197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3161 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_3161  cache domain-contain protein  100 
 
 		 152 aa  310  2.9999999999999996e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.535779  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3277  Cache type 2 domain protein  93.42 
 
 		 152 aa  278  2e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0890612  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0304  putative cache sensor protein  49.23 
 
 		 152 aa  140  4e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.333934 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2364  cache type 2 domain-containing protein  44.8 
 
 		 160 aa  115  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1708  Cache, type 2  38.1 
 
 		 153 aa  114  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0920811 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1715  hypothetical protein  43.2 
 
 		 151 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0227611  normal  0.523463 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1093  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.16 
 
 		 1721 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1876  hypothetical protein  38.82 
 
 		 152 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0770276  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4272  Cache type 2 domain protein  41.13 
 
 		 151 aa  110  9e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.819687  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3582  Cache, type 2  41.94 
 
 		 151 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.351306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0332  cache type 2 domain-containing protein  34.87 
 
 		 153 aa  107  6e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0349612  normal  0.499668 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1528  cache type 2 domain-containing protein  35.54 
 
 		 129 aa  102  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2563  putative cache sensor protein  41.67 
 
 		 189 aa  98.2  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.800793 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2109  cache, type 2  36.59 
 
 		 130 aa  97.8  5e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000614134  hitchhiker  0.00251106 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0638  putative cache sensor protein  40.5 
 
 		 188 aa  94  6e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.05692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2816  putative cache sensor protein  37.5 
 
 		 285 aa  94  6e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0772  cache, type 2 domain protein  33.56 
 
 		 151 aa  92  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1642  cache type 2 domain-containing protein  35.37 
 
 		 146 aa  90.5  8e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000155098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1452  putative cache sensor protein  38.24 
 
 		 452 aa  89.7  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1252  cache type 2 domain-containing protein  33.87 
 
 		 302 aa  90.1  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.751516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1908  cache type 2 domain-containing protein  38.33 
 
 		 183 aa  88.2  4e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.8 
 
 		 499 aa  86.3  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.729026  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3066  cache type 2 domain-containing protein  34.15 
 
 		 549 aa  77.8  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1445  putative cache sensor protein  38.33 
 
 		 192 aa  76.6  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5034  cache type 2 domain-containing protein  33.11 
 
 		 169 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.985276 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1159  hypothetical protein  30.65 
 
 		 148 aa  75.1  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2242  hypothetical protein  37.8 
 
 		 305 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.184581  hitchhiker  0.000000000000117809 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1888  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.25 
 
 		 487 aa  72  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2342  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.5 
 
 		 508 aa  72  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.10605  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2065  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.47 
 
 		 554 aa  71.2  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.460232  normal  0.464376 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0349  Signal transduction histidine kinase-like  34.45 
 
 		 181 aa  70.1  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.510339 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5497  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.22 
 
 		 459 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170786 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4945  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.22 
 
 		 459 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0549839 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0027  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.22 
 
 		 461 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.755533 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0701  hypothetical protein  30.16 
 
 		 565 aa  67.8  0.00000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.385527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2350  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.07 
 
 		 515 aa  67  0.00000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4480  hypothetical protein  32.81 
 
 		 282 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109317 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5188  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.13 
 
 		 480 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5671  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.13 
 
 		 480 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0241273 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.13 
 
 		 459 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.134921 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0762  putative cache sensor protein  34.43 
 
 		 478 aa  65.9  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.197038  normal  0.180889 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4564  histidine kinase  38.04 
 
 		 460 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.562879  normal  0.0736505 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2334  sensor histidine kinase  34.85 
 
 		 470 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0704  hypothetical protein  33.59 
 
 		 553 aa  65.5  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2486  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.41 
 
 		 504 aa  64.3  0.0000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.961139  normal  0.110025 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1646  diguanylate cyclase  30.34 
 
 		 580 aa  63.9  0.0000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000165959  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4477  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.59 
 
 		 471 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2070  sensor histidine kinase  36.96 
 
 		 466 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3132  putative sensor histidine kinase  36.96 
 
 		 466 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1462  sensor kinase protein  36.96 
 
 		 466 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1099  sensor histidine kinase  36.96 
 
 		 466 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1378  sensor histidine kinase  36.96 
 
 		 466 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.922617  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3247  putative sensor histidine kinase  36.96 
 
 		 466 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2363  sensor histidine kinase  36.96 
 
 		 466 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1642  hypothetical protein  32.56 
 
 		 521 aa  62.8  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2473  cache type 2 domain-containing protein  31.5 
 
 		 551 aa  62  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3618  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.46 
 
 		 512 aa  61.2  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0151839  normal  0.0370629 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0789  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.06 
 
 		 469 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2141  chemotaxis sensory transducer  33.83 
 
 		 708 aa  60.1  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0690  hypothetical protein  28.68 
 
 		 598 aa  59.3  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.321962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2242  diguanylate cyclase  34.78 
 
 		 961 aa  58.5  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.031286  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.41 
 
 		 471 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629472  normal  0.491206 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.57 
 
 		 564 aa  57.8  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0895  sensor histidine kinase  31.87 
 
 		 451 aa  57.8  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.622783  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0906  sensor histidine kinase  34.41 
 
 		 469 aa  57.4  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0178022  hitchhiker  0.0000002134 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1423  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.09 
 
 		 584 aa  57  0.00000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02702  histidine kinase  32.97 
 
 		 456 aa  56.6  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1294  Signal transduction histidine kinase-like  32.48 
 
 		 526 aa  56.6  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.212587  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1261  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.96 
 
 		 654 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 		 486 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3759  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.71 
 
 		 554 aa  55.1  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0990388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0691  hypothetical protein  28.57 
 
 		 564 aa  55.1  0.0000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.526813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0632  chemotaxis sensory transducer  34.83 
 
 		 736 aa  54.3  0.0000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2783  methyl-accepting chemotaxisprotein  33.71 
 
 		 690 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.468562 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6398  histidine kinase  31.52 
 
 		 461 aa  53.9  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.176497 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3993  histidine kinase  29.67 
 
 		 456 aa  53.9  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3575  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 		 475 aa  53.9  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2291  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 		 464 aa  53.1  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4528  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.52 
 
 		 461 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25442  normal  0.575982 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003135  sensor histidine kinase  32.97 
 
 		 451 aa  53.1  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.291514  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1918  putative cache sensor protein  38.36 
 
 		 632 aa  53.5  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.149363  normal  0.217415 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1261  sensor histidine kinase  32.26 
 
 		 467 aa  52.8  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.405254  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0166  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  32.56 
 
 		 601 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3709  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  34.48 
 
 		 546 aa  52.4  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0702  hypothetical protein  25.95 
 
 		 564 aa  52.8  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001822  methyl-accepting chemotaxis protein  32.97 
 
 		 557 aa  52  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000124429  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2286  cache type 2 domain-containing protein  29.11 
 
 		 320 aa  51.6  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3600  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.48 
 
 		 546 aa  52  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3728  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.87 
 
 		 488 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3405  histidine kinase  31.87 
 
 		 488 aa  50.8  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.352666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41030  Periplasmic sensory histidine protein kinase, two-component  35.48 
 
 		 458 aa  50.8  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0649951  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0837  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.26 
 
 		 554 aa  50.4  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3699  methyl-accepting chemotaxis protein  25.69 
 
 		 543 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3418  sensor histidine kinase  25.14 
 
 		 481 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.986219  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.46 
 
 		 701 aa  50.1  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000562313  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3522  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.7 
 
 		 477 aa  50.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2601  chemotaxis sensory transducer  34.44 
 
 		 569 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.441915  normal  0.36116 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1783  histidine kinase  32.61 
 
 		 501 aa  48.9  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211372 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.35 
 
 		 485 aa  49.3  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12569  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000971  methyl-accepting chemotaxis protein  26.01 
 
 		 553 aa  49.3  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370017  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>