67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1769 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1769  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  301  1.0000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2273  hypothetical protein  63.19 
 
 		 148 aa  177  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104576  normal  0.662685 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45810  hypothetical protein  54.05 
 
 		 145 aa  177  4.999999999999999e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3011  hypothetical protein  61.74 
 
 		 148 aa  170  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.438725  normal  0.345508 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3511  hypothetical protein  60.81 
 
 		 148 aa  169  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.751588  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0164  hypothetical protein  56.1 
 
 		 73 aa  63.2  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1642  cache type 2 domain-containing protein  29.66 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000155098  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1876  hypothetical protein  31.21 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0770276  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1159  hypothetical protein  28.69 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2242  hypothetical protein  25.68 
 
 		 305 aa  56.2  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.184581  hitchhiker  0.000000000000117809 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2816  putative cache sensor protein  28.87 
 
 		 285 aa  55.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4480  hypothetical protein  27.42 
 
 		 282 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109317 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0077  histidine kinase  37.5 
 
 		 661 aa  50.1  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2364  cache type 2 domain-containing protein  29.27 
 
 		 160 aa  49.7  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4964  methyl-accepting chemotaxis protein  38.89 
 
 		 545 aa  47.8  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1078  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.85 
 
 		 587 aa  47.4  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101669 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0158  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.38 
 
 		 561 aa  47.4  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2920  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.71 
 
 		 544 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4414  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.42 
 
 		 518 aa  46.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.684904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2874  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.89 
 
 		 563 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.872696  normal  0.485865 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2659  methyl-accepting chemotaxis protein  33.33 
 
 		 556 aa  46.6  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.71 
 
 		 544 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2601  chemotaxis sensory transducer  38.18 
 
 		 569 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.441915  normal  0.36116 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.85 
 
 		 499 aa  46.6  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.729026  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0304  putative cache sensor protein  29.77 
 
 		 152 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.333934 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 585 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.38945  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0332  cache type 2 domain-containing protein  24.18 
 
 		 153 aa  46.2  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0349612  normal  0.499668 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2757  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.93 
 
 		 544 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3836  Cache, type 2  41.38 
 
 		 661 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.337162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3066  cache type 2 domain-containing protein  30 
 
 		 549 aa  45.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2316  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.52 
 
 		 548 aa  45.4  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0208981 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3699  methyl-accepting chemotaxis protein  36.36 
 
 		 543 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2174  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.76 
 
 		 544 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00506259 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0701  Cache sensor signal transduction histidine kinase  34.12 
 
 		 655 aa  44.7  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.831837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1776  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  37.93 
 
 		 543 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.363817 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4388  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.71 
 
 		 553 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.789001  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2861  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.93 
 
 		 544 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.445183 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3240  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.53 
 
 		 668 aa  43.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000648214  normal  0.034513 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 		 701 aa  43.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000562313  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2847  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  30.67 
 
 		 1089 aa  43.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000851175  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1528  cache type 2 domain-containing protein  24.59 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3394  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.19 
 
 		 664 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000171268  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2947  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.63 
 
 		 749 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.732257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1985  methyl-accepting chemotaxis protein (MCP)  33.33 
 
 		 715 aa  42.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02605  putative methyl-accepting chemotaxis transducer transmembrane protein  29.13 
 
 		 513 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0414906  normal  0.0642458 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1710  methyl-accepting chemotaxis protein  36.36 
 
 		 517 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1198  methyl-accepting chemotaxis protein  36.36 
 
 		 482 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.311579  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1623  methyl-accepting chemotaxis protein  36.36 
 
 		 517 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4237  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.87 
 
 		 513 aa  41.2  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1366  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  29.33 
 
 		 1088 aa  41.6  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000517956 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4347  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  31.87 
 
 		 513 aa  41.2  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.473159 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0212  methyl-accepting chemotaxis protein  36.36 
 
 		 464 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.387539  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0995  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.22 
 
 		 621 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.203772 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3618  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.35 
 
 		 512 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0151839  normal  0.0370629 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1766  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30 
 
 		 575 aa  41.2  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3823  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.88 
 
 		 513 aa  41.2  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.793143 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 678 aa  41.2  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.195593 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2989  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.19 
 
 		 1093 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.653084  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2109  cache, type 2  25.41 
 
 		 130 aa  41.2  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000614134  hitchhiker  0.00251106 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.99 
 
 		 485 aa  41.2  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12569  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2643  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.19 
 
 		 541 aa  40.8  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0238907  normal  0.0164957 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2220  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  32.14 
 
 		 971 aa  40.8  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00060546  normal  0.0976665 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2784  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.98 
 
 		 542 aa  40.8  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.65 
 
 		 566 aa  40.8  0.007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6769  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.35 
 
 		 519 aa  40.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176172  normal  0.340215 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1028  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  28.36 
 
 		 532 aa  40.4  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1093  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.39 
 
 		 1721 aa  40.4  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>