179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1908 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1908  cache type 2 domain-containing protein  100 
 
 		 183 aa  383  1e-106  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2563  putative cache sensor protein  55.61 
 
 		 189 aa  227  6e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.800793 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1445  putative cache sensor protein  58.24 
 
 		 192 aa  214  4e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1452  putative cache sensor protein  58.1 
 
 		 452 aa  204  8e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0638  putative cache sensor protein  52.57 
 
 		 188 aa  192  2e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.05692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0349  Signal transduction histidine kinase-like  61.98 
 
 		 181 aa  160  1e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.510339 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0762  putative cache sensor protein  45.25 
 
 		 478 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.197038  normal  0.180889 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0704  hypothetical protein  49.59 
 
 		 553 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1642  hypothetical protein  44.93 
 
 		 521 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0701  hypothetical protein  41.3 
 
 		 565 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.385527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2473  cache type 2 domain-containing protein  43.41 
 
 		 551 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0702  hypothetical protein  41.91 
 
 		 564 aa  108  3e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2286  cache type 2 domain-containing protein  41.43 
 
 		 320 aa  107  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0691  hypothetical protein  43.85 
 
 		 564 aa  105  3e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.526813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1294  Signal transduction histidine kinase-like  44.8 
 
 		 526 aa  104  8e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.212587  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0690  hypothetical protein  44.72 
 
 		 598 aa  102  3e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.321962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0332  cache type 2 domain-containing protein  45.37 
 
 		 153 aa  99.8  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0349612  normal  0.499668 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1876  hypothetical protein  39.2 
 
 		 152 aa  94  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0770276  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3161  cache domain-contain protein  38.33 
 
 		 152 aa  88.2  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.535779  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1093  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.34 
 
 		 1721 aa  87.8  8e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3277  Cache type 2 domain protein  38.4 
 
 		 152 aa  87.8  8e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0890612  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0304  putative cache sensor protein  34.4 
 
 		 152 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.333934 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2816  putative cache sensor protein  40.5 
 
 		 285 aa  76.3  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1252  cache type 2 domain-containing protein  42.31 
 
 		 302 aa  75.9  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.751516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2109  cache, type 2  34.78 
 
 		 130 aa  75.1  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000614134  hitchhiker  0.00251106 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0640  hypothetical protein  55.56 
 
 		 113 aa  72.8  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0398047  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2070  sensor histidine kinase  28.65 
 
 		 466 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1462  sensor kinase protein  28.65 
 
 		 466 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1528  cache type 2 domain-containing protein  33.61 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1099  sensor histidine kinase  28.65 
 
 		 466 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1378  sensor histidine kinase  28.65 
 
 		 466 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.922617  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3247  putative sensor histidine kinase  28.65 
 
 		 466 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3132  putative sensor histidine kinase  28.65 
 
 		 466 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2363  sensor histidine kinase  28.65 
 
 		 466 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.8 
 
 		 459 aa  67  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.134921 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1159  hypothetical protein  35.83 
 
 		 148 aa  67.4  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3405  histidine kinase  35.87 
 
 		 488 aa  67  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.352666  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0021  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  34.78 
 
 		 487 aa  66.2  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.130425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0789  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.21 
 
 		 469 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3728  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 		 488 aa  65.9  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2334  sensor histidine kinase  32.73 
 
 		 470 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1708  Cache, type 2  28.99 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0920811 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0772  cache, type 2 domain protein  33.06 
 
 		 151 aa  64.7  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5188  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.23 
 
 		 480 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4945  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.75 
 
 		 459 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0549839 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5671  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.23 
 
 		 480 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0241273 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5497  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.75 
 
 		 459 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170786 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4477  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.05 
 
 		 471 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0027  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.75 
 
 		 461 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.755533 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4564  histidine kinase  27.23 
 
 		 460 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.562879  normal  0.0736505 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2364  cache type 2 domain-containing protein  32.77 
 
 		 160 aa  63.9  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1783  histidine kinase  35.96 
 
 		 501 aa  63.9  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211372 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3522  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 		 477 aa  63.9  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3261  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.32 
 
 		 613 aa  63.5  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1027  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  33.72 
 
 		 456 aa  61.6  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.573227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.91 
 
 		 486 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2350  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.25 
 
 		 515 aa  60.8  0.000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0674  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.05 
 
 		 447 aa  60.5  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.504244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1423  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.38 
 
 		 584 aa  60.5  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4272  Cache type 2 domain protein  31.9 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.819687  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0162  hypothetical protein  37.33 
 
 		 98 aa  60.1  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.976262 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.34 
 
 		 554 aa  59.7  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 		 471 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629472  normal  0.491206 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0824  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.42 
 
 		 554 aa  59.3  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00067966 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3199  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.42 
 
 		 554 aa  59.3  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.927661 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3299  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.42 
 
 		 554 aa  58.9  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3491  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.34 
 
 		 554 aa  59.3  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.56 
 
 		 478 aa  58.9  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.304751 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0581  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.96 
 
 		 554 aa  58.5  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3200  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.42 
 
 		 554 aa  58.5  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1261  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  28.35 
 
 		 654 aa  58.5  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0987  methyl-accepting chemotaxis protein  34.38 
 
 		 554 aa  58.2  0.00000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3418  sensor histidine kinase  32.03 
 
 		 481 aa  58.2  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.986219  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41030  Periplasmic sensory histidine protein kinase, two-component  32.29 
 
 		 458 aa  58.2  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0649951  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0630  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.38 
 
 		 554 aa  58.2  0.00000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3532  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.7 
 
 		 555 aa  57.8  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3789  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.38 
 
 		 554 aa  57.4  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3666  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.38 
 
 		 554 aa  57.4  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3575  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 		 475 aa  57.4  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3601  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  34.38 
 
 		 554 aa  57.4  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0641  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.38 
 
 		 568 aa  57.4  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3582  Cache, type 2  30.16 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.351306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3066  cache type 2 domain-containing protein  28.68 
 
 		 549 aa  56.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1715  hypothetical protein  29.55 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0227611  normal  0.523463 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0870  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.68 
 
 		 554 aa  56.2  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0571565  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1261  sensor histidine kinase  30.43 
 
 		 467 aa  55.1  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.405254  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3494  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.68 
 
 		 554 aa  55.1  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0906  sensor histidine kinase  29.07 
 
 		 469 aa  54.7  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0178022  hitchhiker  0.0000002134 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3617  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.63 
 
 		 554 aa  54.7  0.0000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.964358 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3422  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  32.63 
 
 		 554 aa  54.3  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3052  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 554 aa  53.5  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3618  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32 
 
 		 512 aa  52.4  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0151839  normal  0.0370629 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2065  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.56 
 
 		 554 aa  52.4  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.460232  normal  0.464376 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0166  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  30.65 
 
 		 601 aa  52  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3993  histidine kinase  31.4 
 
 		 456 aa  52  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0895  sensor histidine kinase  28.57 
 
 		 451 aa  51.2  0.000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.622783  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3901  cache type 2 domain-containing protein  32.22 
 
 		 343 aa  51.2  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1405  sensor histidine kinase  30.23 
 
 		 483 aa  49.7  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2738  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.97 
 
 		 562 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.809654  normal  0.020868 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5321  histidine kinase  35.79 
 
 		 470 aa  50.4  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>