67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0105 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0105  Cache type 2 domain protein  100 
 
 		 315 aa  657    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1400  Cache type 2 domain protein  58.1 
 
 		 308 aa  375  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.457949  hitchhiker  0.000596162 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3066  cache type 2 domain-containing protein  29.96 
 
 		 549 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5034  cache type 2 domain-containing protein  35.2 
 
 		 169 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.985276 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3200  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.68 
 
 		 554 aa  55.1  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.23 
 
 		 554 aa  53.9  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0630  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.23 
 
 		 554 aa  53.9  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.83 
 
 		 554 aa  53.5  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0837  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.44 
 
 		 554 aa  53.5  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0987  methyl-accepting chemotaxis protein  33.71 
 
 		 554 aa  53.5  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3299  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.62 
 
 		 554 aa  53.1  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3601  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  36.23 
 
 		 554 aa  53.1  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3666  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.23 
 
 		 554 aa  53.1  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0870  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.71 
 
 		 554 aa  53.1  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0571565  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3789  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.23 
 
 		 554 aa  52.8  0.000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0641  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.23 
 
 		 568 aa  52.8  0.000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3491  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.78 
 
 		 554 aa  52.8  0.000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3617  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.21 
 
 		 554 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.964358 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.36 
 
 		 585 aa  52.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.38945  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3199  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.21 
 
 		 554 aa  52  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.927661 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0824  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.21 
 
 		 554 aa  52  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00067966 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3494  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.62 
 
 		 554 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3422  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  35.21 
 
 		 554 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001822  methyl-accepting chemotaxis protein  37.68 
 
 		 557 aa  50.8  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000124429  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3405  histidine kinase  38.57 
 
 		 488 aa  50.8  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.352666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3728  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.57 
 
 		 488 aa  50.4  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0581  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35 
 
 		 554 aa  50.4  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2643  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.57 
 
 		 541 aa  50.1  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0238907  normal  0.0164957 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2617  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.12 
 
 		 548 aa  48.9  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.224982  normal  0.210295 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0877  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.98 
 
 		 540 aa  48.5  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.11332 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3993  histidine kinase  37.08 
 
 		 456 aa  48.9  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3052  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.34 
 
 		 554 aa  48.1  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1646  diguanylate cyclase  26.92 
 
 		 580 aa  47.4  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000165959  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0772  cache, type 2 domain protein  29.91 
 
 		 151 aa  46.6  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3823  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.96 
 
 		 513 aa  46.6  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.793143 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3308  diguanylate cyclase  31.43 
 
 		 603 aa  46.6  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000660005  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.8 
 
 		 478 aa  46.6  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.304751 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1253  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.11 
 
 		 567 aa  46.6  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.010155 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41030  Periplasmic sensory histidine protein kinase, two-component  29.76 
 
 		 458 aa  46.2  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0649951  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.23 
 
 		 564 aa  46.2  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2596  methyl-accepting chemotaxis protein  34.78 
 
 		 564 aa  46.2  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000057467  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0021  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  38.57 
 
 		 487 aa  46.2  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.130425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.71 
 
 		 567 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4188  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  38.36 
 
 		 566 aa  45.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.210427  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3240  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.49 
 
 		 668 aa  45.8  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000648214  normal  0.034513 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3759  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.21 
 
 		 554 aa  45.1  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0990388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3532  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.89 
 
 		 555 aa  44.3  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5641  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.47 
 
 		 519 aa  44.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1918  putative cache sensor protein  30.11 
 
 		 632 aa  45.1  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.149363  normal  0.217415 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1452  putative cache sensor protein  25.12 
 
 		 452 aa  44.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1044  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.99 
 
 		 584 aa  43.9  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003135  sensor histidine kinase  34.44 
 
 		 451 aa  44.3  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.291514  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02702  histidine kinase  33.67 
 
 		 456 aa  44.3  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6950  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  38.89 
 
 		 661 aa  43.9  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4018  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.29 
 
 		 713 aa  44.3  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000208845  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0389  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.94 
 
 		 587 aa  43.9  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.074674  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2880  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.34 
 
 		 558 aa  43.9  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2738  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.47 
 
 		 562 aa  43.5  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.809654  normal  0.020868 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1160  chemotaxis sensory transducer  37.5 
 
 		 559 aa  43.5  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4964  methyl-accepting chemotaxis protein  26.92 
 
 		 545 aa  43.1  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0895  sensor histidine kinase  33.67 
 
 		 451 aa  43.1  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.622783  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3547  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.51 
 
 		 676 aa  43.1  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.126617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1985  methyl-accepting chemotaxis protein (MCP)  33.33 
 
 		 715 aa  43.1  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1294  Signal transduction histidine kinase-like  25.76 
 
 		 526 aa  42.7  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.212587  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0777  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.68 
 
 		 712 aa  42.7  0.007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0762  putative cache sensor protein  26.21 
 
 		 478 aa  42.7  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.197038  normal  0.180889 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3418  sensor histidine kinase  27.43 
 
 		 481 aa  42.7  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.986219  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>