More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1953 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1953  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 382 aa  764    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4526  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  70.11 
 
 		 381 aa  535  1e-151  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.315667 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4986  signal transduction histidine kinase  70.11 
 
 		 381 aa  533  1e-150  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5039  signal transduction histidine kinase  71.16 
 
 		 381 aa  534  1e-150  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1534  signal transduction histidine kinase  64.87 
 
 		 414 aa  474  1e-133  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.076798 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3728  signal transduction histidine kinase  52.49 
 
 		 406 aa  379  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.979777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0515  signal transduction histidine kinase  52.21 
 
 		 416 aa  372  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.498763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2288  signal transduction histidine kinase  53.85 
 
 		 400 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.184339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0327  histidine kinase, dimerisation/phosphoacceptor  50.9 
 
 		 400 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0659976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0498  signal transduction histidine kinase  49.61 
 
 		 420 aa  353  2e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.335667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3529  signal transduction histidine kinase  49.33 
 
 		 405 aa  347  3e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.170223 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4408  signal transduction histidine kinase  50.78 
 
 		 408 aa  332  7.000000000000001e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.488817 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2279  signal transduction histidine kinase  46.32 
 
 		 392 aa  281  2e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0130228 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0324  signal transduction histidine kinase  45.97 
 
 		 398 aa  279  5e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.732156  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1628  Signal transduction histidine kinase  43.95 
 
 		 431 aa  273  3e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0693  Signal transduction histidine kinase  35.09 
 
 		 400 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5893  signal transduction histidine kinase  47.06 
 
 		 465 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6649  signal transduction histidine kinase  54 
 
 		 739 aa  187  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4766  signal transduction histidine kinase  43.66 
 
 		 461 aa  179  7e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134291  normal  0.334258 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  37.67 
 
 		 744 aa  155  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  42.29 
 
 		 488 aa  155  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  37.67 
 
 		 1654 aa  153  5.9999999999999996e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2857  signal transduction histidine kinase  42.41 
 
 		 515 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.207944  normal  0.114386 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  37.31 
 
 		 771 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 		 1093 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  36.73 
 
 		 783 aa  147  3e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  40.55 
 
 		 382 aa  146  7.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  40.5 
 
 		 1676 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 		 771 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 		 1714 aa  143  5e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  36.82 
 
 		 1239 aa  143  5e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  33.95 
 
 		 1093 aa  143  5e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  40.76 
 
 		 551 aa  142  9e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 		 732 aa  142  9e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 681 aa  141  9.999999999999999e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  39.72 
 
 		 1390 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  38.5 
 
 		 526 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  31.53 
 
 		 1668 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  36.4 
 
 		 839 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  36.23 
 
 		 3706 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 		 767 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  34.56 
 
 		 215 aa  140  3e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 		 991 aa  139  6e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  38.81 
 
 		 439 aa  139  7.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 		 572 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 815 aa  138  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  34.95 
 
 		 1560 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 1253 aa  137  2e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4331  signal transduction histidine kinase  41.33 
 
 		 545 aa  137  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.364366 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4852  signal transduction histidine kinase  35.1 
 
 		 746 aa  136  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0325493 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  37.68 
 
 		 613 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  32.22 
 
 		 2693 aa  136  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  30.82 
 
 		 1663 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 		 941 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0366  GAF sensor hybrid histidine kinase  27.25 
 
 		 618 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.425505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5358  signal transduction histidine kinase  39.42 
 
 		 348 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2784  signal transduction histidine kinase  37.76 
 
 		 354 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3525  signal transduction histidine kinase  38.5 
 
 		 603 aa  134  3e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  35.24 
 
 		 964 aa  134  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  39.39 
 
 		 547 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4873  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  39 
 
 		 348 aa  133  6e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  33.07 
 
 		 872 aa  133  6e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0970  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.71 
 
 		 729 aa  132  7.999999999999999e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  35.68 
 
 		 878 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  40.83 
 
 		 980 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 		 909 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4308  signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 		 739 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.057717 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6718  signal transduction histidine kinase  41.09 
 
 		 387 aa  129  6e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0742813  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0298  signal transduction histidine kinase  38.71 
 
 		 349 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228007  hitchhiker  0.00285782 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4695  signal transduction histidine kinase  41.15 
 
 		 364 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.910371  normal  0.12529 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  33.78 
 
 		 754 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5459  signal transduction histidine kinase  34.76 
 
 		 749 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.164522 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  36.61 
 
 		 674 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4219  signal transduction histidine kinase  40.81 
 
 		 362 aa  127  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5414  signal transduction histidine kinase  37.66 
 
 		 348 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 913 aa  126  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2408  signal transduction histidine kinase  28.53 
 
 		 472 aa  127  5e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4553  signal transduction histidine kinase  40.87 
 
 		 351 aa  126  6e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.486913 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4182  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  40.87 
 
 		 338 aa  126  6e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4851  signal transduction histidine kinase  35.58 
 
 		 752 aa  126  8.000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0114486 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 		 834 aa  125  8.000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2192  signal transduction histidine kinase  37.78 
 
 		 362 aa  126  8.000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5678  signal transduction histidine kinase  35.18 
 
 		 747 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  36.68 
 
 		 945 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2710  signal transduction histidine kinase  39.06 
 
 		 363 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.304131  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1756  Signal transduction histidine kinase  35.4 
 
 		 362 aa  125  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38054  normal  0.143124 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 		 1177 aa  125  1e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3192  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.93 
 
 		 864 aa  125  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0309229 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 		 1183 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  35.15 
 
 		 932 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3723  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 		 871 aa  124  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.086011 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  29.25 
 
 		 682 aa  124  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2428  signal transduction histidine kinase  36.94 
 
 		 360 aa  124  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.391955  decreased coverage  0.00462713 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  31.53 
 
 		 347 aa  123  5e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3460  signal transduction histidine kinase  35.65 
 
 		 813 aa  123  6e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.292026  normal  0.144627 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2629  signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 		 788 aa  123  6e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0589  signal transduction histidine kinase  40.85 
 
 		 550 aa  123  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0760576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  35.65 
 
 		 1246 aa  123  7e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3812  signal transduction histidine kinase  41.79 
 
 		 334 aa  123  7e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.255567  normal  0.052898 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4326  signal transduction histidine kinase  35.2 
 
 		 782 aa  122  8e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.173856 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>