247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1642 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1642  cache type 2 domain-containing protein  100 
 
 
146 aa  305  2.0000000000000002e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000155098  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1876  hypothetical protein  34.03 
 
 
152 aa  93.2  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0770276  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3161  cache domain-contain protein  35.37 
 
 
152 aa  90.5  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.535779  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3277  Cache type 2 domain protein  35.88 
 
 
152 aa  87  7e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0890612  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3066  cache type 2 domain-containing protein  35.9 
 
 
549 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0332  cache type 2 domain-containing protein  28.97 
 
 
153 aa  75.1  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0349612  normal  0.499668 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1528  cache type 2 domain-containing protein  30.65 
 
 
129 aa  74.3  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2816  putative cache sensor protein  33.58 
 
 
285 aa  72.8  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.07 
 
 
499 aa  69.3  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.729026  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1159  hypothetical protein  31.09 
 
 
148 aa  69.7  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2392  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.45 
 
 
787 aa  67.8  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.467356  normal  0.0918963 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0673  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  39.53 
 
 
533 aa  67  0.00000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.349323 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5034  cache type 2 domain-containing protein  28.57 
 
 
169 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.985276 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0772  cache, type 2 domain protein  27.46 
 
 
151 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.45 
 
 
787 aa  66.6  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000288595  normal  0.31948 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1093  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 
1721 aa  66.2  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2601  chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 
569 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.441915  normal  0.36116 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45810  hypothetical protein  31.97 
 
 
145 aa  65.1  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2728  chemotaxis sensory transducer  38.37 
 
 
544 aa  64.7  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00837045  normal  0.306222 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2947  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.3 
 
 
749 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.732257  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0304  putative cache sensor protein  28.36 
 
 
152 aa  63.9  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.333934 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2364  cache type 2 domain-containing protein  27.34 
 
 
160 aa  63.9  0.0000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2181  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.04 
 
 
606 aa  63.5  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.440189  normal  0.953277 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2659  methyl-accepting chemotaxis protein  37.21 
 
 
556 aa  63.5  0.0000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2464  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  33.04 
 
 
605 aa  62.8  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3699  methyl-accepting chemotaxis protein  31.62 
 
 
543 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2237  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.33 
 
 
513 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.61 
 
 
566 aa  62.8  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1423  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.37 
 
 
584 aa  63.5  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0077  histidine kinase  36.05 
 
 
661 aa  62.4  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0353  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  39.08 
 
 
564 aa  62  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.244374  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2316  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.91 
 
 
548 aa  62.4  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0208981 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4941  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.05 
 
 
563 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.396774  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2273  hypothetical protein  34.93 
 
 
148 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104576  normal  0.662685 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2643  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.23 
 
 
541 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0238907  normal  0.0164957 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2920  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 
544 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1366  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  36.05 
 
 
1088 aa  61.6  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000517956 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6000  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.36 
 
 
513 aa  62  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.292044 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2757  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.53 
 
 
544 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1452  putative cache sensor protein  26.12 
 
 
452 aa  61.2  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.21 
 
 
566 aa  60.8  0.000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00082247  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0400  methyl-accepting chemotaxis protein  39.78 
 
 
549 aa  60.8  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0701  hypothetical protein  29.01 
 
 
565 aa  60.8  0.000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.385527  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4964  methyl-accepting chemotaxis protein  33.63 
 
 
545 aa  60.5  0.000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0777  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.88 
 
 
712 aa  60.5  0.000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03718  putative chemotaxis sensory protein  37.21 
 
 
540 aa  60.5  0.000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1769  hypothetical protein  29.66 
 
 
148 aa  60.1  0.000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17793  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1776  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  36.05 
 
 
543 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.363817 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4001  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  28.03 
 
 
585 aa  59.3  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0946714  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3993  histidine kinase  33.33 
 
 
456 aa  59.7  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2847  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  34.88 
 
 
1089 aa  60.1  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000851175  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4280  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.88 
 
 
563 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1252  cache type 2 domain-containing protein  27.27 
 
 
302 aa  59.7  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.751516  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1387  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.72 
 
 
615 aa  59.3  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2989  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.72 
 
 
1093 aa  58.9  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.653084  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1708  Cache, type 2  27.46 
 
 
153 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0920811 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6950  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  37.93 
 
 
661 aa  58.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2220  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  28.08 
 
 
971 aa  58.5  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00060546  normal  0.0976665 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.48 
 
 
544 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1371  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  30.77 
 
 
544 aa  57.8  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.116754  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0638  putative cache sensor protein  30.84 
 
 
188 aa  57.8  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.05692  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2109  cache, type 2  25.22 
 
 
130 aa  57.8  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000614134  hitchhiker  0.00251106 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1840  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.63 
 
 
641 aa  57.4  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.870294  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2174  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.88 
 
 
544 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00506259 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2350  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.63 
 
 
515 aa  57  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0691  hypothetical protein  27.59 
 
 
564 aa  57  0.00000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.526813  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3394  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.05 
 
 
664 aa  57  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000171268  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2874  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.37 
 
 
563 aa  57  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.872696  normal  0.485865 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3522  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.07 
 
 
477 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1078  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.31 
 
 
587 aa  56.2  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00101669 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3823  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.44 
 
 
513 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.793143 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2065  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.23 
 
 
554 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.460232  normal  0.464376 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.4 
 
 
567 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3836  Cache, type 2  32.56 
 
 
661 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.337162  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3240  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.64 
 
 
668 aa  55.5  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000648214  normal  0.034513 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2861  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.62 
 
 
544 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.445183 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3418  sensor histidine kinase  30.48 
 
 
481 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.986219  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1985  methyl-accepting chemotaxis protein (MCP)  34.09 
 
 
715 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3718  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.4 
 
 
526 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.734846  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3775  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.4 
 
 
526 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.268134  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5641  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.99 
 
 
519 aa  54.7  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1613  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.57 
 
 
603 aa  55.1  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.183078  normal  0.160096 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3858  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  31.4 
 
 
526 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1888  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.46 
 
 
487 aa  53.9  0.0000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3575  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.05 
 
 
475 aa  53.9  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1646  diguanylate cyclase  34.88 
 
 
580 aa  53.9  0.0000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000165959  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0762  putative cache sensor protein  26.05 
 
 
478 aa  53.5  0.0000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.197038  normal  0.180889 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2563  putative cache sensor protein  26.23 
 
 
189 aa  53.5  0.0000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.800793 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4018  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.72 
 
 
713 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000208845  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1198  methyl-accepting chemotaxis protein  32.22 
 
 
482 aa  53.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.311579  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1044  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.48 
 
 
584 aa  52.8  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1130  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  31.4 
 
 
571 aa  52.4  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4188  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  36.78 
 
 
566 aa  52.4  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.210427  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1623  methyl-accepting chemotaxis protein  32.22 
 
 
517 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3582  Cache, type 2  25.81 
 
 
151 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.351306  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3217  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  32.18 
 
 
584 aa  52.4  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.480757 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1710  methyl-accepting chemotaxis protein  32.22 
 
 
517 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02605  putative methyl-accepting chemotaxis transducer transmembrane protein  39.73 
 
 
513 aa  51.6  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0414906  normal  0.0642458 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0789  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.68 
 
 
469 aa  52  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3011  hypothetical protein  34 
 
 
148 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.438725  normal  0.345508 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>