208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0332 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0332  cache type 2 domain-containing protein  100 
 
 		 153 aa  313  6e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0349612  normal  0.499668 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0772  cache, type 2 domain protein  40.52 
 
 		 151 aa  125  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1093  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.18 
 
 		 1721 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0304  putative cache sensor protein  43.07 
 
 		 152 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.333934 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1252  cache type 2 domain-containing protein  42.15 
 
 		 302 aa  108  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.751516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3161  cache domain-contain protein  34.87 
 
 		 152 aa  107  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.535779  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1159  hypothetical protein  42.74 
 
 		 148 aa  107  7.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2563  putative cache sensor protein  41.94 
 
 		 189 aa  105  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.800793 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1876  hypothetical protein  42.62 
 
 		 152 aa  104  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0770276  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2109  cache, type 2  42.15 
 
 		 130 aa  104  4e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000614134  hitchhiker  0.00251106 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1528  cache type 2 domain-containing protein  42.24 
 
 		 129 aa  103  7e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3277  Cache type 2 domain protein  35.82 
 
 		 152 aa  100  5e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0890612  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1708  Cache, type 2  36.18 
 
 		 153 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0920811 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1908  cache type 2 domain-containing protein  45.37 
 
 		 183 aa  99.8  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2364  cache type 2 domain-containing protein  38.71 
 
 		 160 aa  97.4  6e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1452  putative cache sensor protein  39.64 
 
 		 452 aa  92.8  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.56 
 
 		 499 aa  91.3  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.729026  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0638  putative cache sensor protein  37.7 
 
 		 188 aa  90.1  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.05692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4272  Cache type 2 domain protein  38.02 
 
 		 151 aa  89.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.819687  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1715  hypothetical protein  37.19 
 
 		 151 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0227611  normal  0.523463 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2242  hypothetical protein  35.19 
 
 		 305 aa  87.4  7e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.184581  hitchhiker  0.000000000000117809 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3582  Cache, type 2  36.36 
 
 		 151 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.351306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2473  cache type 2 domain-containing protein  37.5 
 
 		 551 aa  84.3  6e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1445  putative cache sensor protein  37.4 
 
 		 192 aa  82.4  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2816  putative cache sensor protein  32.39 
 
 		 285 aa  81.6  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0701  hypothetical protein  37.38 
 
 		 565 aa  79.3  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.385527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1918  putative cache sensor protein  37.27 
 
 		 632 aa  78.2  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.149363  normal  0.217415 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3066  cache type 2 domain-containing protein  32.03 
 
 		 549 aa  77  0.00000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0349  Signal transduction histidine kinase-like  35.14 
 
 		 181 aa  76.6  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.510339 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1642  hypothetical protein  35.71 
 
 		 521 aa  76.6  0.0000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0762  putative cache sensor protein  41.94 
 
 		 478 aa  76.3  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.197038  normal  0.180889 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1642  cache type 2 domain-containing protein  28.97 
 
 		 146 aa  75.1  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000155098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2065  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.08 
 
 		 554 aa  74.3  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.460232  normal  0.464376 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0704  hypothetical protein  38.84 
 
 		 553 aa  73.2  0.000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1888  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.31 
 
 		 487 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0690  hypothetical protein  35.54 
 
 		 598 aa  70.1  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.321962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4480  hypothetical protein  37.19 
 
 		 282 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109317 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0702  hypothetical protein  37.38 
 
 		 564 aa  68.6  0.00000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0691  hypothetical protein  36.45 
 
 		 564 aa  68.2  0.00000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.526813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2286  cache type 2 domain-containing protein  32.21 
 
 		 320 aa  67.8  0.00000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5034  cache type 2 domain-containing protein  26.95 
 
 		 169 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.985276 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1294  Signal transduction histidine kinase-like  31.43 
 
 		 526 aa  64.7  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.212587  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3618  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.53 
 
 		 512 aa  63.2  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0151839  normal  0.0370629 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3858  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  28.78 
 
 		 526 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2350  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.69 
 
 		 515 aa  60.8  0.000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3775  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.06 
 
 		 526 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.268134  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3718  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.34 
 
 		 526 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.734846  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2486  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.89 
 
 		 504 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.961139  normal  0.110025 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2342  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.24 
 
 		 508 aa  58.9  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.10605  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0162  hypothetical protein  37.31 
 
 		 98 aa  58.2  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.976262 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2947  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.58 
 
 		 749 aa  57.8  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.732257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0673  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  27.35 
 
 		 533 aa  57  0.00000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.349323 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0777  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.11 
 
 		 712 aa  56.6  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4941  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.91 
 
 		 563 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.396774  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2601  chemotaxis sensory transducer  41.67 
 
 		 569 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.441915  normal  0.36116 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0449  ATP-binding region ATPase domain protein  32.63 
 
 		 532 aa  55.8  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000148075  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2765  amino acid ABC transporter periplasmic protein  35.56 
 
 		 401 aa  55.8  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0021  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  27.1 
 
 		 487 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.130425  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45810  hypothetical protein  30.07 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.26 
 
 		 459 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.134921 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1253  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.71 
 
 		 567 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.010155 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4945  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.26 
 
 		 459 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0549839 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5497  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.26 
 
 		 459 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170786 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3600  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.08 
 
 		 546 aa  53.9  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0789  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.62 
 
 		 469 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3993  histidine kinase  35.21 
 
 		 456 aa  53.9  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2141  chemotaxis sensory transducer  33.72 
 
 		 708 aa  53.5  0.0000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4477  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.21 
 
 		 471 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1646  diguanylate cyclase  32.88 
 
 		 580 aa  53.5  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000165959  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2237  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.19 
 
 		 513 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2891  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.3 
 
 		 521 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.657214  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1027  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  36.62 
 
 		 456 aa  53.5  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.573227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1613  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.17 
 
 		 603 aa  53.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.183078  normal  0.160096 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3699  methyl-accepting chemotaxis protein  30.77 
 
 		 543 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2751  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.3 
 
 		 521 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1387  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.49 
 
 		 615 aa  52  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0895  sensor histidine kinase  34.29 
 
 		 451 aa  52  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.622783  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3836  Cache, type 2  32.56 
 
 		 661 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.337162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2643  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 541 aa  52  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0238907  normal  0.0164957 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.7 
 
 		 471 aa  52  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629472  normal  0.491206 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2273  hypothetical protein  32.26 
 
 		 148 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104576  normal  0.662685 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6950  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  35.21 
 
 		 661 aa  51.2  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.03 
 
 		 567 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3728  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.11 
 
 		 488 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2783  methyl-accepting chemotaxisprotein  31.03 
 
 		 690 aa  51.2  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.468562 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3112  chemotaxis sensory transducer  40.28 
 
 		 541 aa  51.2  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2874  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.02 
 
 		 563 aa  51.2  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.872696  normal  0.485865 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1044  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.11 
 
 		 584 aa  50.8  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 486 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5188  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.16 
 
 		 480 aa  51.2  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.56 
 
 		 585 aa  50.8  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.38945  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5671  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.16 
 
 		 480 aa  51.2  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0241273 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4564  histidine kinase  35.16 
 
 		 460 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.562879  normal  0.0736505 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3217  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  31.11 
 
 		 584 aa  50.4  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.480757 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2728  chemotaxis sensory transducer  28 
 
 		 544 aa  50.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00837045  normal  0.306222 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0027  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.16 
 
 		 461 aa  50.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.755533 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2174  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.77 
 
 		 544 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00506259 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3261  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.58 
 
 		 613 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4280  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.78 
 
 		 563 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6000  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.4 
 
 		 513 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.292044 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>