141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1876 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1876  hypothetical protein  100 
 
 		 152 aa  318  1.9999999999999998e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0770276  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0304  putative cache sensor protein  38.81 
 
 		 152 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.333934 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3161  cache domain-contain protein  38.82 
 
 		 152 aa  111  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.535779  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0332  cache type 2 domain-containing protein  42.62 
 
 		 153 aa  104  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0349612  normal  0.499668 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3277  Cache type 2 domain protein  40.94 
 
 		 152 aa  104  6e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0890612  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0772  cache, type 2 domain protein  35.53 
 
 		 151 aa  100  7e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2563  putative cache sensor protein  40 
 
 		 189 aa  99.4  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.800793 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0638  putative cache sensor protein  36.5 
 
 		 188 aa  97.4  6e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.05692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1452  putative cache sensor protein  42.62 
 
 		 452 aa  94  7e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1908  cache type 2 domain-containing protein  39.2 
 
 		 183 aa  94  7e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1528  cache type 2 domain-containing protein  34.4 
 
 		 129 aa  93.2  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1642  cache type 2 domain-containing protein  34.03 
 
 		 146 aa  93.2  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000155098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1445  putative cache sensor protein  38.66 
 
 		 192 aa  92.8  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2109  cache, type 2  37.5 
 
 		 130 aa  91.3  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000614134  hitchhiker  0.00251106 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0762  putative cache sensor protein  41.18 
 
 		 478 aa  91.3  4e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.197038  normal  0.180889 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1708  Cache, type 2  35.29 
 
 		 153 aa  91.3  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0920811 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1252  cache type 2 domain-containing protein  38.76 
 
 		 302 aa  90.5  7e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.751516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2364  cache type 2 domain-containing protein  34.38 
 
 		 160 aa  86.3  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1159  hypothetical protein  34.68 
 
 		 148 aa  84.3  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0690  hypothetical protein  38.4 
 
 		 598 aa  84  7e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.321962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0704  hypothetical protein  38.89 
 
 		 553 aa  84  7e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0349  Signal transduction histidine kinase-like  36.07 
 
 		 181 aa  82.8  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.510339 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0702  hypothetical protein  36 
 
 		 564 aa  82.8  0.000000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2286  cache type 2 domain-containing protein  35.22 
 
 		 320 aa  82.8  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2473  cache type 2 domain-containing protein  36.89 
 
 		 551 aa  82.4  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0701  hypothetical protein  33.6 
 
 		 565 aa  81.6  0.000000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.385527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4272  Cache type 2 domain protein  34.4 
 
 		 151 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.819687  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1642  hypothetical protein  37.21 
 
 		 521 aa  80.1  0.000000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1715  hypothetical protein  33.55 
 
 		 151 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0227611  normal  0.523463 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2350  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.13 
 
 		 515 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3066  cache type 2 domain-containing protein  37.5 
 
 		 549 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.26 
 
 		 499 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.729026  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3582  Cache, type 2  32 
 
 		 151 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.351306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2065  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 554 aa  77.4  0.00000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.460232  normal  0.464376 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0691  hypothetical protein  36 
 
 		 564 aa  76.3  0.0000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.526813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2816  putative cache sensor protein  33.11 
 
 		 285 aa  75.9  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1888  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.54 
 
 		 487 aa  75.9  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1093  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.62 
 
 		 1721 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2342  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.28 
 
 		 508 aa  73.2  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.10605  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2242  hypothetical protein  31.48 
 
 		 305 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.184581  hitchhiker  0.000000000000117809 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1294  Signal transduction histidine kinase-like  36.44 
 
 		 526 aa  65.9  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.212587  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45810  hypothetical protein  32.65 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3618  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.71 
 
 		 512 aa  63.5  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0151839  normal  0.0370629 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1423  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.29 
 
 		 584 aa  62.8  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2273  hypothetical protein  35.81 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104576  normal  0.662685 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5034  cache type 2 domain-containing protein  32.8 
 
 		 169 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.985276 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2486  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.9 
 
 		 504 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.961139  normal  0.110025 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2947  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.58 
 
 		 749 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.732257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1769  hypothetical protein  31.21 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4480  hypothetical protein  27.69 
 
 		 282 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109317 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2141  chemotaxis sensory transducer  36.14 
 
 		 708 aa  55.5  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3011  hypothetical protein  35.57 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.438725  normal  0.345508 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3112  chemotaxis sensory transducer  28.36 
 
 		 541 aa  54.7  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001822  methyl-accepting chemotaxis protein  35.96 
 
 		 557 aa  54.3  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000124429  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1646  diguanylate cyclase  33.33 
 
 		 580 aa  53.5  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000165959  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0162  hypothetical protein  36.67 
 
 		 98 aa  53.5  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.976262 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3511  hypothetical protein  39.84 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.751588  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3993  histidine kinase  31.82 
 
 		 456 aa  52.4  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0837  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.95 
 
 		 554 aa  52  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.94 
 
 		 554 aa  51.2  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0674  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 		 447 aa  51.2  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.504244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1413  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.54 
 
 		 918 aa  51.6  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1783  histidine kinase  34.72 
 
 		 501 aa  50.8  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211372 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4941  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.47 
 
 		 563 aa  50.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.396774  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0895  sensor histidine kinase  34.09 
 
 		 451 aa  50.4  0.000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.622783  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2596  methyl-accepting chemotaxis protein  34.09 
 
 		 564 aa  50.1  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000057467  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.93 
 
 		 701 aa  49.7  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000562313  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02702  histidine kinase  35.23 
 
 		 456 aa  49.3  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1794  hypothetical protein  32.11 
 
 		 168 aa  48.5  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2880  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.24 
 
 		 558 aa  48.9  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.12 
 
 		 564 aa  48.5  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003135  sensor histidine kinase  35.63 
 
 		 451 aa  47.4  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.291514  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3240  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.18 
 
 		 668 aa  47.4  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000648214  normal  0.034513 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1579  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.08 
 
 		 565 aa  47.4  0.00008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.327894  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0824  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.76 
 
 		 554 aa  47  0.00009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00067966 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3199  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.76 
 
 		 554 aa  47  0.00009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.927661 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3299  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.76 
 
 		 554 aa  47  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4280  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.56 
 
 		 563 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1261  sensor histidine kinase  38.2 
 
 		 467 aa  45.8  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.405254  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0987  methyl-accepting chemotaxis protein  30.59 
 
 		 554 aa  45.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6398  histidine kinase  34.48 
 
 		 461 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.176497 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0870  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.41 
 
 		 554 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0571565  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3494  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.41 
 
 		 554 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0673  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  26.47 
 
 		 533 aa  45.8  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.349323 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3617  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.41 
 
 		 554 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.964358 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1044  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.4 
 
 		 584 aa  45.4  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0581  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.24 
 
 		 554 aa  45.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3422  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  29.41 
 
 		 554 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4528  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 		 461 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25442  normal  0.575982 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3759  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.59 
 
 		 554 aa  45.4  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0990388  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3217  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  31.4 
 
 		 584 aa  44.7  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.480757 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2989  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 1093 aa  44.7  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.653084  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.83 
 
 		 548 aa  44.7  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000213036  normal  0.437149 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1253  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.88 
 
 		 567 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.010155 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6950  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  36.99 
 
 		 661 aa  43.9  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3699  methyl-accepting chemotaxis protein  28.57 
 
 		 543 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2601  chemotaxis sensory transducer  32.26 
 
 		 569 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.441915  normal  0.36116 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4477  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.89 
 
 		 471 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3775  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.35 
 
 		 526 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.268134  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1400  Cache type 2 domain protein  25.2 
 
 		 308 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.457949  hitchhiker  0.000596162 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>