66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0772 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0772  cache, type 2 domain protein  100 
 
 		 151 aa  309  6.999999999999999e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0332  cache type 2 domain-containing protein  40.52 
 
 		 153 aa  125  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0349612  normal  0.499668 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0304  putative cache sensor protein  42.06 
 
 		 152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.333934 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1876  hypothetical protein  35.53 
 
 		 152 aa  100  7e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0770276  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3161  cache domain-contain protein  33.56 
 
 		 152 aa  92  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.535779  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1708  Cache, type 2  31.79 
 
 		 153 aa  89.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0920811 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3277  Cache type 2 domain protein  36.89 
 
 		 152 aa  89.4  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0890612  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1093  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.27 
 
 		 1721 aa  85.9  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2109  cache, type 2  37.4 
 
 		 130 aa  85.5  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000614134  hitchhiker  0.00251106 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1528  cache type 2 domain-containing protein  29.69 
 
 		 129 aa  85.9  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1252  cache type 2 domain-containing protein  33.87 
 
 		 302 aa  85.5  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.751516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2364  cache type 2 domain-containing protein  33.06 
 
 		 160 aa  80.9  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3582  Cache, type 2  33.06 
 
 		 151 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.351306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1715  hypothetical protein  31.45 
 
 		 151 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0227611  normal  0.523463 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4272  Cache type 2 domain protein  31.45 
 
 		 151 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.819687  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1159  hypothetical protein  31.45 
 
 		 148 aa  77.8  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3066  cache type 2 domain-containing protein  33.59 
 
 		 549 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.86 
 
 		 499 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.729026  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0638  putative cache sensor protein  35.38 
 
 		 188 aa  73.6  0.0000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.05692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2563  putative cache sensor protein  33.33 
 
 		 189 aa  70.9  0.000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.800793 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1642  cache type 2 domain-containing protein  27.46 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000155098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1642  hypothetical protein  36.3 
 
 		 521 aa  66.6  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2065  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.95 
 
 		 554 aa  65.5  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.460232  normal  0.464376 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1908  cache type 2 domain-containing protein  33.06 
 
 		 183 aa  64.7  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2816  putative cache sensor protein  29.61 
 
 		 285 aa  64.3  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1888  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.16 
 
 		 487 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0690  hypothetical protein  33.87 
 
 		 598 aa  63.5  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.321962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2473  cache type 2 domain-containing protein  35.2 
 
 		 551 aa  60.8  0.000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3618  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.92 
 
 		 512 aa  60.8  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0151839  normal  0.0370629 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1452  putative cache sensor protein  32.77 
 
 		 452 aa  59.7  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0701  hypothetical protein  33.07 
 
 		 565 aa  60.1  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.385527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0762  putative cache sensor protein  33.06 
 
 		 478 aa  58.9  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.197038  normal  0.180889 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2342  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.77 
 
 		 508 aa  58.2  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.10605  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2242  hypothetical protein  26.99 
 
 		 305 aa  58.2  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.184581  hitchhiker  0.000000000000117809 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5034  cache type 2 domain-containing protein  31.13 
 
 		 169 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.985276 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1918  putative cache sensor protein  34.04 
 
 		 632 aa  57  0.00000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.149363  normal  0.217415 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0704  hypothetical protein  35.59 
 
 		 553 aa  55.8  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0702  hypothetical protein  32.61 
 
 		 564 aa  55.8  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0691  hypothetical protein  33.06 
 
 		 564 aa  55.5  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.526813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1294  Signal transduction histidine kinase-like  32 
 
 		 526 aa  54.7  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.212587  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1445  putative cache sensor protein  26.59 
 
 		 192 aa  54.3  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0349  Signal transduction histidine kinase-like  31.09 
 
 		 181 aa  51.2  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.510339 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2486  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.88 
 
 		 504 aa  49.7  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.961139  normal  0.110025 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1400  Cache type 2 domain protein  30.4 
 
 		 308 aa  50.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.457949  hitchhiker  0.000596162 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0840  cache domain-contain protein  40 
 
 		 566 aa  49.7  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.287851  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0162  hypothetical protein  41.79 
 
 		 98 aa  49.7  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.976262 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4480  hypothetical protein  24.03 
 
 		 282 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109317 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2350  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.34 
 
 		 515 aa  48.5  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2286  cache type 2 domain-containing protein  28.71 
 
 		 320 aa  47  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0105  Cache type 2 domain protein  29.91 
 
 		 315 aa  46.6  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1783  histidine kinase  31.58 
 
 		 501 aa  46.2  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211372 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.77 
 
 		 557 aa  45.4  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.418138 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2765  amino acid ABC transporter periplasmic protein  38.57 
 
 		 401 aa  45.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2327  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.52 
 
 		 554 aa  44.3  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.644098  normal  0.637343 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0616  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30 
 
 		 908 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0119428 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6950  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  33.33 
 
 		 661 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3217  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  29.91 
 
 		 584 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.480757 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.94 
 
 		 564 aa  42.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5641  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.49 
 
 		 519 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3246  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.83 
 
 		 601 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.416407  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6518  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.4 
 
 		 514 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.73924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0113  chemotaxis sensory transducer  36.59 
 
 		 563 aa  40.8  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45810  hypothetical protein  26.17 
 
 		 145 aa  40.8  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2989  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.1 
 
 		 1093 aa  40.8  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.653084  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.1 
 
 		 579 aa  40.8  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0132835 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.67 
 
 		 585 aa  40.4  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.38945  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>