12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0102 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0102  hypothetical protein  100 
 
 		 125 aa  255  1e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02579  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.41 
 
 		 169 aa  65.9  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.146868  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2463  hypothetical protein  38.36 
 
 		 392 aa  65.1  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0493  hypothetical protein  37.33 
 
 		 168 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0572  hypothetical protein  31.18 
 
 		 177 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3551  hypothetical protein  31.18 
 
 		 176 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3381  hypothetical protein  31.18 
 
 		 177 aa  63.5  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.870731 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0720  hypothetical protein  31.65 
 
 		 169 aa  60.8  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1547  hypothetical protein  36.62 
 
 		 382 aa  59.7  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.197363  normal  0.11395 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0120  hypothetical protein  32.39 
 
 		 74 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3523  hypothetical protein  35.14 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.394775  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0332  putative lipoprotein  31.08 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>