More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0387 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0387  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 		 259 aa  533  1e-151  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0965219 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0247  extracellular solute-binding protein  58.33 
 
 		 258 aa  307  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000342463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5282  extracellular solute-binding protein  28.4 
 
 		 270 aa  104  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0486  extracellular solute-binding protein  29.86 
 
 		 262 aa  99  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0421  extracellular solute-binding protein  27.81 
 
 		 252 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0260  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.78 
 
 		 243 aa  92.4  7e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.906193  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4852  extracellular solute-binding protein  28.98 
 
 		 262 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157097  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4979  periplasmic binding protein, putative  28.41 
 
 		 262 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1461  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 251 aa  87  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.617285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5028  extracellular solute-binding protein  26.97 
 
 		 262 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1419  hypothetical protein  29.41 
 
 		 268 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1185  extracellular solute-binding protein family 3  24.68 
 
 		 257 aa  84  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.148046 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0594  hypothetical protein  30.11 
 
 		 245 aa  82  0.000000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.744113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3857  hypothetical protein  26.19 
 
 		 255 aa  80.9  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.999205 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2584  hypothetical protein  25.1 
 
 		 257 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.685098  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1339  extracellular solute-binding protein  22.67 
 
 		 253 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1329  extracellular solute-binding protein  24 
 
 		 253 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1101  extracellular solute-binding protein family 3  24.57 
 
 		 295 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0196876 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3019  extracellular solute-binding protein family 3  23.2 
 
 		 253 aa  75.5  0.0000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.683657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1011  hypothetical protein  26.27 
 
 		 248 aa  75.5  0.0000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0823  extracellular solute-binding protein  27.03 
 
 		 270 aa  74.7  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.457883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1240  extracellular solute-binding protein  25.82 
 
 		 275 aa  74.3  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0051  extracellular solute-binding protein family 3  27 
 
 		 264 aa  73.9  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05910  putative periplasmic transport system  27.27 
 
 		 243 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.760752 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1365  extracellular solute-binding protein  23.2 
 
 		 322 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.975535 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2573  extracellular solute-binding protein  28.96 
 
 		 280 aa  72  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000612077  hitchhiker  0.000188073 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3266  putative PAS/PAC sensor protein  24.75 
 
 		 830 aa  72  0.000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0301  extracellular solute-binding protein family 3  23.91 
 
 		 288 aa  71.6  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.133658 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0556  amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  26.82 
 
 		 253 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1009  hypothetical protein  28.22 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.815562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2109  extracellular solute-binding protein  22.99 
 
 		 262 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.467134 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0527  hypothetical protein  24.27 
 
 		 261 aa  69.3  0.00000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3734  extracellular solute-binding protein  27.88 
 
 		 247 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2960  extracellular solute-binding protein  27.73 
 
 		 262 aa  68.6  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.374689  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1200  hypothetical protein  25 
 
 		 274 aa  68.2  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.285337  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2873  hypothetical protein  23.5 
 
 		 267 aa  68.2  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0466901  normal  0.646305 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2376  cystine transporter subunit  24.77 
 
 		 266 aa  68.6  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2031  cystine transporter subunit  24.77 
 
 		 266 aa  68.6  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2274  cystine transporter subunit  24.77 
 
 		 266 aa  68.6  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2187  hypothetical protein  28 
 
 		 275 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2079  extracellular solute-binding protein  25.88 
 
 		 262 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2704  extracellular solute-binding protein  25.67 
 
 		 277 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.379205  normal  0.0872615 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3985  hypothetical protein  25.77 
 
 		 262 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.817581 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2131  extracellular solute-binding protein  23.5 
 
 		 265 aa  66.6  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0499  extracellular solute-binding protein  26.11 
 
 		 457 aa  66.6  0.0000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0743  extracellular solute-binding protein  24.54 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1653  amino acid ABC transporter periplasmic protein  25.7 
 
 		 273 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1256  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  22.79 
 
 		 253 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1997  hypothetical protein  24.77 
 
 		 275 aa  65.5  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.321301  normal  0.0820439 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2350  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter amino acid-binding protein/permease  23.58 
 
 		 502 aa  65.5  0.0000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.140877  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2062  glutamine-binding periplasmic protein of glutamine ABC transporter  23.58 
 
 		 502 aa  65.5  0.0000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3524  extracellular solute-binding protein  25.59 
 
 		 260 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0589  extracellular solute-binding protein family 3  26.78 
 
 		 247 aa  65.1  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0251025  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3624  hypothetical protein  22.04 
 
 		 262 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.78712  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4200  hypothetical protein  25.7 
 
 		 273 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4115  extracellular solute-binding protein  24.77 
 
 		 267 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147352 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2837  extracellular solute-binding protein  22.34 
 
 		 271 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.117714  normal  0.871916 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3146  extracellular solute-binding protein family 3  26.34 
 
 		 288 aa  63.9  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2292  extracellular solute-binding protein  23.12 
 
 		 262 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4637  extracellular solute-binding protein family 3  26.8 
 
 		 275 aa  63.9  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3772  hypothetical protein  24.3 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.454826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 250 aa  63.5  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0719  hypothetical protein  27.56 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0507397  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2571  extracellular solute-binding protein  26.29 
 
 		 269 aa  63.2  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0744474  hitchhiker  0.0010566 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1151  hypothetical protein  24.32 
 
 		 264 aa  62.8  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000453875  normal  0.246745 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0459  amino acid ABC transporter periplasmic protein  23.53 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2470  solute-binding family 1 protein  23.81 
 
 		 245 aa  62.4  0.000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.162983  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1085  hypothetical protein  24.32 
 
 		 264 aa  62.4  0.000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0391886  normal  0.830979 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3312  hypothetical protein  23.53 
 
 		 264 aa  62  0.000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000132852  normal  0.0735869 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3169  hypothetical protein  23.53 
 
 		 264 aa  62  0.000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000178583  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1202  extracellular solute-binding protein family 3  23.53 
 
 		 264 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000133475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1549  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.2 
 
 		 266 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.356902  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0411  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] N-acetylglucosamine deacetylase  25.79 
 
 		 238 aa  61.6  0.00000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3168  hypothetical protein  23.53 
 
 		 264 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000679304  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2337  extracellular solute-binding protein  23.23 
 
 		 258 aa  61.6  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.329158  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3293  amino acid ABC transporter periplasmic protein  24.37 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000280664 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11740  hypothetical protein  29.33 
 
 		 297 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.22588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1869  extracellular solute-binding protein family 3  24.45 
 
 		 272 aa  61.6  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000802311  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0056  transporter, putative  20.9 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.88 
 
 		 1165 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3091  ABC transporter, substrate binding component  24.2 
 
 		 266 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0802  hypothetical protein  22.69 
 
 		 285 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3056  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  24.2 
 
 		 320 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.114315  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0820  extracellular solute-binding protein  23.89 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2309  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.61 
 
 		 1055 aa  60.8  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1179  extracellular solute-binding protein family 3  22.61 
 
 		 385 aa  60.5  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1423  putative polar amino acid transport system substrate-binding proetin  24.4 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0156729  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1345  CjaC  22.1 
 
 		 259 aa  60.5  0.00000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.000213382  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3003  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  24.2 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0477  extracellular solute-binding protein  23.92 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0537  hypothetical protein  24.34 
 
 		 263 aa  59.7  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1759  histidine kinase  27.47 
 
 		 596 aa  59.7  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.37697  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1802  extracellular solute-binding protein  27.88 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.202097  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1070  extracellular solute-binding protein  23.32 
 
 		 272 aa  59.3  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000162274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1074  extracellular solute-binding protein  23.32 
 
 		 272 aa  58.9  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2936  cystine transporter subunit  22.52 
 
 		 265 aa  58.9  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1142  extracellular solute-binding protein  23.32 
 
 		 272 aa  58.9  0.00000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000284369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1047  extracellular solute-binding protein  31.25 
 
 		 256 aa  58.5  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.519655  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1071  extracellular solute-binding protein  24.12 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2540  extracellular solute-binding protein  21.1 
 
 		 265 aa  58.5  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>