64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2816 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2816  putative cache sensor protein  100 
 
 
285 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4480  hypothetical protein  38.87 
 
 
282 aa  186  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.109317 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2242  hypothetical protein  36.23 
 
 
305 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.184581  hitchhiker  0.000000000000117809 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1452  putative cache sensor protein  32.44 
 
 
452 aa  99.8  5e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3161  cache domain-contain protein  37.5 
 
 
152 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.535779  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3277  Cache type 2 domain protein  37.59 
 
 
152 aa  89  8e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0890612  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1252  cache type 2 domain-containing protein  24.48 
 
 
302 aa  88.2  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.751516  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0332  cache type 2 domain-containing protein  32.39 
 
 
153 aa  81.6  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0349612  normal  0.499668 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0762  putative cache sensor protein  33.51 
 
 
478 aa  80.9  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.197038  normal  0.180889 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3066  cache type 2 domain-containing protein  30.16 
 
 
549 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1908  cache type 2 domain-containing protein  40.5 
 
 
183 aa  76.3  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1876  hypothetical protein  33.11 
 
 
152 aa  75.9  0.0000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0770276  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1642  cache type 2 domain-containing protein  33.58 
 
 
146 aa  72.8  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000155098  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0638  putative cache sensor protein  40.31 
 
 
188 aa  72.8  0.000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.05692  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2473  cache type 2 domain-containing protein  30.42 
 
 
551 aa  72.4  0.000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2563  putative cache sensor protein  30.67 
 
 
189 aa  68.9  0.00000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.800793 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1715  hypothetical protein  32.54 
 
 
151 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0227611  normal  0.523463 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0304  putative cache sensor protein  31.06 
 
 
152 aa  67  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.333934 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1528  cache type 2 domain-containing protein  30.58 
 
 
129 aa  66.6  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1708  Cache, type 2  28.87 
 
 
153 aa  66.6  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0920811 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2109  cache, type 2  27.73 
 
 
130 aa  65.9  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000614134  hitchhiker  0.00251106 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4272  Cache type 2 domain protein  31.2 
 
 
151 aa  65.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.819687  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0772  cache, type 2 domain protein  29.61 
 
 
151 aa  64.3  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3582  Cache, type 2  30.4 
 
 
151 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.351306  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2350  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.06 
 
 
515 aa  63.5  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2364  cache type 2 domain-containing protein  30.65 
 
 
160 aa  61.6  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1093  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.13 
 
 
1721 aa  61.6  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0691  hypothetical protein  33.08 
 
 
564 aa  61.6  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.526813  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0701  hypothetical protein  26.87 
 
 
565 aa  60.5  0.00000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.385527  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0690  hypothetical protein  25.27 
 
 
598 aa  58.9  0.00000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.321962  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0702  hypothetical protein  31.5 
 
 
564 aa  58.2  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1642  hypothetical protein  32.56 
 
 
521 aa  58.5  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1294  Signal transduction histidine kinase-like  28.9 
 
 
526 aa  57.4  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.212587  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1159  hypothetical protein  30.58 
 
 
148 aa  57  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2065  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.28 
 
 
554 aa  57  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.460232  normal  0.464376 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2273  hypothetical protein  32.17 
 
 
148 aa  56.2  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104576  normal  0.662685 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1888  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.28 
 
 
487 aa  55.8  0.0000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1769  hypothetical protein  28.87 
 
 
148 aa  55.8  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17793  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45810  hypothetical protein  28.37 
 
 
145 aa  54.3  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1445  putative cache sensor protein  31.3 
 
 
192 aa  53.9  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3618  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.59 
 
 
512 aa  53.5  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0151839  normal  0.0370629 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3511  hypothetical protein  31.88 
 
 
148 aa  53.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.751588  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0349  Signal transduction histidine kinase-like  33.64 
 
 
181 aa  52.4  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.510339 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0704  hypothetical protein  24.31 
 
 
553 aa  51.6  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2342  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.5 
 
 
508 aa  51.6  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.10605  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3011  hypothetical protein  29.45 
 
 
148 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.438725  normal  0.345508 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1646  diguanylate cyclase  20.29 
 
 
580 aa  50.4  0.00004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000165959  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2783  methyl-accepting chemotaxisprotein  24.22 
 
 
690 aa  50.1  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.468562 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2327  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.13 
 
 
554 aa  48.9  0.00009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.644098  normal  0.637343 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1027  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  32.97 
 
 
456 aa  48.9  0.00009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.573227  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2734  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.58 
 
 
751 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2286  cache type 2 domain-containing protein  27.07 
 
 
320 aa  48.1  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.19 
 
 
499 aa  45.8  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.729026  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3405  histidine kinase  32.95 
 
 
488 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.352666  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3728  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 
488 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2486  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.63 
 
 
504 aa  44.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.961139  normal  0.110025 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 
510 aa  44.3  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3547  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.62 
 
 
676 aa  44.3  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.126617  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2212  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.91 
 
 
549 aa  43.5  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5034  cache type 2 domain-containing protein  32.84 
 
 
169 aa  43.5  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.985276 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2947  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.56 
 
 
749 aa  43.1  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.732257  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0632  chemotaxis sensory transducer  34.12 
 
 
736 aa  43.5  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2617  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.94 
 
 
548 aa  42.4  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.224982  normal  0.210295 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.43 
 
 
548 aa  42.4  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000213036  normal  0.437149 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>