182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_3277 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_3277  Cache type 2 domain protein  100 
 
 
152 aa  309  1e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0890612  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3161  cache domain-contain protein  93.42 
 
 
152 aa  295  1e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.535779  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0304  putative cache sensor protein  50 
 
 
152 aa  142  1e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.333934 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1708  Cache, type 2  40.82 
 
 
153 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0920811 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2364  cache type 2 domain-containing protein  44.8 
 
 
160 aa  114  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1715  hypothetical protein  44.8 
 
 
151 aa  114  6e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0227611  normal  0.523463 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1093  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.16 
 
 
1721 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4272  Cache type 2 domain protein  42.74 
 
 
151 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.819687  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3582  Cache, type 2  43.55 
 
 
151 aa  110  9e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.351306  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0332  cache type 2 domain-containing protein  36 
 
 
153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0349612  normal  0.499668 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1876  hypothetical protein  38.16 
 
 
152 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0770276  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1528  cache type 2 domain-containing protein  34.71 
 
 
129 aa  99.4  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2563  putative cache sensor protein  40.83 
 
 
189 aa  96.7  9e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.800793 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2109  cache, type 2  35.77 
 
 
130 aa  95.9  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000614134  hitchhiker  0.00251106 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0638  putative cache sensor protein  41.32 
 
 
188 aa  94.7  4e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.05692  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2816  putative cache sensor protein  38.82 
 
 
285 aa  94  7e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0772  cache, type 2 domain protein  32.89 
 
 
151 aa  91.3  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1252  cache type 2 domain-containing protein  35.48 
 
 
302 aa  90.5  6e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.751516  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1642  cache type 2 domain-containing protein  34.69 
 
 
146 aa  89.4  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000155098  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1908  cache type 2 domain-containing protein  39.17 
 
 
183 aa  88.2  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.51 
 
 
499 aa  85.5  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.729026  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1452  putative cache sensor protein  36.03 
 
 
452 aa  84  7e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3066  cache type 2 domain-containing protein  34.96 
 
 
549 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1445  putative cache sensor protein  38.33 
 
 
192 aa  75.5  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1159  hypothetical protein  29.84 
 
 
148 aa  73.6  0.0000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5034  cache type 2 domain-containing protein  34.9 
 
 
169 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.985276 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2242  hypothetical protein  36.22 
 
 
305 aa  72  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.184581  hitchhiker  0.000000000000117809 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2342  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.65 
 
 
508 aa  72.4  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.10605  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1888  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.03 
 
 
487 aa  72  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2065  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.25 
 
 
554 aa  71.2  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.460232  normal  0.464376 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0349  Signal transduction histidine kinase-like  35.29 
 
 
181 aa  70.5  0.000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.510339 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0762  putative cache sensor protein  35.25 
 
 
478 aa  68.9  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.197038  normal  0.180889 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0701  hypothetical protein  30 
 
 
565 aa  67.8  0.00000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.385527  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5497  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.22 
 
 
459 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170786 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4945  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.22 
 
 
459 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0549839 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0027  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.22 
 
 
461 aa  67  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.755533 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2350  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.86 
 
 
515 aa  66.6  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5188  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.13 
 
 
480 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.22 
 
 
459 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.134921 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5671  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.13 
 
 
480 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0241273 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2334  sensor histidine kinase  35.61 
 
 
470 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4564  histidine kinase  38.04 
 
 
460 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.562879  normal  0.0736505 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0704  hypothetical protein  33.59 
 
 
553 aa  65.1  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4480  hypothetical protein  32.03 
 
 
282 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.109317 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1646  diguanylate cyclase  31.46 
 
 
580 aa  63.9  0.0000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000165959  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2486  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 
504 aa  63.9  0.0000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.961139  normal  0.110025 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2070  sensor histidine kinase  38.04 
 
 
466 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1462  sensor kinase protein  38.04 
 
 
466 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1099  sensor histidine kinase  38.04 
 
 
466 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1378  sensor histidine kinase  38.04 
 
 
466 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.922617  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3247  putative sensor histidine kinase  38.04 
 
 
466 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3132  putative sensor histidine kinase  38.04 
 
 
466 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2363  sensor histidine kinase  38.04 
 
 
466 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4477  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.35 
 
 
471 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1642  hypothetical protein  32.56 
 
 
521 aa  62.4  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3618  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.23 
 
 
512 aa  61.6  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0151839  normal  0.0370629 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2473  cache type 2 domain-containing protein  31.5 
 
 
551 aa  60.5  0.000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0789  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.06 
 
 
469 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.37 
 
 
564 aa  60.1  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2141  chemotaxis sensory transducer  34.59 
 
 
708 aa  59.3  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0690  hypothetical protein  28.68 
 
 
598 aa  58.9  0.00000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.321962  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3759  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.83 
 
 
554 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0990388  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0632  chemotaxis sensory transducer  37.08 
 
 
736 aa  57.4  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.41 
 
 
471 aa  57  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629472  normal  0.491206 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1423  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.09 
 
 
584 aa  56.2  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3575  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28 
 
 
475 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0895  sensor histidine kinase  31.87 
 
 
451 aa  56.6  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.622783  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2242  diguanylate cyclase  33.7 
 
 
961 aa  55.5  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.031286  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1294  Signal transduction histidine kinase-like  32.48 
 
 
526 aa  55.1  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.212587  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3993  histidine kinase  27.08 
 
 
456 aa  55.1  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02702  histidine kinase  32.97 
 
 
456 aa  55.1  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 
486 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0906  sensor histidine kinase  33.33 
 
 
469 aa  55.1  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0178022  hitchhiker  0.0000002134 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0691  hypothetical protein  28.57 
 
 
564 aa  54.3  0.0000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.526813  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6398  histidine kinase  32.61 
 
 
461 aa  53.9  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.176497 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0702  hypothetical protein  26.72 
 
 
564 aa  53.9  0.0000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1261  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.7 
 
 
654 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4528  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 
461 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25442  normal  0.575982 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0837  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.35 
 
 
554 aa  53.1  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003135  sensor histidine kinase  32.97 
 
 
451 aa  52.4  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.291514  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2291  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 
464 aa  52.8  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1918  putative cache sensor protein  36.99 
 
 
632 aa  52.4  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.149363  normal  0.217415 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2783  methyl-accepting chemotaxisprotein  33.71 
 
 
690 aa  52.4  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.468562 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3418  sensor histidine kinase  25.71 
 
 
481 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.986219  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2596  methyl-accepting chemotaxis protein  32.97 
 
 
564 aa  52  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000057467  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1261  sensor histidine kinase  32.26 
 
 
467 aa  51.6  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.405254  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001822  methyl-accepting chemotaxis protein  31.87 
 
 
557 aa  50.8  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000124429  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0113  chemotaxis sensory transducer  32.61 
 
 
563 aa  50.4  0.000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2765  amino acid ABC transporter periplasmic protein  35.29 
 
 
401 aa  50.1  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3728  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.87 
 
 
488 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0166  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  31.4 
 
 
601 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41030  Periplasmic sensory histidine protein kinase, two-component  34.41 
 
 
458 aa  48.9  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0649951  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0877  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.26 
 
 
474 aa  49.3  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.858486  normal  0.37178 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2947  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.57 
 
 
749 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.732257  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2286  cache type 2 domain-containing protein  30.36 
 
 
320 aa  48.9  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3405  histidine kinase  31.87 
 
 
488 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.352666  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 
485 aa  48.9  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12569  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3522  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 
477 aa  48.5  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3600  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.03 
 
 
546 aa  47.8  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3709  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  31.03 
 
 
546 aa  47.8  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>