More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1447 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_0838  acriflavin resistance protein  35.43 
 
 		 1063 aa  647    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.64825  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1975  acriflavin resistance protein  49.52 
 
 		 1062 aa  1025    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.240252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3648  acriflavin resistance protein  35.43 
 
 		 1063 aa  647    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3529  acriflavin resistance protein  35.43 
 
 		 1063 aa  650    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3454  acriflavin resistance protein  35.43 
 
 		 1063 aa  647    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3597  acriflavin resistance protein  50.62 
 
 		 1068 aa  1060    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.335598  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0885  acriflavin resistance protein  35.12 
 
 		 1063 aa  642    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0788  acriflavin resistance protein  35.14 
 
 		 1067 aa  637    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3235  acriflavin resistance protein  35.14 
 
 		 1067 aa  640    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.890283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3677  acriflavin resistance protein  49.43 
 
 		 1053 aa  1020    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1447  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1066 aa  2165    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.387723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3338  acriflavin resistance protein  35.33 
 
 		 1067 aa  640    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0945  AcrB/AcrD/AcrF family protein  34.22 
 
 		 1067 aa  635  1e-180  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0800  acriflavin resistance protein  35.05 
 
 		 1048 aa  633  1e-180  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01000  RND family efflux transporter  35.39 
 
 		 1044 aa  634  1e-180  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.703446  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0658  acriflavin resistance protein  35.71 
 
 		 1050 aa  634  1e-180  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2469  acriflavin resistance protein  34.94 
 
 		 1073 aa  632  1e-179  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.969761  normal  0.0970954 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0888  acriflavin resistance protein  35.19 
 
 		 1055 aa  632  1e-179  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.869514 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2166  acriflavin resistance protein  35.29 
 
 		 1060 aa  630  1e-179  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0890  acriflavin resistance protein  34.79 
 
 		 1053 aa  620  1e-176  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1710  acriflavin resistance protein  35.07 
 
 		 1060 aa  619  1e-175  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0432348  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0765  acriflavin resistance protein  35.06 
 
 		 1049 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.114262 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4648  AcrB/AcrD/AcrF family protein  36.43 
 
 		 1041 aa  610  1e-173  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.84833  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2744  AcrB/AcrD/AcrF family protein  34.64 
 
 		 1067 aa  610  1e-173  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2177  acriflavin resistance protein  34.15 
 
 		 1057 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.754609  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1929  acriflavin resistance protein  34.78 
 
 		 1061 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.323076  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4483  AcrB/AcrD/AcrF family protein  35.34 
 
 		 1074 aa  600  1e-170  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2011  acriflavin resistance protein  33.99 
 
 		 1060 aa  591  1e-167  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0404797 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2269  RND family efflux transporter  33.96 
 
 		 1039 aa  576  1.0000000000000001e-163  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3095  AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.11 
 
 		 1093 aa  549  1e-154  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.396369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1895  acriflavin resistance protein  33.37 
 
 		 1051 aa  545  1e-153  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.691491  normal  0.309208 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0669  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  33.14 
 
 		 1052 aa  540  9.999999999999999e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000668  RND multidrug efflux transporter  31.58 
 
 		 1050 aa  539  1e-151  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.644957  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06545  hypothetical protein  31.18 
 
 		 1052 aa  530  1e-149  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02660  putative multidrug resistance protein, AcrB/AcrD/AcrF family  31.69 
 
 		 1056 aa  527  1e-148  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.814389  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2378  acriflavin resistance protein  34.66 
 
 		 1038 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0403  acriflavin resistance protein  32.03 
 
 		 1069 aa  519  1.0000000000000001e-145  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6348  acriflavin resistance protein  32.02 
 
 		 1121 aa  514  1e-144  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2362  acriflavin resistance protein  31.67 
 
 		 1032 aa  505  1e-141  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000980319  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3934  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  31.94 
 
 		 1042 aa  501  1e-140  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3036  efflux transporter  31.24 
 
 		 1075 aa  496  9.999999999999999e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.199533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0709  RND family efflux transporter  30.44 
 
 		 1048 aa  487  1e-136  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0718585  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01595  RND family efflux transporter  30.46 
 
 		 1071 aa  474  1e-132  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4864  acriflavin resistance protein  31.21 
 
 		 1034 aa  475  1e-132  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.120441 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0813  acriflavin resistance protein  28.85 
 
 		 1053 aa  470  1.0000000000000001e-131  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2447  RND family efflux transporter  29.04 
 
 		 1053 aa  471  1.0000000000000001e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0926263  normal  0.198336 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1635  acriflavin resistance protein  28.53 
 
 		 1054 aa  469  9.999999999999999e-131  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.346585 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1848  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.89 
 
 		 1054 aa  452  1e-125  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1637  acriflavin resistance protein  28.92 
 
 		 1048 aa  452  1e-125  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000116339  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1210  acriflavin resistance protein  28.22 
 
 		 1074 aa  452  1e-125  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154202  normal  0.271752 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0308  acriflavin resistance protein  30.83 
 
 		 1050 aa  451  1e-125  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.514616  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0258  acriflavin resistance protein  29.14 
 
 		 1040 aa  449  1e-125  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.359322  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1568  acriflavin resistance protein  30.69 
 
 		 1043 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.888167  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0475  acriflavin resistance protein  30.13 
 
 		 1072 aa  449  1.0000000000000001e-124  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.505165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3901  acriflavin resistance protein  29.49 
 
 		 1041 aa  441  9.999999999999999e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.406058 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3188  acriflavin resistance protein  28.08 
 
 		 1033 aa  436  1e-121  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.53306  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2384  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.81 
 
 		 1060 aa  432  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668736  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0243  acriflavin resistance protein  29.64 
 
 		 1054 aa  431  1e-119  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0292102  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2936  acriflavin resistance protein  31.18 
 
 		 1053 aa  427  1e-118  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1733  acriflavin resistance protein  30.29 
 
 		 1064 aa  422  1e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00373856  normal  0.683525 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1842  acriflavin resistance protein  28.45 
 
 		 1098 aa  414  1e-114  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3096  acriflavin resistance protein  27.41 
 
 		 1030 aa  400  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1563  acriflavin resistance protein  27.22 
 
 		 1041 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06541  hypothetical protein  28.2 
 
 		 1033 aa  401  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1756  acriflavin resistance protein  27.51 
 
 		 1041 aa  394  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3565  acriflavin resistance protein  27.66 
 
 		 1036 aa  392  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.909012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0108  acriflavin resistance protein  28.88 
 
 		 1033 aa  390  1e-107  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2915  acriflavin resistance protein  27.3 
 
 		 1035 aa  383  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.369342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0380  integral membrane protein, AcrB/AcrD/AcrF family  27.88 
 
 		 1034 aa  379  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1057  acriflavin resistance protein  26.06 
 
 		 1035 aa  352  3e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.828249  normal  0.914688 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2206  acriflavin resistance protein  25.75 
 
 		 1063 aa  347  7e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.577957  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3898  acriflavin resistance protein  26.24 
 
 		 1131 aa  331  5.0000000000000004e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.377402 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3066  acriflavin resistance protein  27.05 
 
 		 1137 aa  330  1.0000000000000001e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1066  acriflavin resistance protein  26.62 
 
 		 1035 aa  324  5e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0284295  hitchhiker  0.000200954 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3081  efflux transporter  27.25 
 
 		 1135 aa  318  5e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00863053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  26.45 
 
 		 1044 aa  291  4e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1882  AcrB/AcrD/AcrF family protein  24.3 
 
 		 1031 aa  276  2.0000000000000002e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0799  acriflavin resistance protein  24.17 
 
 		 1044 aa  271  5e-71  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.572707  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2427  acriflavin resistance protein  24.18 
 
 		 1031 aa  271  7e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000387519 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  23.64 
 
 		 1050 aa  269  2e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1983  acriflavin resistance protein  24.37 
 
 		 1034 aa  266  2e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000463224  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  23.74 
 
 		 1034 aa  265  2e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1215  acriflavin resistance protein  24.16 
 
 		 1092 aa  264  6e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.735499  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2180  acriflavin resistance protein  23.76 
 
 		 1030 aa  263  1e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000146343  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  23.6 
 
 		 1011 aa  263  2e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2409  acriflavin resistance protein  24.01 
 
 		 1031 aa  263  2e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.677885  normal  0.0307662 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2337  acriflavin resistance protein  23.91 
 
 		 1031 aa  262  3e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0120926  hitchhiker  0.000298899 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1852  acriflavin resistance protein  23.84 
 
 		 1042 aa  261  4e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0174296  hitchhiker  0.000605557 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1659  acriflavin resistance protein  23.91 
 
 		 1031 aa  261  4e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.178159  normal  0.998047 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  25.33 
 
 		 1044 aa  261  5.0000000000000005e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1145  acriflavin resistance protein  25.4 
 
 		 1191 aa  261  5.0000000000000005e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000258261  normal  0.148502 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  25.05 
 
 		 1043 aa  260  8e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2587  acriflavin resistance protein  24.21 
 
 		 1031 aa  259  3e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000412735  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1797  acriflavin resistance protein  24.11 
 
 		 1031 aa  257  8e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0223723  hitchhiker  0.000000350495 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2664  acriflavin resistance protein  24.02 
 
 		 1031 aa  256  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.192826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2549  acriflavin resistance protein  24.02 
 
 		 1031 aa  253  1e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0932297  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1924  AcrB/AcrD/AcrF family protein  24.7 
 
 		 1091 aa  253  1e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  24.04 
 
 		 1046 aa  253  2e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1705  acriflavin resistance protein  23.48 
 
 		 1031 aa  249  3e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0236776  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1905  AcrB/AcrD/AcrF family protein  23.34 
 
 		 1034 aa  248  4e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.209576  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>