133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2765 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2765  amino acid ABC transporter periplasmic protein  100 
 
 		 401 aa  827    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1918  putative cache sensor protein  37.06 
 
 		 632 aa  258  1e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.149363  normal  0.217415 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1916  extracellular solute-binding protein family 3  33.33 
 
 		 483 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3830  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 248 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000366277 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0629  extracellular solute-binding protein  30.8 
 
 		 257 aa  120  3e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0350  extracellular solute-binding protein family 3  27.63 
 
 		 321 aa  119  7e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0133156 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0733  amino acid ABC transporter periplasmic protein  34.88 
 
 		 255 aa  113  5e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.263143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1208  hypothetical protein  27.31 
 
 		 258 aa  108  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000699317  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0424  hypothetical protein  31.17 
 
 		 256 aa  105  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4251  amino acid ABC transporter periplasmic protein  30 
 
 		 244 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000526957 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1844  extracellular solute-binding protein  27.34 
 
 		 260 aa  86.7  6e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000362453  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5333  hypothetical protein  28.33 
 
 		 269 aa  86.3  8e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3761  extracellular solute-binding protein  25.21 
 
 		 265 aa  86.7  8e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3570  extracellular solute-binding protein family 3  25.44 
 
 		 252 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0687  extracellular solute-binding protein  29.17 
 
 		 255 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0746  extracellular solute-binding protein  24.34 
 
 		 275 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0305191 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1845  extracellular solute-binding protein  27.03 
 
 		 262 aa  84.3  0.000000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00294253  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67840  putative ABC-type amino acid transporter  28.97 
 
 		 251 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.288914 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5872  hypothetical protein  28.97 
 
 		 251 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1009  hypothetical protein  29.3 
 
 		 242 aa  82  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.815562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4249  extracellular solute-binding protein  27.34 
 
 		 251 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199527 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3638  extracellular solute-binding protein  24.79 
 
 		 265 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.055561  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5873  hypothetical protein  28.18 
 
 		 250 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4891  hypothetical protein  27.05 
 
 		 251 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1477  extracellular solute-binding protein family 3  30.47 
 
 		 254 aa  80.5  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3860  hypothetical protein  22.92 
 
 		 265 aa  79.7  0.00000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67850  putative ABC-type amino acid transport protein, periplasmic component  28.12 
 
 		 250 aa  79.7  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.349677 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0328  hypothetical protein  27.55 
 
 		 251 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397197 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3192  extracellular solute-binding protein  23.81 
 
 		 265 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0961443  hitchhiker  0.0000817621 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67860  putative ABC-type amino acid transporter  28.63 
 
 		 248 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.339144 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1595  extracellular solute-binding protein  27 
 
 		 262 aa  78.6  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.614347  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5874  hypothetical protein  28.63 
 
 		 248 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2937  hypothetical protein  27.19 
 
 		 257 aa  77  0.0000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3523  extracellular solute-binding protein, family 3  27.12 
 
 		 257 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3305  extracellular solute-binding protein  24.55 
 
 		 244 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2915  amino acid ABC transporter periplasmic protein  27.44 
 
 		 247 aa  74.3  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3302  extracellular solute-binding protein  26.44 
 
 		 257 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3398  extracellular solute-binding protein  26.69 
 
 		 257 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0258  extracellular solute-binding protein  27.85 
 
 		 236 aa  73.6  0.000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3188  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  39.29 
 
 		 228 aa  73.2  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484393  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0921  extracellular solute-binding protein  23.87 
 
 		 260 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0969  extracellular solute-binding protein  26.44 
 
 		 255 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1683  hypothetical protein  30.42 
 
 		 251 aa  72.4  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0772  extracellular solute-binding protein  22.22 
 
 		 238 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.025527 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1054  extracellular solute-binding protein family 3  25.96 
 
 		 257 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0164866  hitchhiker  0.000017747 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0967  extracellular solute-binding protein  24.58 
 
 		 255 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1005  hypothetical protein  24.15 
 
 		 255 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.69065  normal  0.921286 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1143  hypothetical protein  27.36 
 
 		 255 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0619  hypothetical protein  28.46 
 
 		 248 aa  68.9  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.566502  normal  0.917839 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4250  amino acid ABC transporter periplasmic protein  25.89 
 
 		 251 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190529 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2624  hypothetical protein  26.21 
 
 		 271 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.547677 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2990  extracellular solute-binding protein  24.68 
 
 		 263 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.604366  normal  0.133749 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1585  hypothetical protein  27.49 
 
 		 248 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3893  amino acid ABC transporter periplasmic protein  22.98 
 
 		 252 aa  64.3  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3523  extracellular solute-binding protein  22.35 
 
 		 268 aa  63.5  0.000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1093  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.56 
 
 		 1721 aa  59.7  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2978  extracellular solute-binding protein  23.35 
 
 		 248 aa  58.9  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1345  CjaC  33.33 
 
 		 259 aa  58.5  0.0000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.000213382  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0702  extracellular solute-binding protein  23.55 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0691872 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3840  putative lipoprotein  25.61 
 
 		 255 aa  55.8  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0421756  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0332  cache type 2 domain-containing protein  35.56 
 
 		 153 aa  55.8  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0349612  normal  0.499668 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1101  extracellular solute-binding protein family 3  25 
 
 		 295 aa  56.2  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0196876 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3526  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.95 
 
 		 584 aa  55.1  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3031  extracellular solute-binding protein family 3  32.1 
 
 		 237 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.516858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1252  cache type 2 domain-containing protein  31.25 
 
 		 302 aa  54.7  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.751516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.4 
 
 		 1165 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2767  extracellular solute-binding protein family 3  30.86 
 
 		 238 aa  53.1  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1030  histidine kinase  29.63 
 
 		 781 aa  53.1  0.000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.372079  normal  0.0935457 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1312  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.99 
 
 		 584 aa  52.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0881  extracellular solute-binding protein  30.84 
 
 		 269 aa  52  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0241  extracellular solute-binding protein  26.4 
 
 		 275 aa  51.2  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3066  cache type 2 domain-containing protein  29.77 
 
 		 549 aa  51.2  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1729  CjaC  27.83 
 
 		 257 aa  51.6  0.00003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1802  histidine kinase  25.71 
 
 		 540 aa  51.2  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.963501  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0421  extracellular solute-binding protein  25.11 
 
 		 252 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2755  periplasmic substrate-binding protein/sensor histidine kinase  28.12 
 
 		 590 aa  50.1  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2584  hypothetical protein  23.21 
 
 		 257 aa  50.4  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.685098  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2115  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.19 
 
 		 604 aa  50.4  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00123104  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1277  hypothetical protein  23.1 
 
 		 272 aa  49.7  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.674192  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3277  Cache type 2 domain protein  35.29 
 
 		 152 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0890612  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1080  extracellular solute-binding protein  30.23 
 
 		 241 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.950195  normal  0.541205 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1728  histidine kinase  26.04 
 
 		 560 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.864697  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1528  cache type 2 domain-containing protein  29.63 
 
 		 129 aa  48.1  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1594  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.89 
 
 		 780 aa  48.9  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.111266  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0788  putative ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.07 
 
 		 302 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00334731 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0150  extracellular solute-binding protein  32.04 
 
 		 306 aa  48.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.975549 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2309  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.06 
 
 		 1055 aa  47.4  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1048  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.21 
 
 		 559 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.165383 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3932  amino acid ABC transporter periplasmic protein  27.35 
 
 		 262 aa  47.4  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2424  diguanylate cyclase  31.13 
 
 		 928 aa  47  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00236557  normal  0.130217 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5034  cache type 2 domain-containing protein  27.82 
 
 		 169 aa  47  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.985276 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3879  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.57 
 
 		 235 aa  47  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2308  diguanylate cyclase  31.13 
 
 		 928 aa  46.6  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00466975  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3689  diguanylate cyclase  25.3 
 
 		 935 aa  46.6  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3266  putative PAS/PAC sensor protein  30.25 
 
 		 830 aa  46.6  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1452  putative cache sensor protein  30.77 
 
 		 452 aa  46.6  0.0009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2874  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.21 
 
 		 563 aa  46.6  0.0009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.872696  normal  0.485865 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0411  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] N-acetylglucosamine deacetylase  25.22 
 
 		 238 aa  46.6  0.0009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1759  histidine kinase  25.9 
 
 		 596 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.37697  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3161  cache domain-contain protein  32.94 
 
 		 152 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.535779  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>