32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0162 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0162  hypothetical protein  100 
 
 
98 aa  204  4e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.976262 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1642  hypothetical protein  47.76 
 
 
521 aa  66.2  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0704  hypothetical protein  50 
 
 
553 aa  65.5  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2563  putative cache sensor protein  38.36 
 
 
189 aa  64.7  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.800793 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1452  putative cache sensor protein  46.03 
 
 
452 aa  64.3  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2473  cache type 2 domain-containing protein  48.44 
 
 
551 aa  63.2  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0701  hypothetical protein  43.28 
 
 
565 aa  62.8  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.385527  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1445  putative cache sensor protein  43.33 
 
 
192 aa  59.7  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0691  hypothetical protein  42.65 
 
 
564 aa  59.7  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.526813  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1908  cache type 2 domain-containing protein  37.33 
 
 
183 aa  60.1  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0304  putative cache sensor protein  39.44 
 
 
152 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.333934 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0332  cache type 2 domain-containing protein  37.31 
 
 
153 aa  58.2  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0349612  normal  0.499668 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0638  putative cache sensor protein  40.3 
 
 
188 aa  56.2  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.05692  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0690  hypothetical protein  44.26 
 
 
598 aa  56.6  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.321962  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0762  putative cache sensor protein  42.86 
 
 
478 aa  55.1  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.197038  normal  0.180889 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2286  cache type 2 domain-containing protein  43.33 
 
 
320 aa  54.3  0.0000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3066  cache type 2 domain-containing protein  43.75 
 
 
549 aa  53.9  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1876  hypothetical protein  36.67 
 
 
152 aa  53.5  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0770276  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0702  hypothetical protein  39.39 
 
 
564 aa  52.4  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1093  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 
1721 aa  52.4  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1294  Signal transduction histidine kinase-like  41.27 
 
 
526 aa  52.8  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.212587  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1794  hypothetical protein  37.5 
 
 
168 aa  50.4  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0772  cache, type 2 domain protein  41.79 
 
 
151 aa  49.7  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3161  cache domain-contain protein  35.48 
 
 
152 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.535779  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0349  Signal transduction histidine kinase-like  31.43 
 
 
181 aa  47.8  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.510339 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1642  cache type 2 domain-containing protein  30 
 
 
146 aa  45.4  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000155098  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3277  Cache type 2 domain protein  33.87 
 
 
152 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0890612  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1528  cache type 2 domain-containing protein  31.67 
 
 
129 aa  43.9  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3522  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45 
 
 
477 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2364  cache type 2 domain-containing protein  28.17 
 
 
160 aa  42.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1708  Cache, type 2  28.36 
 
 
153 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0920811 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1159  hypothetical protein  29.63 
 
 
148 aa  40.4  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>