96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1208 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1208  hypothetical protein  100 
 
 		 258 aa  527  1e-149  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000699317  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0629  extracellular solute-binding protein  41.73 
 
 		 257 aa  202  5e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3830  extracellular solute-binding protein  44.07 
 
 		 248 aa  190  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000366277 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0424  hypothetical protein  39.91 
 
 		 256 aa  180  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1918  putative cache sensor protein  36.64 
 
 		 632 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.149363  normal  0.217415 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1916  extracellular solute-binding protein family 3  33.48 
 
 		 483 aa  145  5e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0350  extracellular solute-binding protein family 3  31.76 
 
 		 321 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0133156 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1595  extracellular solute-binding protein  34.27 
 
 		 262 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.614347  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2765  amino acid ABC transporter periplasmic protein  27.31 
 
 		 401 aa  108  8.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3398  extracellular solute-binding protein  30.8 
 
 		 257 aa  102  5e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0967  extracellular solute-binding protein  34 
 
 		 255 aa  102  6e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1005  hypothetical protein  34.17 
 
 		 255 aa  102  7e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.69065  normal  0.921286 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0969  extracellular solute-binding protein  31.6 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3302  extracellular solute-binding protein  31.49 
 
 		 257 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2937  hypothetical protein  29.41 
 
 		 257 aa  99.4  6e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1054  extracellular solute-binding protein family 3  31.06 
 
 		 257 aa  98.2  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0164866  hitchhiker  0.000017747 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3523  extracellular solute-binding protein, family 3  29.96 
 
 		 257 aa  97.8  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1143  hypothetical protein  30.87 
 
 		 255 aa  97.8  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67840  putative ABC-type amino acid transporter  30.83 
 
 		 251 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.288914 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5872  hypothetical protein  30.83 
 
 		 251 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4249  extracellular solute-binding protein  33.18 
 
 		 251 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199527 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0733  amino acid ABC transporter periplasmic protein  30.84 
 
 		 255 aa  94  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.263143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0746  extracellular solute-binding protein  28.51 
 
 		 275 aa  92.4  7e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0305191 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1477  extracellular solute-binding protein family 3  28.34 
 
 		 254 aa  92.4  7e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1844  extracellular solute-binding protein  27.95 
 
 		 260 aa  92.4  7e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000362453  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4891  hypothetical protein  30.45 
 
 		 251 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3570  extracellular solute-binding protein family 3  30.7 
 
 		 252 aa  92  8e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5333  hypothetical protein  30.23 
 
 		 269 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3761  extracellular solute-binding protein  30.7 
 
 		 265 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3192  extracellular solute-binding protein  27.92 
 
 		 265 aa  90.5  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0961443  hitchhiker  0.0000817621 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3638  extracellular solute-binding protein  30.23 
 
 		 265 aa  89  7e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.055561  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0772  extracellular solute-binding protein  29.63 
 
 		 238 aa  89  8e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.025527 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1845  extracellular solute-binding protein  26.61 
 
 		 262 aa  87.4  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00294253  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4250  amino acid ABC transporter periplasmic protein  27.64 
 
 		 251 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190529 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4251  amino acid ABC transporter periplasmic protein  29.51 
 
 		 244 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000526957 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1009  hypothetical protein  28.92 
 
 		 242 aa  86.3  4e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.815562  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3860  hypothetical protein  30.48 
 
 		 265 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67850  putative ABC-type amino acid transport protein, periplasmic component  31.19 
 
 		 250 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.349677 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67860  putative ABC-type amino acid transporter  28.96 
 
 		 248 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.339144 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0619  hypothetical protein  29.01 
 
 		 248 aa  82.8  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.566502  normal  0.917839 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5873  hypothetical protein  30.73 
 
 		 250 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5874  hypothetical protein  28.51 
 
 		 248 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0328  hypothetical protein  29.82 
 
 		 251 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397197 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0687  extracellular solute-binding protein  27.31 
 
 		 255 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3893  amino acid ABC transporter periplasmic protein  29.83 
 
 		 252 aa  79.3  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2915  amino acid ABC transporter periplasmic protein  27.78 
 
 		 247 aa  78.6  0.00000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3188  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  24.88 
 
 		 228 aa  78.2  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484393  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3840  putative lipoprotein  27.59 
 
 		 255 aa  73.9  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0421756  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2990  extracellular solute-binding protein  27.23 
 
 		 263 aa  72  0.000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.604366  normal  0.133749 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2978  extracellular solute-binding protein  28.5 
 
 		 248 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3523  extracellular solute-binding protein  26.43 
 
 		 268 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2767  extracellular solute-binding protein family 3  27.95 
 
 		 238 aa  69.3  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3031  extracellular solute-binding protein family 3  25.24 
 
 		 237 aa  68.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.516858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0258  extracellular solute-binding protein  24.9 
 
 		 236 aa  68.6  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0881  extracellular solute-binding protein  23.73 
 
 		 269 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1683  hypothetical protein  25.2 
 
 		 251 aa  62.8  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3879  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.12 
 
 		 235 aa  57  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2027  amino acid ABC transporter periplasmic protein  23.72 
 
 		 275 aa  57  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.360228 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3305  extracellular solute-binding protein  23.32 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1645  metal dependent phosphohydrolase  23.61 
 
 		 615 aa  52.8  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2548  extracellular solute-binding protein  28.43 
 
 		 249 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.163495  normal  0.139391 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0186  extracellular solute-binding protein  25.94 
 
 		 251 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0585  amino acid ABC transporter periplasmic protein  22.55 
 
 		 274 aa  50.8  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1312  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.82 
 
 		 584 aa  50.1  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2624  hypothetical protein  26.79 
 
 		 271 aa  50.1  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.547677 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1579  metal dependent phosphohydrolase  25.11 
 
 		 618 aa  50.1  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2081  diguanylate cyclase  27.92 
 
 		 937 aa  49.7  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0379355  normal  0.0338945 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0589  extracellular solute-binding protein family 3  23.42 
 
 		 247 aa  49.7  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0251025  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0226  metal dependent phosphohydrolase  25.28 
 
 		 770 aa  47.8  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0241  extracellular solute-binding protein  23.73 
 
 		 275 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1952  diguanylate cyclase  29.77 
 
 		 937 aa  46.2  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.105215  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1585  hypothetical protein  21.86 
 
 		 248 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0387  extracellular solute-binding protein family 3  28.07 
 
 		 259 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0965219 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3734  extracellular solute-binding protein  23.93 
 
 		 247 aa  44.7  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2074  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  23.85 
 
 		 912 aa  45.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.136005  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0702  extracellular solute-binding protein  28.92 
 
 		 244 aa  43.9  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0691872 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0417  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  24.39 
 
 		 1247 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0921  extracellular solute-binding protein  20.94 
 
 		 260 aa  43.9  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2434  extracellular solute-binding protein  27.39 
 
 		 937 aa  43.9  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0585  hypothetical protein  23.56 
 
 		 693 aa  43.1  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0321937  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  26.26 
 
 		 246 aa  43.1  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2257  extracellular solute-binding protein  23.94 
 
 		 266 aa  42.7  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1498  extracellular solute-binding protein  23.67 
 
 		 247 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6331  extracellular solute-binding protein  23.67 
 
 		 268 aa  42.7  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.483344  normal  0.916228 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6600  extracellular solute-binding protein  26.32 
 
 		 265 aa  42.7  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1070  extracellular solute-binding protein  29.13 
 
 		 281 aa  42.7  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.703712 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6996  extracellular solute-binding protein  23.67 
 
 		 268 aa  42.4  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0898754 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0251  cystine transporter subunit  25.12 
 
 		 264 aa  42.4  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0386  sensory box protein  22.84 
 
 		 1247 aa  42.4  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.298787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2039  diguanylate cyclase with extracellular sensor  28.69 
 
 		 912 aa  42.4  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0269682  hitchhiker  0.000000244551 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1897  diguanylate cyclase  27.27 
 
 		 937 aa  42.4  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0415273 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3691  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  24.47 
 
 		 267 aa  42  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.634474 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1919  amino acid ABC transporter periplasmic protein  28.81 
 
 		 247 aa  42  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0371115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1101  extracellular solute-binding protein family 3  20.51 
 
 		 295 aa  42  0.01  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0196876 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0931  extracellular solute-binding protein family 3  24.47 
 
 		 267 aa  42  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0495  TcmP  22.32 
 
 		 255 aa  42  0.01  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>