109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0619 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0619  hypothetical protein  100 
 
 
248 aa  518  1e-146  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.566502  normal  0.917839 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0328  hypothetical protein  48.89 
 
 
251 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.397197 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67850  putative ABC-type amino acid transport protein, periplasmic component  45.7 
 
 
250 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.349677 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5873  hypothetical protein  44.8 
 
 
250 aa  202  5e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4250  amino acid ABC transporter periplasmic protein  43.87 
 
 
251 aa  199  3e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190529 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5333  hypothetical protein  44.09 
 
 
269 aa  193  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4891  hypothetical protein  44.09 
 
 
251 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4249  extracellular solute-binding protein  42.28 
 
 
251 aa  187  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00199527 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4251  amino acid ABC transporter periplasmic protein  40 
 
 
244 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000526957 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67840  putative ABC-type amino acid transporter  42.06 
 
 
251 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.288914 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5872  hypothetical protein  42.06 
 
 
251 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67860  putative ABC-type amino acid transporter  40.62 
 
 
248 aa  174  9e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.339144 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5874  hypothetical protein  40.62 
 
 
248 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3893  amino acid ABC transporter periplasmic protein  35.75 
 
 
252 aa  166  2.9999999999999998e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2915  amino acid ABC transporter periplasmic protein  35.27 
 
 
247 aa  162  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1477  extracellular solute-binding protein family 3  38.36 
 
 
254 aa  160  1e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1009  hypothetical protein  33.89 
 
 
242 aa  158  7e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.815562  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0967  extracellular solute-binding protein  26.69 
 
 
255 aa  122  6e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0258  extracellular solute-binding protein  32.93 
 
 
236 aa  120  3e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1005  hypothetical protein  26.69 
 
 
255 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.69065  normal  0.921286 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0424  hypothetical protein  34.62 
 
 
256 aa  116  3e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3523  extracellular solute-binding protein, family 3  27.42 
 
 
257 aa  116  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3398  extracellular solute-binding protein  27.42 
 
 
257 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3302  extracellular solute-binding protein  27.02 
 
 
257 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1054  extracellular solute-binding protein family 3  26.61 
 
 
257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0164866  hitchhiker  0.000017747 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1143  hypothetical protein  26.09 
 
 
255 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1919  amino acid ABC transporter periplasmic protein  29.78 
 
 
247 aa  108  6e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0371115  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0969  extracellular solute-binding protein  26.61 
 
 
255 aa  105  5e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3188  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  29.39 
 
 
228 aa  103  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484393  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0629  extracellular solute-binding protein  30.13 
 
 
257 aa  103  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1918  putative cache sensor protein  31.86 
 
 
632 aa  102  5e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.149363  normal  0.217415 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2937  hypothetical protein  26.43 
 
 
257 aa  102  7e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3860  hypothetical protein  26.42 
 
 
265 aa  94.7  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3830  extracellular solute-binding protein  27.5 
 
 
248 aa  94  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000366277 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0733  amino acid ABC transporter periplasmic protein  30 
 
 
255 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.263143  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1916  extracellular solute-binding protein family 3  26.67 
 
 
483 aa  90.9  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0921  extracellular solute-binding protein  23.83 
 
 
260 aa  87.4  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2767  extracellular solute-binding protein family 3  25.69 
 
 
238 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0772  extracellular solute-binding protein  24.67 
 
 
238 aa  87  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.025527 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0746  extracellular solute-binding protein  23.72 
 
 
275 aa  85.9  5e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0305191 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0687  extracellular solute-binding protein  26.56 
 
 
255 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3031  extracellular solute-binding protein family 3  25.69 
 
 
237 aa  85.5  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.516858  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3192  extracellular solute-binding protein  24.59 
 
 
265 aa  85.1  9e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0961443  hitchhiker  0.0000817621 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1595  extracellular solute-binding protein  26.15 
 
 
262 aa  84.3  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.614347  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1208  hypothetical protein  29.01 
 
 
258 aa  82.8  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000699317  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0350  extracellular solute-binding protein family 3  28.33 
 
 
321 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0133156 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3570  extracellular solute-binding protein family 3  26.11 
 
 
252 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3523  extracellular solute-binding protein  23.14 
 
 
268 aa  77  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3761  extracellular solute-binding protein  26.11 
 
 
265 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3638  extracellular solute-binding protein  25.66 
 
 
265 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.055561  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2990  extracellular solute-binding protein  22.49 
 
 
263 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.604366  normal  0.133749 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0702  extracellular solute-binding protein  23.83 
 
 
244 aa  69.7  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0691872 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2765  amino acid ABC transporter periplasmic protein  28.46 
 
 
401 aa  68.9  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2978  extracellular solute-binding protein  24 
 
 
248 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2624  hypothetical protein  23.11 
 
 
271 aa  67  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.547677 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1845  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
262 aa  65.9  0.0000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00294253  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1423  putative polar amino acid transport system substrate-binding proetin  25 
 
 
254 aa  65.1  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0156729  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0051  extracellular solute-binding protein family 3  25.11 
 
 
264 aa  64.7  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1151  hypothetical protein  25.33 
 
 
264 aa  63.5  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000453875  normal  0.246745 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1085  hypothetical protein  25.33 
 
 
264 aa  63.2  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0391886  normal  0.830979 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1683  hypothetical protein  21.91 
 
 
251 aa  63.2  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1101  extracellular solute-binding protein family 3  21.78 
 
 
295 aa  63.2  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0196876 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3168  hypothetical protein  26.1 
 
 
264 aa  62.8  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000679304  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1202  extracellular solute-binding protein family 3  26.1 
 
 
264 aa  62.4  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000133475  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3305  extracellular solute-binding protein  24.26 
 
 
244 aa  62  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3169  hypothetical protein  26.1 
 
 
264 aa  62  0.000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000178583  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3312  hypothetical protein  26.1 
 
 
264 aa  62  0.000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000132852  normal  0.0735869 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1071  extracellular solute-binding protein  24.15 
 
 
258 aa  60.8  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1085  hypothetical protein  26.2 
 
 
264 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.113674  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0459  amino acid ABC transporter periplasmic protein  23.32 
 
 
255 aa  59.7  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0486  extracellular solute-binding protein  24.87 
 
 
262 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0881  extracellular solute-binding protein  23.17 
 
 
269 aa  57.4  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1461  extracellular solute-binding protein  22.67 
 
 
251 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.617285  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2027  amino acid ABC transporter periplasmic protein  22.8 
 
 
275 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.360228 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0421  extracellular solute-binding protein  23.08 
 
 
252 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1844  extracellular solute-binding protein  24.68 
 
 
260 aa  53.9  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000362453  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5282  extracellular solute-binding protein  21.67 
 
 
270 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2474  solute-binding family 1 protein  26.34 
 
 
265 aa  53.1  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.734477  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3481  hypothetical protein  25.54 
 
 
264 aa  52.8  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0585  amino acid ABC transporter periplasmic protein  20.77 
 
 
274 aa  52.4  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0123  hypothetical protein  21.69 
 
 
263 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.289179 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3985  hypothetical protein  24.68 
 
 
262 aa  50.4  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.817581 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4979  periplasmic binding protein, putative  22.87 
 
 
262 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4852  extracellular solute-binding protein  22.87 
 
 
262 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157097  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0241  extracellular solute-binding protein  20.75 
 
 
275 aa  48.9  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0477  extracellular solute-binding protein  21.4 
 
 
246 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1585  hypothetical protein  28.89 
 
 
248 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05910  putative periplasmic transport system  25.2 
 
 
243 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.760752 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3070  extracellular solute-binding protein  21.05 
 
 
286 aa  46.2  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2551  extracellular solute-binding protein  21.3 
 
 
272 aa  46.6  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.36291  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3734  extracellular solute-binding protein  23.11 
 
 
247 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3976  hypothetical protein  22.05 
 
 
260 aa  45.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.834147  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0311  extracellular solute-binding protein  21.18 
 
 
248 aa  43.9  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127977  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3840  putative lipoprotein  23.92 
 
 
255 aa  43.9  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0421756  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0232  extracellular solute-binding protein  22.62 
 
 
248 aa  43.1  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1019  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  24.26 
 
 
243 aa  43.1  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.211484 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1080  extracellular solute-binding protein  23.45 
 
 
241 aa  42.7  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.950195  normal  0.541205 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2309  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.37 
 
 
1055 aa  42.7  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0499  extracellular solute-binding protein  26.74 
 
 
457 aa  42.7  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0556  amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  23.18 
 
 
253 aa  42.7  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>