20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1794 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1794  hypothetical protein  100 
 
 
168 aa  345  1e-94  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0638  putative cache sensor protein  32.53 
 
 
188 aa  65.9  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.05692  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2563  putative cache sensor protein  29.71 
 
 
189 aa  63.9  0.0000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.800793 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2473  cache type 2 domain-containing protein  33.85 
 
 
551 aa  58.9  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0762  putative cache sensor protein  31.11 
 
 
478 aa  57.8  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.197038  normal  0.180889 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1452  putative cache sensor protein  33.87 
 
 
452 aa  57  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0691  hypothetical protein  31.3 
 
 
564 aa  52.4  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.526813  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0349  Signal transduction histidine kinase-like  31.3 
 
 
181 aa  52  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.510339 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1445  putative cache sensor protein  33.33 
 
 
192 aa  50.8  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0162  hypothetical protein  37.5 
 
 
98 aa  50.8  0.000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.976262 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1908  cache type 2 domain-containing protein  30.15 
 
 
183 aa  50.4  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2286  cache type 2 domain-containing protein  26.4 
 
 
320 aa  48.5  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1876  hypothetical protein  32.11 
 
 
152 aa  48.1  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0770276  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1528  cache type 2 domain-containing protein  33.33 
 
 
129 aa  44.3  0.0009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2109  cache, type 2  31.96 
 
 
130 aa  44.3  0.0009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000614134  hitchhiker  0.00251106 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1642  hypothetical protein  28.69 
 
 
521 aa  43.5  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0690  hypothetical protein  29.41 
 
 
598 aa  43.1  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.321962  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0332  cache type 2 domain-containing protein  29.03 
 
 
153 aa  43.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0349612  normal  0.499668 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0304  putative cache sensor protein  33.93 
 
 
152 aa  40.8  0.009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.333934 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3161  cache domain-contain protein  29.63 
 
 
152 aa  40.8  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.535779  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>