187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2473 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2473  cache type 2 domain-containing protein  100 
 
 		 551 aa  1115    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1294  Signal transduction histidine kinase-like  41.97 
 
 		 526 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.212587  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1642  hypothetical protein  33.14 
 
 		 521 aa  266  5e-70  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0690  hypothetical protein  30.85 
 
 		 598 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.321962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0704  hypothetical protein  35.87 
 
 		 553 aa  253  5.000000000000001e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0702  hypothetical protein  29.82 
 
 		 564 aa  250  6e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0701  hypothetical protein  28.34 
 
 		 565 aa  226  8e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.385527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0691  hypothetical protein  28.09 
 
 		 564 aa  223  9.999999999999999e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.526813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1452  putative cache sensor protein  41.13 
 
 		 452 aa  195  2e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2286  cache type 2 domain-containing protein  40 
 
 		 320 aa  173  7.999999999999999e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0762  putative cache sensor protein  37.79 
 
 		 478 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.197038  normal  0.180889 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1237  methyl-accepting chemotaxis protein  30.04 
 
 		 267 aa  127  6e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0609367 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0638  putative cache sensor protein  42.57 
 
 		 188 aa  125  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.05692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0520  methyl-accepting chemotaxis protein  31.62 
 
 		 289 aa  123  7e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0059  Extracellular ligand-binding receptor  27.78 
 
 		 599 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2563  putative cache sensor protein  40.43 
 
 		 189 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.800793 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0349  Signal transduction histidine kinase-like  40.4 
 
 		 181 aa  110  8.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.510339 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1908  cache type 2 domain-containing protein  43.41 
 
 		 183 aa  110  8.000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2754  hypothetical protein  27.31 
 
 		 310 aa  101  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1445  putative cache sensor protein  44.63 
 
 		 192 aa  100  7e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0332  cache type 2 domain-containing protein  37.5 
 
 		 153 aa  84.3  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0349612  normal  0.499668 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1876  hypothetical protein  36.89 
 
 		 152 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0770276  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3066  cache type 2 domain-containing protein  30.77 
 
 		 549 aa  82.8  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1002  hypothetical protein  27.88 
 
 		 298 aa  82.4  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.204123  normal  0.271191 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2816  putative cache sensor protein  30.42 
 
 		 285 aa  72.4  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 		 701 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000562313  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1423  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.54 
 
 		 584 aa  72  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3246  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.71 
 
 		 601 aa  70.5  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.416407  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003135  sensor histidine kinase  46.67 
 
 		 451 aa  69.3  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.291514  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1261  sensor histidine kinase  35.11 
 
 		 467 aa  67.8  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.405254  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3728  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.39 
 
 		 488 aa  68.2  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0789  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.04 
 
 		 469 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3405  histidine kinase  42.39 
 
 		 488 aa  67.8  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.352666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0895  sensor histidine kinase  41.11 
 
 		 451 aa  67.4  0.0000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.622783  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4477  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.04 
 
 		 471 aa  67.8  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0027  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.93 
 
 		 461 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.755533 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 471 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629472  normal  0.491206 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 		 486 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 		 459 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.134921 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0674  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 447 aa  64.7  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.504244  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0021  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  40.22 
 
 		 487 aa  64.3  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.130425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1252  cache type 2 domain-containing protein  24.37 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.751516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5188  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.14 
 
 		 480 aa  64.3  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5671  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.14 
 
 		 480 aa  64.3  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0241273 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5497  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.14 
 
 		 459 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170786 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4945  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.14 
 
 		 459 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0549839 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2334  sensor histidine kinase  38.1 
 
 		 470 aa  63.9  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0112  chemotaxis sensory transducer  32.14 
 
 		 563 aa  63.9  0.000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4564  histidine kinase  37.14 
 
 		 460 aa  63.5  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.562879  normal  0.0736505 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3418  sensor histidine kinase  39.05 
 
 		 481 aa  63.2  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.986219  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2242  hypothetical protein  25 
 
 		 305 aa  63.2  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.184581  hitchhiker  0.000000000000117809 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0162  hypothetical protein  48.44 
 
 		 98 aa  63.2  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.976262 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2639  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 604 aa  62.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1093  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.32 
 
 		 1721 aa  63.2  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1261  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.62 
 
 		 654 aa  62.8  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02702  histidine kinase  35.78 
 
 		 456 aa  62.4  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1783  histidine kinase  37.14 
 
 		 501 aa  62.8  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211372 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2070  sensor histidine kinase  40 
 
 		 466 aa  62  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1462  sensor kinase protein  40 
 
 		 466 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3161  cache domain-contain protein  31.5 
 
 		 152 aa  62  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.535779  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1099  sensor histidine kinase  40 
 
 		 466 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1378  sensor histidine kinase  40 
 
 		 466 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.922617  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3247  putative sensor histidine kinase  40 
 
 		 466 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3132  putative sensor histidine kinase  40 
 
 		 466 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2363  sensor histidine kinase  40 
 
 		 466 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3522  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 477 aa  61.2  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0772  cache, type 2 domain protein  35.2 
 
 		 151 aa  60.8  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0906  sensor histidine kinase  35.48 
 
 		 469 aa  60.5  0.00000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0178022  hitchhiker  0.0000002134 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3277  Cache type 2 domain protein  31.5 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0890612  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1159  hypothetical protein  30.95 
 
 		 148 aa  60.5  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1547  hypothetical protein  21.98 
 
 		 382 aa  59.7  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.197363  normal  0.11395 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4528  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.36 
 
 		 461 aa  59.7  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25442  normal  0.575982 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2109  cache, type 2  32.28 
 
 		 130 aa  59.7  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000614134  hitchhiker  0.00251106 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6398  histidine kinase  39.36 
 
 		 461 aa  60.1  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.176497 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1027  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  36.11 
 
 		 456 aa  60.1  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.573227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1794  hypothetical protein  33.85 
 
 		 168 aa  58.9  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3575  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.07 
 
 		 475 aa  59.7  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3993  histidine kinase  35.24 
 
 		 456 aa  59.3  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0084  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 449 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0616  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  36.44 
 
 		 908 aa  58.5  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0119428 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001822  methyl-accepting chemotaxis protein  35.56 
 
 		 557 aa  58.5  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000124429  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0632  chemotaxis sensory transducer  36.54 
 
 		 736 aa  58.2  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2350  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.37 
 
 		 515 aa  58.2  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0113  chemotaxis sensory transducer  31.25 
 
 		 563 aa  57.4  0.0000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0304  putative cache sensor protein  32.56 
 
 		 152 aa  57.4  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.333934 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0166  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  37.76 
 
 		 601 aa  57  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0086  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  35.11 
 
 		 599 aa  57  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0917  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  36.26 
 
 		 602 aa  56.6  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0520327 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2596  methyl-accepting chemotaxis protein  32.58 
 
 		 564 aa  56.2  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000057467  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.36 
 
 		 478 aa  56.2  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.304751 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1869  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  30.84 
 
 		 607 aa  56.6  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41030  Periplasmic sensory histidine protein kinase, two-component  34.29 
 
 		 458 aa  56.2  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0649951  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2947  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.44 
 
 		 749 aa  56.2  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.732257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1528  cache type 2 domain-containing protein  30.71 
 
 		 129 aa  54.7  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0452  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.52 
 
 		 955 aa  54.7  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2728  chemotaxis sensory transducer  31.25 
 
 		 544 aa  54.3  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00837045  normal  0.306222 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1009  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  30 
 
 		 569 aa  54.3  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.103849  normal  0.0253995 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1405  sensor histidine kinase  31.76 
 
 		 483 aa  54.3  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3112  chemotaxis sensory transducer  36.79 
 
 		 541 aa  53.9  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0877  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.11 
 
 		 474 aa  52.8  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.858486  normal  0.37178 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>