137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3398 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_3398  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
257 aa  531  1e-150  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3523  extracellular solute-binding protein, family 3  97.67 
 
 
257 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3302  extracellular solute-binding protein  95.72 
 
 
257 aa  508  1e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1054  extracellular solute-binding protein family 3  94.55 
 
 
257 aa  502  1e-141  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0164866  hitchhiker  0.000017747 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2937  hypothetical protein  84.25 
 
 
257 aa  448  1e-125  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1143  hypothetical protein  75.39 
 
 
255 aa  403  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0969  extracellular solute-binding protein  79.17 
 
 
255 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1005  hypothetical protein  72.44 
 
 
255 aa  395  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.69065  normal  0.921286 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0967  extracellular solute-binding protein  69.69 
 
 
255 aa  384  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2990  extracellular solute-binding protein  38.46 
 
 
263 aa  191  7e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.604366  normal  0.133749 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0746  extracellular solute-binding protein  37.28 
 
 
275 aa  187  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0305191 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3860  hypothetical protein  36.03 
 
 
265 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0772  extracellular solute-binding protein  37.28 
 
 
238 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.025527 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3192  extracellular solute-binding protein  36.29 
 
 
265 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0961443  hitchhiker  0.0000817621 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3761  extracellular solute-binding protein  36.07 
 
 
265 aa  175  8e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3570  extracellular solute-binding protein family 3  35.66 
 
 
252 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3638  extracellular solute-binding protein  36.4 
 
 
265 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.055561  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0733  amino acid ABC transporter periplasmic protein  37.93 
 
 
255 aa  169  4e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.263143  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3523  extracellular solute-binding protein  32.14 
 
 
268 aa  168  7e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0687  extracellular solute-binding protein  33.48 
 
 
255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2978  extracellular solute-binding protein  31.3 
 
 
248 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2624  hypothetical protein  31.28 
 
 
271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.547677 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1683  hypothetical protein  29.58 
 
 
251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0424  hypothetical protein  34.8 
 
 
256 aa  123  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0921  extracellular solute-binding protein  26.91 
 
 
260 aa  121  9e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0619  hypothetical protein  27.42 
 
 
248 aa  116  3.9999999999999997e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.566502  normal  0.917839 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0629  extracellular solute-binding protein  28.91 
 
 
257 aa  105  6e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4251  amino acid ABC transporter periplasmic protein  27.57 
 
 
244 aa  104  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000526957 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1208  hypothetical protein  30.8 
 
 
258 aa  102  5e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000699317  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1595  extracellular solute-binding protein  29.68 
 
 
262 aa  101  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.614347  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3830  extracellular solute-binding protein  29.07 
 
 
248 aa  98.6  8e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000366277 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0350  extracellular solute-binding protein family 3  29.44 
 
 
321 aa  96.7  4e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0133156 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1477  extracellular solute-binding protein family 3  27.06 
 
 
254 aa  95.5  7e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2915  amino acid ABC transporter periplasmic protein  23.79 
 
 
247 aa  94.7  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67850  putative ABC-type amino acid transport protein, periplasmic component  26.99 
 
 
250 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.349677 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0258  extracellular solute-binding protein  28.81 
 
 
236 aa  93.2  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5873  hypothetical protein  26.11 
 
 
250 aa  92  8e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3893  amino acid ABC transporter periplasmic protein  28.7 
 
 
252 aa  90.1  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4250  amino acid ABC transporter periplasmic protein  25 
 
 
251 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190529 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4249  extracellular solute-binding protein  25.1 
 
 
251 aa  89  7e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00199527 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3188  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  27.7 
 
 
228 aa  89  8e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484393  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3305  extracellular solute-binding protein  24.39 
 
 
244 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4891  hypothetical protein  27.73 
 
 
251 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1009  hypothetical protein  25.99 
 
 
242 aa  84.7  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.815562  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2767  extracellular solute-binding protein family 3  25.89 
 
 
238 aa  84  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5333  hypothetical protein  27.6 
 
 
269 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0702  extracellular solute-binding protein  24.46 
 
 
244 aa  79.3  0.00000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0691872 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3031  extracellular solute-binding protein family 3  23.77 
 
 
237 aa  79.3  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.516858  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1916  extracellular solute-binding protein family 3  25 
 
 
483 aa  79  0.00000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67840  putative ABC-type amino acid transporter  23.79 
 
 
251 aa  79  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.288914 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5872  hypothetical protein  23.79 
 
 
251 aa  79  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1585  hypothetical protein  25 
 
 
248 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3879  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.28 
 
 
235 aa  77.4  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0328  hypothetical protein  23.89 
 
 
251 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.397197 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67860  putative ABC-type amino acid transporter  24.12 
 
 
248 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.339144 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1918  putative cache sensor protein  25.71 
 
 
632 aa  76.6  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.149363  normal  0.217415 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1919  amino acid ABC transporter periplasmic protein  25.33 
 
 
247 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0371115  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5874  hypothetical protein  24.12 
 
 
248 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2765  amino acid ABC transporter periplasmic protein  26.69 
 
 
401 aa  74.3  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0881  extracellular solute-binding protein  24.3 
 
 
269 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1844  extracellular solute-binding protein  25.63 
 
 
260 aa  66.6  0.0000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000362453  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1845  extracellular solute-binding protein  24.59 
 
 
262 aa  64.3  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00294253  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0247  extracellular solute-binding protein  26.87 
 
 
258 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000342463  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2027  amino acid ABC transporter periplasmic protein  21.6 
 
 
275 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.360228 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0421  extracellular solute-binding protein  22.64 
 
 
252 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1080  extracellular solute-binding protein  23.04 
 
 
241 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.950195  normal  0.541205 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0241  extracellular solute-binding protein  22.94 
 
 
275 aa  55.8  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0585  amino acid ABC transporter periplasmic protein  22.54 
 
 
274 aa  53.1  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3734  extracellular solute-binding protein  22.48 
 
 
247 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0743  extracellular solute-binding protein  23.72 
 
 
260 aa  51.6  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0260  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.14 
 
 
243 aa  49.7  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.906193  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0387  extracellular solute-binding protein family 3  23.51 
 
 
259 aa  49.7  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0965219 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3932  amino acid ABC transporter periplasmic protein  33.33 
 
 
262 aa  50.1  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1312  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.22 
 
 
584 aa  49.7  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0348  extracellular solute-binding protein  25.19 
 
 
264 aa  49.3  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3496  extracellular solute-binding protein  23.39 
 
 
258 aa  48.9  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0353  amino acid ABC transporter solute binding protein  25 
 
 
264 aa  47.4  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0336  amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  25 
 
 
264 aa  47.4  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.137288  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0339  amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  25 
 
 
264 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.140169  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0367  putative amino acid ABC transporter substrate-binding protein  25 
 
 
264 aa  47.4  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0402  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  25 
 
 
264 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0592  amino acid ABC transporter, permease/substrate-binding lipoprotein  25.89 
 
 
252 aa  47.8  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000143889  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0051  extracellular solute-binding protein family 3  22.33 
 
 
264 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6047  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  28.29 
 
 
598 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.166994  normal  0.759317 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0477  extracellular solute-binding protein  24.11 
 
 
246 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5282  extracellular solute-binding protein  23.29 
 
 
270 aa  47  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2081  diguanylate cyclase  29.03 
 
 
937 aa  47  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0379355  normal  0.0338945 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0416  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  23.66 
 
 
264 aa  47  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2115  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.07 
 
 
604 aa  47  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00123104  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4902  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  23.66 
 
 
264 aa  47  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1952  diguanylate cyclase  27.7 
 
 
937 aa  46.6  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.105215  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1070  extracellular solute-binding protein  20.18 
 
 
281 aa  46.2  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.703712 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1070  extracellular solute-binding protein  26.52 
 
 
272 aa  45.8  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000162274  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1888  GGDEF domain-containing protein  31.21 
 
 
930 aa  45.8  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000133848  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0486  extracellular solute-binding protein  21.76 
 
 
262 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1142  extracellular solute-binding protein  22.05 
 
 
292 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1142  extracellular solute-binding protein  25.97 
 
 
272 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000284369  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1074  extracellular solute-binding protein  25.97 
 
 
272 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2350  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter amino acid-binding protein/permease  23.25 
 
 
502 aa  43.9  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.140877  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2062  glutamine-binding periplasmic protein of glutamine ABC transporter  23.25 
 
 
502 aa  43.9  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>