216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5034 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5034  cache type 2 domain-containing protein  100 
 
 
169 aa  338  2e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.985276 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3066  cache type 2 domain-containing protein  40 
 
 
549 aa  93.6  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3161  cache domain-contain protein  33.11 
 
 
152 aa  75.5  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.535779  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3277  Cache type 2 domain protein  34.29 
 
 
152 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0890612  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3718  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.88 
 
 
526 aa  71.6  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.734846  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3775  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.17 
 
 
526 aa  70.9  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.268134  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3858  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  35.17 
 
 
526 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6950  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  36.07 
 
 
661 aa  69.3  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0353  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  31.69 
 
 
564 aa  66.2  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.244374  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.2 
 
 
567 aa  66.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3217  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  35.9 
 
 
584 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.480757 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1642  cache type 2 domain-containing protein  28.57 
 
 
146 aa  66.2  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000155098  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1400  Cache type 2 domain protein  34.68 
 
 
308 aa  65.9  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.457949  hitchhiker  0.000596162 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1253  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.91 
 
 
567 aa  65.5  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.010155 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2464  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  36.27 
 
 
605 aa  65.5  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2947  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.86 
 
 
749 aa  65.9  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.732257  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0332  cache type 2 domain-containing protein  26.95 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0349612  normal  0.499668 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2181  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.27 
 
 
606 aa  64.3  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.440189  normal  0.953277 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0673  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  39.58 
 
 
533 aa  64.3  0.0000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.349323 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4280  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.5 
 
 
563 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4018  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.42 
 
 
713 aa  62.8  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000208845  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2643  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.04 
 
 
541 aa  62.8  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0238907  normal  0.0164957 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4941  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.38 
 
 
563 aa  62  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.396774  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1044  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.85 
 
 
584 aa  62  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0105  Cache type 2 domain protein  35.2 
 
 
315 aa  61.6  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3836  Cache, type 2  38 
 
 
661 aa  61.2  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.337162  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1387  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.18 
 
 
615 aa  60.5  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1613  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.51 
 
 
603 aa  60.5  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.183078  normal  0.160096 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1876  hypothetical protein  32.8 
 
 
152 aa  59.7  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0770276  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3699  methyl-accepting chemotaxis protein  31.36 
 
 
543 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2989  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.83 
 
 
1093 aa  59.7  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.653084  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2874  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.54 
 
 
563 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.872696  normal  0.485865 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0158  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.45 
 
 
561 aa  58.5  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1261  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
654 aa  58.2  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2220  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  37.5 
 
 
971 aa  58.5  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00060546  normal  0.0976665 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0772  cache, type 2 domain protein  31.13 
 
 
151 aa  57.8  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.86 
 
 
585 aa  57.8  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.38945  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03718  putative chemotaxis sensory protein  34.74 
 
 
540 aa  57.8  0.00000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1093  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.08 
 
 
1721 aa  57.8  0.00000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3709  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  29.59 
 
 
546 aa  57.8  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0762  putative cache sensor protein  30.83 
 
 
478 aa  57.4  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.197038  normal  0.180889 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1776  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  34.44 
 
 
543 aa  57  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.363817 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2601  chemotaxis sensory transducer  34.44 
 
 
569 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.441915  normal  0.36116 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3600  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.9 
 
 
546 aa  57  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4188  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  34.26 
 
 
566 aa  57  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.210427  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1252  cache type 2 domain-containing protein  29.86 
 
 
302 aa  56.6  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.751516  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2174  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.29 
 
 
544 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00506259 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1078  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.4 
 
 
587 aa  56.2  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00101669 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1160  chemotaxis sensory transducer  34.86 
 
 
559 aa  56.2  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2316  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.74 
 
 
548 aa  56.2  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0208981 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2728  chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 
544 aa  55.8  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00837045  normal  0.306222 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.73 
 
 
678 aa  55.8  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.195593 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2847  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  30.83 
 
 
1089 aa  55.1  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000851175  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2392  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.11 
 
 
787 aa  55.1  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.467356  normal  0.0918963 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.11 
 
 
787 aa  55.1  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000288595  normal  0.31948 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3394  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.25 
 
 
664 aa  55.1  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000171268  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0077  histidine kinase  36.67 
 
 
661 aa  54.7  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6172  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.03 
 
 
542 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.96 
 
 
459 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.134921 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0400  methyl-accepting chemotaxis protein  29.7 
 
 
549 aa  53.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3901  cache type 2 domain-containing protein  32.29 
 
 
343 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3308  diguanylate cyclase  31.25 
 
 
603 aa  53.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000660005  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3240  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 
668 aa  53.1  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000648214  normal  0.034513 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2880  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 
558 aa  52.8  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2659  methyl-accepting chemotaxis protein  31.25 
 
 
556 aa  52.4  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4464  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.38 
 
 
573 aa  52.4  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.610641  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2628  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.25 
 
 
515 aa  52.4  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0020256  hitchhiker  0.000579335 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5641  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.82 
 
 
519 aa  52.8  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4001  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  34.18 
 
 
585 aa  51.6  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0946714  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0304  putative cache sensor protein  30.4 
 
 
152 aa  51.6  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.333934 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3112  chemotaxis sensory transducer  31.11 
 
 
541 aa  51.2  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1366  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  28.57 
 
 
1088 aa  51.2  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000517956 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2109  cache, type 2  28.72 
 
 
130 aa  51.6  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000614134  hitchhiker  0.00251106 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3993  histidine kinase  33.63 
 
 
456 aa  51.2  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2920  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.7 
 
 
544 aa  51.2  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0701  hypothetical protein  30.07 
 
 
565 aa  50.8  0.000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.385527  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6000  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.84 
 
 
513 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.292044 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2366  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32 
 
 
560 aa  50.4  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.196109  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 
579 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0132835 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.06 
 
 
554 aa  50.4  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3759  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.21 
 
 
554 aa  49.3  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0990388  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3261  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.97 
 
 
613 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2237  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.84 
 
 
513 aa  49.7  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.31 
 
 
566 aa  49.3  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1452  putative cache sensor protein  28.57 
 
 
452 aa  49.7  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3052  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.29 
 
 
554 aa  49.3  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2334  sensor histidine kinase  34.78 
 
 
470 aa  48.9  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1715  hypothetical protein  29.51 
 
 
151 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0227611  normal  0.523463 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2738  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.03 
 
 
562 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.809654  normal  0.020868 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3299  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.29 
 
 
554 aa  48.9  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0704  hypothetical protein  26.32 
 
 
553 aa  48.9  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1708  Cache, type 2  27.96 
 
 
153 aa  48.5  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0920811 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3582  Cache, type 2  27.96 
 
 
151 aa  48.5  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.351306  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 
478 aa  48.5  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.304751 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0824  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.29 
 
 
554 aa  48.1  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00067966 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3199  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.29 
 
 
554 aa  48.1  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.927661 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.31 
 
 
566 aa  48.1  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00082247  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0837  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.29 
 
 
554 aa  48.5  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3227  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.4 
 
 
518 aa  48.1  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.543154  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5497  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 
459 aa  47.8  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170786 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>