120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0304 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0304  putative cache sensor protein  100 
 
 		 152 aa  313  5e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.333934 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2364  cache type 2 domain-containing protein  61.48 
 
 		 160 aa  166  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1715  hypothetical protein  57.69 
 
 		 151 aa  150  7e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0227611  normal  0.523463 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4272  Cache type 2 domain protein  58.4 
 
 		 151 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.819687  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3582  Cache, type 2  57.6 
 
 		 151 aa  148  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.351306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1708  Cache, type 2  50.35 
 
 		 153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0920811 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3161  cache domain-contain protein  47.62 
 
 		 152 aa  143  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.535779  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3277  Cache type 2 domain protein  50 
 
 		 152 aa  142  1e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0890612  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1876  hypothetical protein  39.46 
 
 		 152 aa  120  6e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0770276  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0332  cache type 2 domain-containing protein  41.5 
 
 		 153 aa  117  3.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0349612  normal  0.499668 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0772  cache, type 2 domain protein  38.82 
 
 		 151 aa  113  7.999999999999999e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1528  cache type 2 domain-containing protein  39.34 
 
 		 129 aa  112  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.93 
 
 		 499 aa  110  5e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.729026  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2109  cache, type 2  39.2 
 
 		 130 aa  105  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000614134  hitchhiker  0.00251106 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1252  cache type 2 domain-containing protein  37.04 
 
 		 302 aa  102  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.751516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1093  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.52 
 
 		 1721 aa  100  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2563  putative cache sensor protein  37.14 
 
 		 189 aa  93.6  8e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.800793 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0638  putative cache sensor protein  38.1 
 
 		 188 aa  87  9e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.05692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1159  hypothetical protein  35.54 
 
 		 148 aa  85.1  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2342  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.38 
 
 		 508 aa  84.7  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.10605  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1445  putative cache sensor protein  40.5 
 
 		 192 aa  84  7e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1888  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.86 
 
 		 487 aa  82.8  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1908  cache type 2 domain-containing protein  33.12 
 
 		 183 aa  82.8  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2065  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.55 
 
 		 554 aa  79  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.460232  normal  0.464376 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1452  putative cache sensor protein  32.12 
 
 		 452 aa  78.2  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2350  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.03 
 
 		 515 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3066  cache type 2 domain-containing protein  32.52 
 
 		 549 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2486  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.16 
 
 		 504 aa  71.6  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.961139  normal  0.110025 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2816  putative cache sensor protein  30.77 
 
 		 285 aa  71.2  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2242  hypothetical protein  35.25 
 
 		 305 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.184581  hitchhiker  0.000000000000117809 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0349  Signal transduction histidine kinase-like  33.33 
 
 		 181 aa  68.6  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.510339 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1642  cache type 2 domain-containing protein  28.47 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000155098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4480  hypothetical protein  31.47 
 
 		 282 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109317 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0704  hypothetical protein  33.87 
 
 		 553 aa  63.2  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3618  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.22 
 
 		 512 aa  62.4  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0151839  normal  0.0370629 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0762  putative cache sensor protein  33.88 
 
 		 478 aa  62  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.197038  normal  0.180889 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1642  hypothetical protein  31.75 
 
 		 521 aa  60.5  0.000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0162  hypothetical protein  39.44 
 
 		 98 aa  59.7  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.976262 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2286  cache type 2 domain-containing protein  34.43 
 
 		 320 aa  58.9  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0701  hypothetical protein  26.72 
 
 		 565 aa  58.2  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.385527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2473  cache type 2 domain-containing protein  32.56 
 
 		 551 aa  57.8  0.00000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2242  diguanylate cyclase  30.11 
 
 		 961 aa  56.6  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.031286  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0691  hypothetical protein  31.5 
 
 		 564 aa  53.9  0.0000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.526813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1646  diguanylate cyclase  31.4 
 
 		 580 aa  53.5  0.0000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000165959  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1253  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.14 
 
 		 567 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.010155 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5034  cache type 2 domain-containing protein  30.4 
 
 		 169 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.985276 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3993  histidine kinase  30.68 
 
 		 456 aa  52  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0702  hypothetical protein  25.2 
 
 		 564 aa  50.8  0.000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1423  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.27 
 
 		 584 aa  49.7  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0690  hypothetical protein  29.17 
 
 		 598 aa  48.5  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.321962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0166  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  26.67 
 
 		 601 aa  48.9  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2141  chemotaxis sensory transducer  27.97 
 
 		 708 aa  48.1  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3575  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.03 
 
 		 475 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.38 
 
 		 564 aa  47.8  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1769  hypothetical protein  29.45 
 
 		 148 aa  47.4  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2334  sensor histidine kinase  29.69 
 
 		 470 aa  47.4  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1462  sensor kinase protein  29.69 
 
 		 466 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3247  putative sensor histidine kinase  29.69 
 
 		 466 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3132  putative sensor histidine kinase  29.69 
 
 		 466 aa  47.4  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2174  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.53 
 
 		 544 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00506259 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2070  sensor histidine kinase  29.69 
 
 		 466 aa  47  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1099  sensor histidine kinase  29.69 
 
 		 466 aa  47  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1378  sensor histidine kinase  29.69 
 
 		 466 aa  47  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.922617  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2363  sensor histidine kinase  29.69 
 
 		 466 aa  47  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3418  sensor histidine kinase  30.68 
 
 		 481 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.986219  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5188  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.83 
 
 		 480 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5671  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.83 
 
 		 480 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0241273 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45810  hypothetical protein  29.66 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.73 
 
 		 459 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.134921 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1267  methyl-accepting chemotaxis protein  26.09 
 
 		 557 aa  46.2  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2601  chemotaxis sensory transducer  28.42 
 
 		 569 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.441915  normal  0.36116 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0027  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.93 
 
 		 461 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.755533 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5641  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.77 
 
 		 519 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4945  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.93 
 
 		 459 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0549839 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1027  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  30.68 
 
 		 456 aa  45.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.573227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0895  sensor histidine kinase  30.68 
 
 		 451 aa  46.2  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.622783  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3759  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.4 
 
 		 554 aa  46.2  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0990388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4564  histidine kinase  28.83 
 
 		 460 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.562879  normal  0.0736505 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41030  Periplasmic sensory histidine protein kinase, two-component  27.27 
 
 		 458 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0649951  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02702  histidine kinase  29.55 
 
 		 456 aa  45.4  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1783  histidine kinase  28 
 
 		 501 aa  45.4  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211372 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5497  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.93 
 
 		 459 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170786 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1405  sensor histidine kinase  30.34 
 
 		 483 aa  44.7  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.56 
 
 		 471 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629472  normal  0.491206 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4528  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.17 
 
 		 461 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25442  normal  0.575982 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6172  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.74 
 
 		 542 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6398  histidine kinase  30.34 
 
 		 461 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.176497 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.87 
 
 		 478 aa  43.9  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.304751 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0112  chemotaxis sensory transducer  34.21 
 
 		 563 aa  43.9  0.0007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05646  histidine kinase  40 
 
 		 482 aa  43.9  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1918  putative cache sensor protein  35.9 
 
 		 632 aa  43.9  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.149363  normal  0.217415 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2947  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.27 
 
 		 749 aa  43.9  0.0009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.732257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4477  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.34 
 
 		 471 aa  43.9  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1294  Signal transduction histidine kinase-like  26.12 
 
 		 526 aa  43.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.212587  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003135  sensor histidine kinase  30.68 
 
 		 451 aa  43.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.291514  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3728  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.17 
 
 		 488 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2273  hypothetical protein  32 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104576  normal  0.662685 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0113  chemotaxis sensory transducer  30 
 
 		 563 aa  42.7  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.87 
 
 		 486 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2920  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.89 
 
 		 544 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>