91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1445 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1445  putative cache sensor protein  100 
 
 		 192 aa  395  1e-109  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2563  putative cache sensor protein  65.17 
 
 		 189 aa  252  2.0000000000000002e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.800793 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1908  cache type 2 domain-containing protein  58.24 
 
 		 183 aa  214  5e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0638  putative cache sensor protein  57.71 
 
 		 188 aa  209  2e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.05692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1452  putative cache sensor protein  51.41 
 
 		 452 aa  177  1e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0349  Signal transduction histidine kinase-like  50 
 
 		 181 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.510339 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0762  putative cache sensor protein  42.55 
 
 		 478 aa  134  9e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.197038  normal  0.180889 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1642  hypothetical protein  42.66 
 
 		 521 aa  107  7.000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0704  hypothetical protein  45.16 
 
 		 553 aa  101  8e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2473  cache type 2 domain-containing protein  44.63 
 
 		 551 aa  100  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0701  hypothetical protein  39.68 
 
 		 565 aa  98.2  6e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.385527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0690  hypothetical protein  39.86 
 
 		 598 aa  96.3  3e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.321962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0702  hypothetical protein  35.86 
 
 		 564 aa  93.6  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1876  hypothetical protein  38.66 
 
 		 152 aa  92.8  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0770276  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2286  cache type 2 domain-containing protein  34.64 
 
 		 320 aa  89.7  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0691  hypothetical protein  40.5 
 
 		 564 aa  89  4e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.526813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1294  Signal transduction histidine kinase-like  41.94 
 
 		 526 aa  86.7  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.212587  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0304  putative cache sensor protein  39.68 
 
 		 152 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.333934 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0332  cache type 2 domain-containing protein  37.4 
 
 		 153 aa  82.4  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0349612  normal  0.499668 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3161  cache domain-contain protein  38.33 
 
 		 152 aa  76.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.535779  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3277  Cache type 2 domain protein  38.33 
 
 		 152 aa  75.1  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0890612  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1528  cache type 2 domain-containing protein  34.45 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1093  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.15 
 
 		 1721 aa  70.5  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0640  hypothetical protein  56.6 
 
 		 113 aa  65.1  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0398047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2109  cache, type 2  36.04 
 
 		 130 aa  65.1  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000614134  hitchhiker  0.00251106 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1252  cache type 2 domain-containing protein  35.85 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.751516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1708  Cache, type 2  32.79 
 
 		 153 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0920811 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2364  cache type 2 domain-containing protein  31.75 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1261  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  29.6 
 
 		 654 aa  59.7  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0162  hypothetical protein  43.33 
 
 		 98 aa  59.7  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.976262 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1423  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.75 
 
 		 584 aa  58.5  0.00000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1159  hypothetical protein  30.65 
 
 		 148 aa  57.4  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4272  Cache type 2 domain protein  29.13 
 
 		 151 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.819687  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1715  hypothetical protein  28.35 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0227611  normal  0.523463 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0895  sensor histidine kinase  34.88 
 
 		 451 aa  56.2  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.622783  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1783  histidine kinase  28.48 
 
 		 501 aa  56.2  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211372 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2334  sensor histidine kinase  30.77 
 
 		 470 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3247  putative sensor histidine kinase  26.9 
 
 		 466 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3132  putative sensor histidine kinase  26.9 
 
 		 466 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2363  sensor histidine kinase  26.9 
 
 		 466 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1099  sensor histidine kinase  26.9 
 
 		 466 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1378  sensor histidine kinase  26.9 
 
 		 466 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.922617  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1462  sensor kinase protein  26.9 
 
 		 466 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2070  sensor histidine kinase  26.9 
 
 		 466 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0906  sensor histidine kinase  30.85 
 
 		 469 aa  54.7  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0178022  hitchhiker  0.0000002134 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0021  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  26.04 
 
 		 487 aa  55.1  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.130425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3582  Cache, type 2  28.35 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.351306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0772  cache, type 2 domain protein  26.59 
 
 		 151 aa  54.3  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2816  putative cache sensor protein  31.3 
 
 		 285 aa  53.9  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3728  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.35 
 
 		 488 aa  53.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.58 
 
 		 486 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3405  histidine kinase  29.35 
 
 		 488 aa  53.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.352666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5671  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.18 
 
 		 480 aa  52  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0241273 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5188  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.18 
 
 		 480 aa  52  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0027  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.18 
 
 		 461 aa  51.6  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.755533 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4564  histidine kinase  31.18 
 
 		 460 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.562879  normal  0.0736505 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1794  hypothetical protein  33.33 
 
 		 168 aa  50.4  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5497  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.11 
 
 		 459 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170786 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4945  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.11 
 
 		 459 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0549839 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3664  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.96 
 
 		 598 aa  48.9  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.197645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0789  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.67 
 
 		 469 aa  48.5  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0084  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 449 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.6 
 
 		 478 aa  48.5  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.304751 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0674  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.45 
 
 		 447 aa  48.1  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.504244  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41030  Periplasmic sensory histidine protein kinase, two-component  27.72 
 
 		 458 aa  48.1  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0649951  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1405  sensor histidine kinase  25.27 
 
 		 483 aa  47.8  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3522  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.79 
 
 		 477 aa  47.4  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3618  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.4 
 
 		 512 aa  47  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0151839  normal  0.0370629 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.03 
 
 		 459 aa  47  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.134921 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4477  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.67 
 
 		 471 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2065  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.37 
 
 		 554 aa  46.6  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.460232  normal  0.464376 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3418  sensor histidine kinase  30 
 
 		 481 aa  45.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.986219  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2639  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.95 
 
 		 604 aa  46.2  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1261  sensor histidine kinase  26.88 
 
 		 467 aa  45.1  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.405254  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2974  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  31.96 
 
 		 579 aa  45.1  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00885268  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.7 
 
 		 471 aa  45.1  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629472  normal  0.491206 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3532  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.08 
 
 		 555 aa  45.1  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1027  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  30 
 
 		 456 aa  44.7  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.573227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3575  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 475 aa  44.7  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2366  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.26 
 
 		 560 aa  44.3  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.196109  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1888  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.67 
 
 		 487 aa  43.9  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0357  sensor histidine kinase  28.89 
 
 		 459 aa  44.3  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003135  sensor histidine kinase  28.12 
 
 		 451 aa  43.9  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.291514  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4331  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.59 
 
 		 534 aa  42.7  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.555356 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02702  histidine kinase  27.08 
 
 		 456 aa  42.7  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3993  histidine kinase  25 
 
 		 456 aa  42.7  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3066  cache type 2 domain-containing protein  28.93 
 
 		 549 aa  43.1  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1646  diguanylate cyclase  31.91 
 
 		 580 aa  42.4  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000165959  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2291  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 464 aa  42.4  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4788  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.83 
 
 		 561 aa  41.2  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.79 
 
 		 701 aa  41.2  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000562313  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>