160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0349 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_0349  Signal transduction histidine kinase-like  100 
 
 		 181 aa  377  1e-104  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.510339 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2563  putative cache sensor protein  64.75 
 
 		 189 aa  173  9.999999999999999e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.800793 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1452  putative cache sensor protein  50.31 
 
 		 452 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1908  cache type 2 domain-containing protein  61.98 
 
 		 183 aa  160  1e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0638  putative cache sensor protein  57.85 
 
 		 188 aa  157  9e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.05692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1445  putative cache sensor protein  50 
 
 		 192 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0762  putative cache sensor protein  44.09 
 
 		 478 aa  115  3e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.197038  normal  0.180889 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2286  cache type 2 domain-containing protein  44.29 
 
 		 320 aa  112  3e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2473  cache type 2 domain-containing protein  40.4 
 
 		 551 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1642  hypothetical protein  43.31 
 
 		 521 aa  103  1e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1294  Signal transduction histidine kinase-like  36.91 
 
 		 526 aa  99  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.212587  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0704  hypothetical protein  40 
 
 		 553 aa  98.6  4e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0690  hypothetical protein  36.13 
 
 		 598 aa  98.2  5e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.321962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0701  hypothetical protein  36.09 
 
 		 565 aa  93.6  1e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.385527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0702  hypothetical protein  37.5 
 
 		 564 aa  92  4e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0691  hypothetical protein  36.8 
 
 		 564 aa  87.4  1e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.526813  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1876  hypothetical protein  36.07 
 
 		 152 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0770276  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1093  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.06 
 
 		 1721 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0332  cache type 2 domain-containing protein  35.14 
 
 		 153 aa  76.6  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0349612  normal  0.499668 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1159  hypothetical protein  36.29 
 
 		 148 aa  73.2  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3277  Cache type 2 domain protein  35.29 
 
 		 152 aa  70.5  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0890612  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2639  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.82 
 
 		 604 aa  70.1  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3161  cache domain-contain protein  34.45 
 
 		 152 aa  70.1  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.535779  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2109  cache, type 2  34.23 
 
 		 130 aa  69.7  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000614134  hitchhiker  0.00251106 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0304  putative cache sensor protein  33.33 
 
 		 152 aa  68.9  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.333934 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0640  hypothetical protein  64.81 
 
 		 113 aa  68.2  0.00000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0398047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1252  cache type 2 domain-containing protein  33.8 
 
 		 302 aa  67  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.751516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0917  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  36.67 
 
 		 602 aa  66.6  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0520327 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3405  histidine kinase  36.67 
 
 		 488 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.352666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3522  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 477 aa  63.2  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0021  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  37.78 
 
 		 487 aa  62.4  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.130425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1261  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  29.1 
 
 		 654 aa  62.4  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0086  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  33.33 
 
 		 599 aa  62.4  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1528  cache type 2 domain-containing protein  30.58 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1423  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.78 
 
 		 584 aa  62  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3728  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 		 488 aa  61.6  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1708  Cache, type 2  28.46 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0920811 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3261  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30 
 
 		 613 aa  60.1  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0581  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.28 
 
 		 554 aa  59.7  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1261  sensor histidine kinase  34.44 
 
 		 467 aa  59.3  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.405254  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2364  cache type 2 domain-containing protein  29.84 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.59 
 
 		 478 aa  59.3  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.304751 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0895  sensor histidine kinase  34.07 
 
 		 451 aa  58.9  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.622783  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0674  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 		 447 aa  58.5  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.504244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3418  sensor histidine kinase  37.78 
 
 		 481 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.986219  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4477  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.93 
 
 		 471 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0789  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 469 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3575  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 		 475 aa  57.4  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1027  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  36.67 
 
 		 456 aa  57  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.573227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3582  Cache, type 2  28.46 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.351306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1783  histidine kinase  35.11 
 
 		 501 aa  56.2  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211372 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0906  sensor histidine kinase  26.09 
 
 		 469 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0178022  hitchhiker  0.0000002134 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4272  Cache type 2 domain protein  27.64 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.819687  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0027  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.44 
 
 		 461 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.755533 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3532  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.11 
 
 		 555 aa  54.3  0.0000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5497  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.44 
 
 		 459 aa  53.9  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170786 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5188  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.44 
 
 		 480 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4945  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.44 
 
 		 459 aa  53.9  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0549839 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5671  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.44 
 
 		 480 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0241273 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41030  Periplasmic sensory histidine protein kinase, two-component  35.56 
 
 		 458 aa  53.5  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0649951  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3993  histidine kinase  30 
 
 		 456 aa  53.9  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0084  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 449 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3217  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  31.96 
 
 		 584 aa  53.5  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.480757 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2366  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.38 
 
 		 560 aa  53.5  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.196109  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1715  hypothetical protein  26.02 
 
 		 151 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0227611  normal  0.523463 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4564  histidine kinase  34.44 
 
 		 460 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.562879  normal  0.0736505 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 		 471 aa  52.4  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629472  normal  0.491206 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2816  putative cache sensor protein  33.64 
 
 		 285 aa  52.4  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2596  methyl-accepting chemotaxis protein  35.79 
 
 		 564 aa  52.8  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000057467  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1794  hypothetical protein  31.3 
 
 		 168 aa  52  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.33 
 
 		 486 aa  52  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0339  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.63 
 
 		 603 aa  52  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.774772 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.22 
 
 		 554 aa  52  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.44 
 
 		 459 aa  51.2  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.134921 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1044  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.63 
 
 		 584 aa  51.2  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0772  cache, type 2 domain protein  31.09 
 
 		 151 aa  51.2  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02702  histidine kinase  32.97 
 
 		 456 aa  51.2  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.02 
 
 		 564 aa  50.8  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001822  methyl-accepting chemotaxis protein  30.77 
 
 		 557 aa  51.2  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000124429  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1009  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  30.85 
 
 		 569 aa  50.8  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.103849  normal  0.0253995 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.2 
 
 		 554 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0630  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.45 
 
 		 554 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3491  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.2 
 
 		 554 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0641  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.58 
 
 		 568 aa  50.4  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3601  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  31.58 
 
 		 554 aa  50.4  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3200  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 554 aa  50.8  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1869  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  25.9 
 
 		 607 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3666  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.58 
 
 		 554 aa  50.4  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0824  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 554 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00067966 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3199  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 554 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.927661 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3299  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 554 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3789  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.58 
 
 		 554 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.46 
 
 		 485 aa  50.1  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12569  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2738  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.02 
 
 		 562 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.809654  normal  0.020868 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003135  sensor histidine kinase  34.07 
 
 		 451 aa  49.3  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.291514  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3052  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 554 aa  49.3  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0777  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.17 
 
 		 712 aa  48.9  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0987  methyl-accepting chemotaxis protein  32.22 
 
 		 554 aa  48.5  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3246  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25 
 
 		 601 aa  48.5  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.416407  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1642  cache type 2 domain-containing protein  25.22 
 
 		 146 aa  48.5  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000155098  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>