124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_1054 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_1054  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 		 257 aa  533  1e-150  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0164866  hitchhiker  0.000017747 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3302  extracellular solute-binding protein  98.05 
 
 		 257 aa  525  1e-148  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3523  extracellular solute-binding protein, family 3  95.33 
 
 		 257 aa  509  1e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3398  extracellular solute-binding protein  94.55 
 
 		 257 aa  502  1e-141  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2937  hypothetical protein  84.25 
 
 		 257 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1143  hypothetical protein  77.34 
 
 		 255 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0969  extracellular solute-binding protein  80.58 
 
 		 255 aa  413  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1005  hypothetical protein  74.12 
 
 		 255 aa  402  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.69065  normal  0.921286 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0967  extracellular solute-binding protein  70.98 
 
 		 255 aa  390  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0746  extracellular solute-binding protein  37.28 
 
 		 275 aa  188  9e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0305191 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2990  extracellular solute-binding protein  37.65 
 
 		 263 aa  187  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.604366  normal  0.133749 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3860  hypothetical protein  35.8 
 
 		 265 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3192  extracellular solute-binding protein  35.1 
 
 		 265 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0961443  hitchhiker  0.0000817621 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0772  extracellular solute-binding protein  36.84 
 
 		 238 aa  179  4e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.025527 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3761  extracellular solute-binding protein  36.4 
 
 		 265 aa  179  4e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3638  extracellular solute-binding protein  35.6 
 
 		 265 aa  175  6e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.055561  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3570  extracellular solute-binding protein family 3  36.4 
 
 		 252 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3523  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 268 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2978  extracellular solute-binding protein  31.71 
 
 		 248 aa  168  7e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0733  amino acid ABC transporter periplasmic protein  36.84 
 
 		 255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.263143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0687  extracellular solute-binding protein  33.05 
 
 		 255 aa  161  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2624  hypothetical protein  33.94 
 
 		 271 aa  153  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.547677 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1683  hypothetical protein  30 
 
 		 251 aa  132  6e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0921  extracellular solute-binding protein  28.44 
 
 		 260 aa  121  9e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0424  hypothetical protein  33.47 
 
 		 256 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0619  hypothetical protein  26.61 
 
 		 248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.566502  normal  0.917839 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0629  extracellular solute-binding protein  28.64 
 
 		 257 aa  103  4e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1595  extracellular solute-binding protein  29.68 
 
 		 262 aa  102  6e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.614347  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4251  amino acid ABC transporter periplasmic protein  27.05 
 
 		 244 aa  101  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000526957 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67850  putative ABC-type amino acid transport protein, periplasmic component  27.43 
 
 		 250 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.349677 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1208  hypothetical protein  31.06 
 
 		 258 aa  98.2  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000699317  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5873  hypothetical protein  26.99 
 
 		 250 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1477  extracellular solute-binding protein family 3  27.57 
 
 		 254 aa  98.2  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0258  extracellular solute-binding protein  30.2 
 
 		 236 aa  96.3  4e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4250  amino acid ABC transporter periplasmic protein  26.22 
 
 		 251 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190529 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3188  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  28.64 
 
 		 228 aa  94.7  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484393  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2915  amino acid ABC transporter periplasmic protein  24.19 
 
 		 247 aa  94  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3830  extracellular solute-binding protein  29.25 
 
 		 248 aa  94  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000366277 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0350  extracellular solute-binding protein family 3  28.7 
 
 		 321 aa  93.6  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0133156 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4249  extracellular solute-binding protein  25.5 
 
 		 251 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199527 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3305  extracellular solute-binding protein  24.8 
 
 		 244 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3893  amino acid ABC transporter periplasmic protein  28.38 
 
 		 252 aa  89.7  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4891  hypothetical protein  28.57 
 
 		 251 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2767  extracellular solute-binding protein family 3  26.34 
 
 		 238 aa  86.3  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5333  hypothetical protein  28.05 
 
 		 269 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67840  putative ABC-type amino acid transporter  25.41 
 
 		 251 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.288914 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5872  hypothetical protein  25.41 
 
 		 251 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1009  hypothetical protein  25.99 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.815562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1916  extracellular solute-binding protein family 3  24.67 
 
 		 483 aa  82  0.000000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0702  extracellular solute-binding protein  24.17 
 
 		 244 aa  82  0.000000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0691872 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0328  hypothetical protein  24.34 
 
 		 251 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397197 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3031  extracellular solute-binding protein family 3  24.09 
 
 		 237 aa  81.6  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.516858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1918  putative cache sensor protein  26.19 
 
 		 632 aa  81.3  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.149363  normal  0.217415 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67860  putative ABC-type amino acid transporter  24.45 
 
 		 248 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.339144 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5874  hypothetical protein  24.45 
 
 		 248 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1585  hypothetical protein  25.54 
 
 		 248 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1919  amino acid ABC transporter periplasmic protein  25.76 
 
 		 247 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0371115  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3879  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.11 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0881  extracellular solute-binding protein  23.44 
 
 		 269 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2765  amino acid ABC transporter periplasmic protein  25.96 
 
 		 401 aa  72  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1844  extracellular solute-binding protein  24.66 
 
 		 260 aa  62.4  0.000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000362453  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1080  extracellular solute-binding protein  23.04 
 
 		 241 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.950195  normal  0.541205 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2027  amino acid ABC transporter periplasmic protein  21.31 
 
 		 275 aa  62  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.360228 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3734  extracellular solute-binding protein  23.5 
 
 		 247 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0247  extracellular solute-binding protein  25.99 
 
 		 258 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000342463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1845  extracellular solute-binding protein  23.36 
 
 		 262 aa  57.8  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00294253  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0585  amino acid ABC transporter periplasmic protein  23 
 
 		 274 aa  56.2  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0421  extracellular solute-binding protein  22.17 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0339  amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  25.79 
 
 		 264 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.140169  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0477  extracellular solute-binding protein  25.57 
 
 		 246 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3932  amino acid ABC transporter periplasmic protein  33.33 
 
 		 262 aa  52  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3412  extracellular solute-binding protein  23.63 
 
 		 296 aa  51.6  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3496  extracellular solute-binding protein  24.09 
 
 		 258 aa  52  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0241  extracellular solute-binding protein  23.83 
 
 		 275 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0743  extracellular solute-binding protein  21.92 
 
 		 260 aa  50.1  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1070  extracellular solute-binding protein  27.07 
 
 		 272 aa  48.9  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000162274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5282  extracellular solute-binding protein  22.31 
 
 		 270 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1142  extracellular solute-binding protein  22.84 
 
 		 292 aa  48.9  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0387  extracellular solute-binding protein family 3  23.51 
 
 		 259 aa  48.9  0.00008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0965219 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1176  extracellular solute-binding protein family 3  30.43 
 
 		 312 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.975063 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1142  extracellular solute-binding protein  26.52 
 
 		 272 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000284369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1213  extracellular solute-binding protein  22.84 
 
 		 292 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.354605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1074  extracellular solute-binding protein  26.52 
 
 		 272 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6047  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  28.95 
 
 		 598 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.166994  normal  0.759317 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0840  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein, putative  22.75 
 
 		 247 aa  47  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0730433  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0592  amino acid ABC transporter, permease/substrate-binding lipoprotein  23.77 
 
 		 252 aa  47  0.0003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000143889  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1070  extracellular solute-binding protein  20.52 
 
 		 281 aa  47  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.703712 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0260  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  23.18 
 
 		 243 aa  47  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.906193  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1143  extracellular solute-binding protein  22.03 
 
 		 291 aa  46.6  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00243654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2795  extracellular solute-binding protein  25.14 
 
 		 271 aa  46.6  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2062  glutamine-binding periplasmic protein of glutamine ABC transporter  23.45 
 
 		 502 aa  45.8  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0858  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  25.14 
 
 		 598 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0229896 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3355  extracellular solute-binding protein family 3  23.14 
 
 		 261 aa  45.4  0.0008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2350  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter amino acid-binding protein/permease  23.45 
 
 		 502 aa  45.8  0.0008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.140877  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1312  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.26 
 
 		 584 aa  45.4  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5383  amino acid ABC transporter permease  26.88 
 
 		 591 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0606283  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3146  extracellular solute-binding protein family 3  20.99 
 
 		 288 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5472  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  26.88 
 
 		 591 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.693793  normal  0.393619 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5759  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  26.88 
 
 		 591 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2115  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.62 
 
 		 604 aa  45.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00123104  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>