21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1547 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1547  hypothetical protein  100 
 
 
382 aa  779    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.197363  normal  0.11395 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1237  methyl-accepting chemotaxis protein  28.15 
 
 
267 aa  104  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0609367 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0520  methyl-accepting chemotaxis protein  27.57 
 
 
289 aa  95.9  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2463  hypothetical protein  45.74 
 
 
392 aa  87  5e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0059  Extracellular ligand-binding receptor  25.21 
 
 
599 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0332  putative lipoprotein  44.44 
 
 
134 aa  71.6  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0572  hypothetical protein  51.79 
 
 
177 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0493  hypothetical protein  48.28 
 
 
168 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3381  hypothetical protein  51.79 
 
 
177 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.870731 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2754  hypothetical protein  28.23 
 
 
310 aa  68.2  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3551  hypothetical protein  50 
 
 
176 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0720  hypothetical protein  45.61 
 
 
169 aa  65.5  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02579  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.03 
 
 
169 aa  64.3  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.146868  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2473  cache type 2 domain-containing protein  21.98 
 
 
551 aa  60.1  0.00000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0102  hypothetical protein  36.62 
 
 
125 aa  59.7  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1294  Signal transduction histidine kinase-like  23.11 
 
 
526 aa  57.4  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.212587  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0429  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.81 
 
 
955 aa  54.3  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0452  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.63 
 
 
955 aa  53.9  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0702  hypothetical protein  23.4 
 
 
564 aa  50.4  0.00005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0120  hypothetical protein  40.58 
 
 
74 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0691  hypothetical protein  21.49 
 
 
564 aa  44.7  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.526813  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>