116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0328 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0328  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  509  1e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397197 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4250  amino acid ABC transporter periplasmic protein  70.12 
 
 		 251 aa  377  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190529 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67850  putative ABC-type amino acid transport protein, periplasmic component  71.49 
 
 		 250 aa  354  6.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.349677 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5873  hypothetical protein  72.29 
 
 		 250 aa  352  4e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5333  hypothetical protein  64.4 
 
 		 269 aa  347  1e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4891  hypothetical protein  66 
 
 		 251 aa  341  5.999999999999999e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67840  putative ABC-type amino acid transporter  57.77 
 
 		 251 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.288914 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5872  hypothetical protein  57.77 
 
 		 251 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4249  extracellular solute-binding protein  56.97 
 
 		 251 aa  300  1e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199527 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67860  putative ABC-type amino acid transporter  53.85 
 
 		 248 aa  259  2e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.339144 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5874  hypothetical protein  53.39 
 
 		 248 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4251  amino acid ABC transporter periplasmic protein  51.13 
 
 		 244 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000526957 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0619  hypothetical protein  48.89 
 
 		 248 aa  212  4.9999999999999996e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.566502  normal  0.917839 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1009  hypothetical protein  36.94 
 
 		 242 aa  156  4e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.815562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3893  amino acid ABC transporter periplasmic protein  35.14 
 
 		 252 aa  155  7e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2915  amino acid ABC transporter periplasmic protein  35.89 
 
 		 247 aa  152  7e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1477  extracellular solute-binding protein family 3  32.59 
 
 		 254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0350  extracellular solute-binding protein family 3  32.39 
 
 		 321 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0133156 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0424  hypothetical protein  31.82 
 
 		 256 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0258  extracellular solute-binding protein  32 
 
 		 236 aa  109  5e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3830  extracellular solute-binding protein  30.17 
 
 		 248 aa  107  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000366277 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3188  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  29.44 
 
 		 228 aa  102  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484393  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1918  putative cache sensor protein  29.21 
 
 		 632 aa  99.4  5e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.149363  normal  0.217415 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0746  extracellular solute-binding protein  27.8 
 
 		 275 aa  99  6e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0305191 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0629  extracellular solute-binding protein  31.25 
 
 		 257 aa  98.2  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0733  amino acid ABC transporter periplasmic protein  29.82 
 
 		 255 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.263143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1916  extracellular solute-binding protein family 3  28.15 
 
 		 483 aa  95.1  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3860  hypothetical protein  29.44 
 
 		 265 aa  94  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3031  extracellular solute-binding protein family 3  28.33 
 
 		 237 aa  94  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.516858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1919  amino acid ABC transporter periplasmic protein  28.57 
 
 		 247 aa  94.4  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0371115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2767  extracellular solute-binding protein family 3  27.93 
 
 		 238 aa  93.6  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1595  extracellular solute-binding protein  28.17 
 
 		 262 aa  91.3  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.614347  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3192  extracellular solute-binding protein  27.57 
 
 		 265 aa  89.7  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0961443  hitchhiker  0.0000817621 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0967  extracellular solute-binding protein  26.11 
 
 		 255 aa  87.4  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0772  extracellular solute-binding protein  27.1 
 
 		 238 aa  86.7  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.025527 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1005  hypothetical protein  24.78 
 
 		 255 aa  86.7  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.69065  normal  0.921286 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3523  extracellular solute-binding protein  25.86 
 
 		 268 aa  85.9  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0921  extracellular solute-binding protein  25.48 
 
 		 260 aa  85.5  7e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1683  hypothetical protein  26.29 
 
 		 251 aa  85.5  7e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3761  extracellular solute-binding protein  29.55 
 
 		 265 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0969  extracellular solute-binding protein  24.34 
 
 		 255 aa  84  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3570  extracellular solute-binding protein family 3  28.64 
 
 		 252 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1208  hypothetical protein  29.82 
 
 		 258 aa  81.6  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000699317  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3638  extracellular solute-binding protein  28.51 
 
 		 265 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.055561  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1054  extracellular solute-binding protein family 3  24.34 
 
 		 257 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0164866  hitchhiker  0.000017747 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3302  extracellular solute-binding protein  24.34 
 
 		 257 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3523  extracellular solute-binding protein, family 3  24.34 
 
 		 257 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1143  hypothetical protein  23.89 
 
 		 255 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2765  amino acid ABC transporter periplasmic protein  27.55 
 
 		 401 aa  79.7  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2937  hypothetical protein  23.89 
 
 		 257 aa  79  0.00000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3879  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.78 
 
 		 235 aa  77.8  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3398  extracellular solute-binding protein  23.89 
 
 		 257 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2624  hypothetical protein  27.23 
 
 		 271 aa  77  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.547677 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0702  extracellular solute-binding protein  27.48 
 
 		 244 aa  75.5  0.0000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0691872 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2990  extracellular solute-binding protein  28.94 
 
 		 263 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.604366  normal  0.133749 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0687  extracellular solute-binding protein  25.55 
 
 		 255 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0051  extracellular solute-binding protein family 3  26.25 
 
 		 264 aa  72  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3305  extracellular solute-binding protein  24.41 
 
 		 244 aa  68.6  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2027  amino acid ABC transporter periplasmic protein  26.67 
 
 		 275 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.360228 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1585  hypothetical protein  27.71 
 
 		 248 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0585  amino acid ABC transporter periplasmic protein  24.03 
 
 		 274 aa  67  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2978  extracellular solute-binding protein  25.69 
 
 		 248 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1202  extracellular solute-binding protein family 3  24.7 
 
 		 264 aa  63.2  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000133475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1844  extracellular solute-binding protein  24.79 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000362453  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3985  hypothetical protein  24.56 
 
 		 262 aa  62.8  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.817581 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3169  hypothetical protein  24.7 
 
 		 264 aa  62.4  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000178583  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1080  extracellular solute-binding protein  29.38 
 
 		 241 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.950195  normal  0.541205 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3168  hypothetical protein  25.44 
 
 		 264 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000679304  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3312  hypothetical protein  25.44 
 
 		 264 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000132852  normal  0.0735869 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1845  extracellular solute-binding protein  24.37 
 
 		 262 aa  60.8  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00294253  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1151  hypothetical protein  25.64 
 
 		 264 aa  60.1  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000453875  normal  0.246745 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1085  hypothetical protein  25.88 
 
 		 264 aa  58.5  0.00000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.113674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1101  extracellular solute-binding protein family 3  20.08 
 
 		 295 aa  58.5  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0196876 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1085  hypothetical protein  25.21 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0391886  normal  0.830979 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1461  extracellular solute-binding protein  22.86 
 
 		 251 aa  57  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.617285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3070  extracellular solute-binding protein  23.48 
 
 		 286 aa  54.7  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0486  extracellular solute-binding protein  26.01 
 
 		 262 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3481  hypothetical protein  22.71 
 
 		 264 aa  54.3  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0459  amino acid ABC transporter periplasmic protein  24.64 
 
 		 255 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3469  extracellular solute-binding protein family 3  23.85 
 
 		 268 aa  54.3  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2551  extracellular solute-binding protein  22.27 
 
 		 272 aa  54.3  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.36291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5282  extracellular solute-binding protein  25.11 
 
 		 270 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0881  extracellular solute-binding protein  21.15 
 
 		 269 aa  52.4  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3313  extracellular solute-binding protein family 3  24.9 
 
 		 268 aa  52  0.000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0513  extracellular solute-binding protein  26.56 
 
 		 251 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0123  hypothetical protein  25.16 
 
 		 263 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.289179 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0421  extracellular solute-binding protein  25.4 
 
 		 252 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0387  extracellular solute-binding protein family 3  21.12 
 
 		 259 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0965219 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0556  amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  26.02 
 
 		 253 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0247  extracellular solute-binding protein  23.42 
 
 		 258 aa  48.9  0.00008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000342463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2275  cellulose-binding family II protein  24.66 
 
 		 405 aa  48.5  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.423052 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1071  extracellular solute-binding protein  21.12 
 
 		 258 aa  48.5  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1688  metal dependent phosphohydrolase  25.57 
 
 		 648 aa  48.1  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2954  hypothetical protein  25.99 
 
 		 244 aa  47.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0477  extracellular solute-binding protein  24.88 
 
 		 246 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4360  hypothetical protein  25.1 
 
 		 264 aa  47.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.519402  hitchhiker  0.0094359 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1692  extracellular solute-binding protein family 3  21.29 
 
 		 258 aa  47  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.350495 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05910  putative periplasmic transport system  26.85 
 
 		 243 aa  47  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.760752 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0726  histidine kinase  23.98 
 
 		 570 aa  46.6  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.408803  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2474  solute-binding family 1 protein  23.04 
 
 		 265 aa  46.2  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.734477  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>