416407  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3161  cache domain-contain protein  28.68 
 
 		 152 aa  59.3  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.535779  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1093  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.03 
 
 		 1721 aa  58.9  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2816  putative cache sensor protein  25.27 
 
 		 285 aa  58.9  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3299  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.78 
 
 		 554 aa  59.7  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2880  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.99 
 
 		 558 aa  59.3  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0987  methyl-accepting chemotaxis protein  35.63 
 
 		 554 aa  58.5  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3066  cache type 2 domain-containing protein  23.81 
 
 		 549 aa  58.5  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4941  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.07 
 
 		 563 aa  58.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.396774  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3277  Cache type 2 domain protein  28.68 
 
 		 152 aa  58.5  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0890612  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02702  histidine kinase  31.58 
 
 		 456 aa  58.9  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3993  histidine kinase  34.83 
 
 		 456 aa  58.2  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0166  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  34 
 
 		 601 aa  57.4  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1387  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.41 
 
 		 615 aa  57.4  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3494  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.71 
 
 		 554 aa  57  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3617  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.71 
 
 		 554 aa  56.6  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.964358 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0158  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.36 
 
 		 561 aa  57  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0162  hypothetical protein  44.26 
 
 		 98 aa  56.6  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.976262 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1510  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  31.25 
 
 		 574 aa  57  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00534894  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0581  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.83 
 
 		 554 aa  56.6  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3422  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  33.71 
 
 		 554 aa  56.6  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1044  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.77 
 
 		 584 aa  56.2  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.05 
 
 		 678 aa  57  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.195593 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0870  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.71 
 
 		 554 aa  56.2  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0571565  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0084  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 		 449 aa  57  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1405  sensor histidine kinase  33.65 
 
 		 483 aa  55.8  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6398  histidine kinase  33.71 
 
 		 461 aa  56.2  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.176497 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4528  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.45 
 
 		 461 aa  55.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25442  normal  0.575982 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0357  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 459 aa  56.2  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2291  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 		 464 aa  55.8  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2109  cache, type 2  32.54 
 
 		 130 aa  56.2  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000614134  hitchhiker  0.00251106 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.33 
 
 		 701 aa  55.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000562313  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0353  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  34.78 
 
 		 564 aa  56.2  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.244374  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2212  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.85 
 
 		 549 aa  55.5  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>