35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2463 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_2463  hypothetical protein  100 
 
 
392 aa  793    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1547  hypothetical protein  43.88 
 
 
382 aa  87  5e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.197363  normal  0.11395 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0493  hypothetical protein  53.12 
 
 
168 aa  77  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0572  hypothetical protein  47.69 
 
 
177 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3551  hypothetical protein  50 
 
 
176 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0332  putative lipoprotein  40.54 
 
 
134 aa  72.4  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3381  hypothetical protein  50 
 
 
177 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.870731 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0720  hypothetical protein  44.29 
 
 
169 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0102  hypothetical protein  38.36 
 
 
125 aa  65.1  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0979  protein of unknown function DUF333  48 
 
 
81 aa  62  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00603291  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4072  hypothetical protein  43.33 
 
 
83 aa  58.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0719802 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02579  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.52 
 
 
169 aa  56.6  0.0000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.146868  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2198  protein of unknown function DUF333  43.86 
 
 
501 aa  56.6  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0221  hypothetical protein  48.89 
 
 
124 aa  52  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0123  hypothetical protein  41.07 
 
 
98 aa  49.3  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0162016 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0128  hypothetical protein  39.29 
 
 
98 aa  48.9  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000259025 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0995  hypothetical protein  34 
 
 
87 aa  47.8  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0129  hypothetical protein  40 
 
 
98 aa  47.4  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000902821 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3072  hypothetical protein  41.3 
 
 
512 aa  47  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00570768  hitchhiker  0.00425561 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0120  hypothetical protein  37.93 
 
 
74 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0128  hypothetical protein  38 
 
 
85 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0538  hemolysin  35.38 
 
 
93 aa  45.1  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1095  hypothetical protein  26.49 
 
 
175 aa  45.1  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.383064 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0135  hemolysin protein, putative  37.5 
 
 
96 aa  45.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1383  putative hemolysin  38 
 
 
83 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000104622 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1400  putative hemolysin  38 
 
 
83 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.173882 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1367  putative hemolysin  38 
 
 
83 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.603664 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1903  putative hemolysin  38 
 
 
83 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.238731  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0133  hypothetical protein  38 
 
 
85 aa  44.3  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4226  hypothetical protein  38 
 
 
82 aa  44.3  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.998691  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2083  hypothetical protein  38 
 
 
83 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000368011 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0132  protein of unknown function DUF333  38 
 
 
85 aa  44.3  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0124  hypothetical protein  40 
 
 
160 aa  43.1  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2199  hypothetical protein  43.48 
 
 
93 aa  43.1  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2321  hypothetical protein  43.48 
 
 
93 aa  43.1  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.552946  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>