101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2242 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2242  hypothetical protein  100 
 
 		 305 aa  629  1e-179  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.184581  hitchhiker  0.000000000000117809 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4480  hypothetical protein  43.17 
 
 		 282 aa  228  9e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109317 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2816  putative cache sensor protein  36.23 
 
 		 285 aa  174  9.999999999999999e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1252  cache type 2 domain-containing protein  25.86 
 
 		 302 aa  104  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.751516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0332  cache type 2 domain-containing protein  35.19 
 
 		 153 aa  87.4  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0349612  normal  0.499668 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1528  cache type 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 129 aa  77.4  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1452  putative cache sensor protein  30.16 
 
 		 452 aa  77.4  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3066  cache type 2 domain-containing protein  23.77 
 
 		 549 aa  75.9  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3161  cache domain-contain protein  37.8 
 
 		 152 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.535779  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2109  cache, type 2  32.26 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000614134  hitchhiker  0.00251106 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3277  Cache type 2 domain protein  36.22 
 
 		 152 aa  72.4  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0890612  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1708  Cache, type 2  30.67 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0920811 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0304  putative cache sensor protein  35.25 
 
 		 152 aa  69.3  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.333934 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1876  hypothetical protein  31.48 
 
 		 152 aa  68.9  0.00000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0770276  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.11 
 
 		 499 aa  68.6  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.729026  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4272  Cache type 2 domain protein  32.79 
 
 		 151 aa  67  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.819687  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1715  hypothetical protein  34.41 
 
 		 151 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0227611  normal  0.523463 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3582  Cache, type 2  31.97 
 
 		 151 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.351306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2473  cache type 2 domain-containing protein  25 
 
 		 551 aa  63.2  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1159  hypothetical protein  36.17 
 
 		 148 aa  61.6  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45810  hypothetical protein  27.5 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2947  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.38 
 
 		 749 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.732257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2734  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.21 
 
 		 751 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1093  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.77 
 
 		 1721 aa  58.2  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0772  cache, type 2 domain protein  26.99 
 
 		 151 aa  58.2  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1769  hypothetical protein  25.68 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2364  cache type 2 domain-containing protein  28.91 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2273  hypothetical protein  29.32 
 
 		 148 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104576  normal  0.662685 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3511  hypothetical protein  30.58 
 
 		 148 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.751588  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3011  hypothetical protein  29.79 
 
 		 148 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.438725  normal  0.345508 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0638  putative cache sensor protein  29.09 
 
 		 188 aa  51.2  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.05692  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3699  methyl-accepting chemotaxis protein  34.38 
 
 		 543 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1253  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.67 
 
 		 567 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.010155 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2920  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.38 
 
 		 544 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0701  hypothetical protein  26.98 
 
 		 565 aa  50.4  0.00004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.385527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2601  chemotaxis sensory transducer  34.09 
 
 		 569 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.441915  normal  0.36116 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0690  hypothetical protein  27.88 
 
 		 598 aa  49.7  0.00006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.321962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0632  chemotaxis sensory transducer  32.32 
 
 		 736 aa  49.3  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2316  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.12 
 
 		 548 aa  49.3  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0208981 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2757  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.32 
 
 		 544 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34 
 
 		 585 aa  48.9  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.38945  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0691  hypothetical protein  27.15 
 
 		 564 aa  48.9  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.526813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0704  hypothetical protein  27.1 
 
 		 553 aa  48.9  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.16 
 
 		 544 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2861  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.81 
 
 		 544 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.445183 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4280  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.58 
 
 		 563 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2342  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.37 
 
 		 508 aa  48.1  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.10605  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4941  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.61 
 
 		 563 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.396774  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1294  Signal transduction histidine kinase-like  24.79 
 
 		 526 aa  47.4  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.212587  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2174  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.96 
 
 		 544 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00506259 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3618  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.76 
 
 		 512 aa  46.6  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0151839  normal  0.0370629 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2563  putative cache sensor protein  32.29 
 
 		 189 aa  46.6  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.800793 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3709  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  38.24 
 
 		 546 aa  46.2  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2350  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.83 
 
 		 515 aa  45.8  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1642  hypothetical protein  25.25 
 
 		 521 aa  45.8  0.0008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0702  hypothetical protein  26.75 
 
 		 564 aa  45.8  0.0009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.36 
 
 		 567 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2486  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.53 
 
 		 504 aa  45.8  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.961139  normal  0.110025 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6950  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  36.23 
 
 		 661 aa  45.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.68 
 
 		 566 aa  45.8  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5034  cache type 2 domain-containing protein  24.82 
 
 		 169 aa  45.8  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.985276 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3600  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.24 
 
 		 546 aa  45.8  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1776  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  36.23 
 
 		 543 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.363817 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0777  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.29 
 
 		 712 aa  44.7  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1646  diguanylate cyclase  19.64 
 
 		 580 aa  44.7  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000165959  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1767  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.35 
 
 		 545 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.381763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1845  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.35 
 
 		 545 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1387  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.25 
 
 		 615 aa  44.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.68 
 
 		 566 aa  44.3  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00082247  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.25 
 
 		 701 aa  44.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000562313  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2693  histidine kinase  24.67 
 
 		 656 aa  44.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23882e-16 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6164  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.68 
 
 		 544 aa  43.9  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1078  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32 
 
 		 587 aa  43.9  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101669 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2116  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.76 
 
 		 545 aa  44.3  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2845  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.68 
 
 		 545 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.788597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1523  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.23 
 
 		 656 aa  44.3  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0438  methyl-accepting chemotaxis protein  32.63 
 
 		 512 aa  43.5  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.212381  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3836  Cache, type 2  34.78 
 
 		 661 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.337162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1642  cache type 2 domain-containing protein  24.75 
 
 		 146 aa  43.5  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000155098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3394  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.78 
 
 		 664 aa  43.5  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000171268  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2412  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30 
 
 		 545 aa  43.9  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.516535  hitchhiker  0.00000653474 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4477  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 471 aa  43.5  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.68 
 
 		 545 aa  43.5  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2834  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.68 
 
 		 545 aa  43.5  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1908  cache type 2 domain-containing protein  27.07 
 
 		 183 aa  43.5  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3184  methyl-accepting chemotaxis protein  32.63 
 
 		 511 aa  43.1  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0685  methyl-accepting chemotaxis protein  32.63 
 
 		 526 aa  43.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0762  putative cache sensor protein  23.9 
 
 		 478 aa  43.1  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.197038  normal  0.180889 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2891  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.65 
 
 		 521 aa  42.7  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.657214  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0157  methyl-accepting chemotaxis protein  32.63 
 
 		 546 aa  42.7  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.293853  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1435  methyl-accepting chemotaxis protein  32.63 
 
 		 546 aa  42.7  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.631191  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0502  methyl-accepting chemotaxis protein  32.63 
 
 		 546 aa  42.7  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0520  methyl-accepting chemotaxis protein  32.63 
 
 		 546 aa  42.7  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.640738  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2862  methyl-accepting chemotaxis protein  32.63 
 
 		 546 aa  42.7  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2286  cache type 2 domain-containing protein  23.86 
 
 		 320 aa  42.7  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2751  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.65 
 
 		 521 aa  42.7  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.69 
 
 		 510 aa  42.7  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0469  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.63 
 
 		 549 aa  42.4  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.9 
 
 		 471 aa  42.4  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629472  normal  0.491206 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4945  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.21 
 
 		 459 aa  42.4  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0549839 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>