16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0640 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0640  hypothetical protein  100 
 
 
113 aa  234  4e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0398047  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2563  putative cache sensor protein  67.86 
 
 
189 aa  82.4  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.800793 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1908  cache type 2 domain-containing protein  55.56 
 
 
183 aa  72.8  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1452  putative cache sensor protein  52.38 
 
 
452 aa  72.4  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0638  putative cache sensor protein  51.47 
 
 
188 aa  71.2  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.05692  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0349  Signal transduction histidine kinase-like  64.81 
 
 
181 aa  68.2  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.510339 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1445  putative cache sensor protein  56.6 
 
 
192 aa  65.1  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0690  hypothetical protein  33.01 
 
 
598 aa  54.7  0.0000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.321962  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1642  hypothetical protein  53.06 
 
 
521 aa  53.5  0.0000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2286  cache type 2 domain-containing protein  39.68 
 
 
320 aa  49.7  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0762  putative cache sensor protein  46.94 
 
 
478 aa  48.5  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.197038  normal  0.180889 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0702  hypothetical protein  42.86 
 
 
564 aa  48.1  0.00004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2473  cache type 2 domain-containing protein  50 
 
 
551 aa  45.8  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0691  hypothetical protein  38.78 
 
 
564 aa  43.9  0.0008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.526813  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0701  hypothetical protein  40.82 
 
 
565 aa  43.9  0.0008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.385527  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0704  hypothetical protein  37.04 
 
 
553 aa  42.7  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>